Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07846
• Subject: NM_001163453.1
• Aligned Length: 1337
• Identities: 1217
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQ  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVVNVLENLDSVLSENQ  74

Query   75  EHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQIS  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  EHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRKQAEEKFIEFEDALEQEKKELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQIS  148

Query  149  RLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGNSQTESSLPGR-RKERPTSLNVFPLADGTVRAQ  221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||| ||||||||||||||||     
Sbjct  149  RLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIERSKMQQVGGSGQTESSLPGRSRKERPTSLNVFPLADG-----  217

Query  222  IGGKLVPAGDHWHLSDLGQLQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPL  295
                                      .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  --------------------------MCPNDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPL  265

Query  296  GDYGVGSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLDRTGSSPTQG  369
            |||....||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct  266  GDYVSVTKNNKQAREKRNSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDVCPETRLERTGSSPTQG  339

Query  370  IVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKND  443
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  IVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFS------GMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKND  407

Query  444  LIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPM  517
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||.||||||||||.|||||
Sbjct  408  LIAKVDQLSGEQEVLKGELEAAKQAKVKLENRIKELEEELKRVKSEAVTARREPREEVEDVSSYLCTELDKIPM  481

Query  518  AQRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKR  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  AQRRRFTRVEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKR  555

Query  592  PYPSVNIHYKSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACG  665
            .||||||||||||.|||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  SYPSVNIHYKSPTAAGFSQRRSHALCQISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGRLQACG  629

Query  666  WSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAPGRDPLT  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|.|.|..||.||.|||||||
Sbjct  630  WSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPSTKLWCAAGVNLSGWKPHEEDSSNGPKPVPGRDPLT  703

Query  740  CDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSI  813
            |||||.|||||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  704  CDREGEGEPKSTHPSPEKKKAKETPEADATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTIVDQFTVCNAHVLCISSI  777

Query  814  PAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGADGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVN  887
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct  778  PAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDSGADGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGDVATTANGKVN  851

Query  888  PSQSTEEATEATEVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDPT  961
            |||||||||||||||||||||.|..|.|||||||||||||||||||..||.||||.|.......|..||||...
Sbjct  852  PSQSTEEATEATEVPDPGPSESEATTVRPGPLTEHVFTDPAPTPSSSTQPASENGSESNGTIVQPQVEPSGELS  925

Query  962  GAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS  1035
            ...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  TTTSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS  999

Query 1036  NYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDS  1109
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  NYHLMDLGHPHHSIRCMAVVNDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDS  1073

Query 1110  TLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLL  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  TLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLIAGNRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLL  1147

Query 1184  GLRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSV  1257
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  GLRANKTSPTSGEGTRPGGIIHVYGDDSSDKAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSV  1221

Query 1258  LDSPAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSKAERSHIIVWQV  1331
            ||||.|||||||||...|||||.|.||||||||||||||||||||||||.|||..|.||.||||||||||||||
Sbjct 1222  LDSPSEGPGPAAPAADAEGQKLKNALVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEECAGDVNQTKPSLSKAERSHIIVWQV  1295

Query 1332  SYTPE  1336
            |||||
Sbjct 1296  SYTPE  1300