Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07841
• Subject: XM_017316067.1
• Aligned Length: 2312
• Identities: 1832
• Gaps: 184

Alignment

Query    1  ATGGCGACGCCGGGAAGCGAACCCCAACCTTTCGTCCCGGCCCTTTCGGTAGCTACTCTGCACCC---ACTTCA  71
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||..||.||.||.||||||.|..|.||||||||   .||.||
Sbjct    1  ATGGCGACGCCGGGAAGCGAACCCCAAGCTTTCGCGCCCGCTCTCTCGGTAACCGCCCTGCACCCGCATCTCCA  74

Query   72  TCATCCCCACCACCACCACCACCACCATCAGCACCACGGAGGAACCGGCGCCCCCGGCGGGGCGGGTGGTGGCG  145
            .||.|.||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||.|.||                   
Sbjct   75  CCAGCACCACCAACACCACCAACACCACCAGCACCACGGAGGCACCGGCGGCACC-------------------  129

Query  146  GCGGTGGCAGCGGGGGCTTCAACCTGCCCTTGAACCGGGGTCTGGAGCGCGCGCTTGAGGAGGCGGCCAACTCC  219
                          |||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  130  --------------GGCTTCAACCTGCCCTTGAACCGTGGTTTGGAGCGCGCGCTGGAGGAGGCGGCCAACTCT  189

Query  220  GGGGGGCTGAACCTGAGCGCCAGGAAATTGAAGGAATTTCCCCGTACCGCAGCCCCCGGGCATGACCTCTCGGA  293
            |||||..|||||||||||||||||||..|||||||.||||||.|.||..|.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  190  GGGGGCTTGAACCTGAGCGCCAGGAAGCTGAAGGAGTTTCCCAGGACTACGGCCCCGGGACATGACCTCTCGGA  263

Query  294  CACGGTGCAGGCAGACTTATCTAAAAACAGACTGGTTGAAGTTCCAATGGAATTGTGCCATTTTGTATCACTGG  367
            ||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||
Sbjct  264  CACGGTTCGGGCAGATCTATCTAAAAACAGACTGGTGGAAGTGCCAATGGAGCTGTGCCAATTTGTATCACTGG  337

Query  368  AAATTCTTAATCTGTATCACAACTGTATCAGAGTCATTCCTGAGGCCATCGTTAATCTGCAGATGCTGACTTAC  441
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||..||
Sbjct  338  AAATTCTTAACCTGTATCACAACTGTATCAGAGTCATTCCTGAGGCCATTGTTAATTTGCAGATGTTGACCCAC  411

Query  442  CTGAACTTGAGTCGAAATCAGCTGTCCGCCCTGCCTGCCTGCCTGTGTGGTCTGCCTCTCAAAGTCTTAATCGC  515
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  CTAAACTTGAGTCGAAATCAGCTGTCTGCCCTGCCCGCCTGCCTGTGTGGTCTGCCTCTCAAAGTCTTAATCGC  485

Query  516  AAGTAACAACAAACTTGGATCATTACCAGAAGAGATAGGTCAGCTCAAACAGTTAATGGAGCTGGATGTCAGCT  589
            |||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|
Sbjct  486  AAGCAACAACAAGCTCGGATCACTGCCTGAAGAGATAGGTCAGCTCAAACAGTTAATGGAGTTGGATGTGAGTT  559

Query  590  GCAACGAGATCACAGCGTTGCCCCAGCAGATAGGTCAGTTGAAATCTCTACGAGAACTGAATGTCAGAAGAAAT  663
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||.||||||||
Sbjct  560  GCAACGAGATCACGGCCTTGCCCCAGCAGATAGGCCAGCTGAAGTCTCTGCGGGAACTCAATGTCCGAAGAAAT  633

Query  664  TACCTTAAAGTTTTACCACAAGAACTAGTAGATCTTCCCTTGGTAAAGTTTGACTTTTCCTGCAACAAAGTGCT  737
            ||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  634  TACCTTAAGGTTTTACCACCAGAGCTAGTAGATCTCCCCTTGGTAAAGTTTGACTTTTCCTGCAACAAGGTGCT  707

Query  738  CGTGATTCCAATTTGTTTTAGAGAGATGAAGCAGCTGCAAGTGTTACTACTTGAGAATAACCCTCTGCAGTCTC  811
            .|||||.||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  708  GGTGATCCCCGTCTGCTTCAGGGAGATGAAGCAGCTGCAGGTGCTCCTGCTTGAGAACAACCCTCTGCAGTCCC  781

Query  812  CTCCAGCACAGATTTGCACAAAGGGCAAAGTTCACATATTTAAGTATCTGAGCATACAAGCATGCCAGATTAAG  885
            ||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  CTCCGGCGCAGATTTGCACGAAAGGAAAAGTACACATATTTAAGTATTTGAGCATACAAGCATGCCAGATTAAG  855

Query  886  ACAGCTGACTCCCTTTATCTCCACACCATGGAGAGGCCACATTTACACCAGCACGTGGAAGATGGCAAGAAGGA  959
            |||..||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||
Sbjct  856  ACAAGTGACTCTCTTTACCTCCCCACCATAGAGAGGCCCCATTTACACCAACACGTGGAAGACAGTAAGAAGGA  929

Query  960  TTCTGATTCGGGAGTTGGAAGTGATAATGGAGATAAGCGATTATCTGCCACCGAGCCTTCTGACGAAGACACTG  1033
            .||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  930  CTCCGACTCAGGGGTTGGAAGTGACAATGGAGATAAGCGGTTATCTGCCACCGAGCCCTCTGATGAGGACACGG  1003

Query 1034  TTAGCCTCAATGTGCCAATGTCAAACATCATGGAAGAAGAACAGATCATCAAGGAGGACTCGTGCCATCGCCTT  1107
            ||||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||||.||||||||||||..||||||||||.||.
Sbjct 1004  TTAGCCTCAATGCGCCCATGTCAAACATCGTGGAAGAAGACCAGACCATCAAGGAGGATGCGTGCCATCGGCTC  1077

Query 1108  AGCCCCGTTAAAGGGGAATTTCATCAGGAATTTCAACCGGAGCCTTCCCTTTTGGGTGACAGCACCAACTCAGG  1181
            |.|||...||||||            .||||||||.|||.||||||||.|||||||.||||||..||.||||||
Sbjct 1078  ACCCCAACTAAAGG------------AGAATTTCAGCCGAAGCCTTCCATTTTGGGGGACAGCGGCATCTCAGG  1139

Query 1182  AGAAGAAAGAGACCAGTTTACTGATAGAGCAGATGGTCTCCATTCGGAATTTATGAACTA---TAAGG--CAAG  1250
            |.||||||||||.|||.||.|||...|.|||||||.||..||.||||.|.||||||||||   |||||  ||  
Sbjct 1140  ACAAGAAAGAGAGCAGCTTGCTGGCCGTGCAGATGCTCGACACTCGGGACTTATGAACTATATTAAGGACCA--  1211

Query 1251  GGCAGAAGACTGTGAAGAGCTGTTACGGATAGAAGAGGATGTGCACTGGCAAACTGAGGGCATAATAAGTTCAT  1324
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||..||||||||.|..||||...||.|||.|||||
Sbjct 1212  GGCAGAAGACTGTGAAGAGCTATTGCGGATAGAAGAGGATGCTCACTGGCACATGGAGGAACTACTAAATTCAT  1285

Query 1325  CCAAAGATCAGGACATGGATATAGCAATGATCGAGCAGCTGAGAGAAGCAGTAGATTTGCTGCAAGATCCCAAT  1398
            |||||||.|.|||..||||||||||.|||||.||||||||||||||.||   |||..||||.||.||||||||.
Sbjct 1286  CCAAAGACCGGGAGCTGGATATAGCGATGATTGAGCAGCTGAGAGAGGC---AGAGCTGCTTCAGGATCCCAAC  1356

Query 1399  GGATTAAGCACAGATATTACAGAGAGAAGTGTTTTAAACCTATATCCTATGGGATCAGCAGAAGCCTTAGAATT  1472
            ||..|||||.|||||||.|.||||||||||.||||.|||||.|..||.||||..||||.||||||||.||||||
Sbjct 1357  GGTCTAAGCGCAGATATCATAGAGAGAAGTATTTTGAACCTGTTCCCCATGGACTCAGGAGAAGCCTCAGAATT  1430

Query 1473  ACAAGATTCTGCACTGAATGGTCAAATACAGCTGGAGACATCTCCGGTGTGTGAGGTGCAAAGTGATCTAACAT  1546
            .|..|||.||.||||.|||||.||..|.|||||||||||.|||||.|...||||||||||||.||||||||..|
Sbjct 1431  CCCTGATCCTTCACTCAATGGCCAGTTGCAGCTGGAGACGTCTCCAGACCGTGAGGTGCAAAATGATCTAATGT  1504

Query 1547  TACAGAGTAACGGGAGCCAGTATTCTCCAAATGAGATTAGAGAGAACTCCCCTGCAGTCTCTCCTACCACAAAC  1620
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..||||||||||||||.||||.||||||||..|||||
Sbjct 1505  TACAGAGTAATGGAAGCCAGTATTCTCCCAATGAGATACGAGAGAACTCCCCTTCAGTGTCTCCTACTGCAAAC  1578

Query 1621  AGCACAGCTCCATTTGGCCTGAAGCCTCGATCAGACCCAGCCCTCATTCTTCCTCCTATCTCCTTCAACACACT  1694
            |.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1579  ATCACAGCTCCGTTTGGCCTGAAGCCTCGTTCAGACCCAGCCCTCATTCTCCCTCCTATCTCCTTCAACACACT  1652

Query 1695  TACACAGGCACAGACATGGGACAGCTCTAGCTACAGTGTTCCATCTGAAGGAGACAGTGACAATGTGTTTCTAA  1768
            ||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1653  TACACAGGCACAAACATGGGACAACTCTAGCTACAGTGTTCCATCTGAAGGAAACAGTGACAATGTGTTTCTAA  1726

Query 1769  GACCTCAGAGAAATTTGGAATCTATAGACCCGCAGTTTACAATCCGGAGGAAAATGGAGCAGATGAGAGAAGAG  1842
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1727  GACCGCAGAGAAACTTGGAATCTATAGACCCACAGTTTACGATCCGGAGGAAGATGGAGCAGATGAGAGAGGAG  1800

Query 1843  AAAGAGCTGGTGGAACAACTTCGTGAGAGCATTGAGATGAGATTGAAGGTCAGTCTACACGAAGACCTGGGGGC  1916
            ||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||..|||||||.|..||.||.||||||||||||||
Sbjct 1801  AAGGAGCTGGTGGAGCAACTCCGAGAGAGCATCGAGATGAGGCTGAAGGTGACCCTTCATGAAGACCTGGGGGC  1874

Query 1917  AGCCCTCATGGATGGTGTCGTCCTCTGCCATCTGGTCAACCACATCCGCCCACGGTCGGTTGCAAGCATCCATG  1990
            .||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||.||||.||..|.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1875  GGCACTCATGGATGGTGTCGTCCTCTGCCACCTGGCCAACCACGTCCGTCCGAGATCTGTCGCCAGCATCCATG  1948

Query 1991  TCCCATCACCAGCGGTTCCCAAACTTAGCATGGCCAAATGCAGAAGAAATGTGGAAAACTTTTTGGAAGCGTGC  2064
            ||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1949  TCCCCTCACCGGCTGTTCCTAAACTCAGCATGGCCAAGTGCAGGAGGAACGTGGAAAACTTCTTGGAAGCGTGC  2022

Query 2065  CGAAAATTAGGAGTACCAGAGGCTGACCTCTGCTCTCCGTGTGACATCCTGCAGTTGGATTTTCGTCACATTCG  2138
            .|.|||.|.||.||.||.||||...|.|||||               |||||         .||.||||||.| 
Sbjct 2023  AGGAAACTTGGCGTTCCCGAGGAAAAGCTCTG---------------CCTGC---------CTCATCACATCC-  2071

Query 2139  AAAGACTGTTGACACTCTGCTGGCACTCGGGGAGAAAGCCC-------------CACCACCAACTTCTGCCCTC  2199
                    ||||                  .|||||||.||             |||.|       |||     
Sbjct 2072  --------TTGA------------------AGAGAAAGGCCTGGTCAAAGTGGGCACGA-------CTG-----  2107

Query 2200  CGCTCCAGGGACCTTATAGGCTTCTGTCTTGTCCATATTCTCTTTATAGTGCTGGTCTATATCAC--TTACCAC  2271
               |.||||.||                                     ||.|||   ||.||||  |.||   
Sbjct 2108  ---TTCAGGCAC-------------------------------------TGTTGG---ATGTCACCGTCAC---  2135

Query 2272  TGGAATGCTCTGTCCGCA  2289
              .||.|||||.|.|.||
Sbjct 2136  --AAAAGCTCTATTCACA  2151