Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07846
- Subject:
- XM_024450208.1
- Aligned Length:
- 4161
- Identities:
- 3979
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGATGGAGATCCAGATGGACGAGGGCGGCGGCGTGGTGGTGTACCAGGACGACTACTGCTCCGGCTCGGTGAT 74
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Sbjct 1 ATGATGGAGATCCAGATGGACGAGGGCGGCGGCGTGGTGGTGTACCAGGACGACTACTGCTCCGGCTCGGTGAT 74
Query 75 GTCGGAGCGGGTGTCGGGCCTGGCGGGCTCCATCTACCGCGAGTTCGAGCGCCTCATCCACTGCTACGACGAGG 148
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Sbjct 75 GTCGGAGCGGGTGTCGGGCCTGGCGGGCTCCATCTACCGCGAGTTCGAGCGCCTCATCCACTGCTACGACGAGG 148
Query 149 AGGTGGTCAAGGAGCTCATGCCGCTGGTGGTGAACGTGCTGGAGAACCTAGACTCGGTGCTCAGCGAGAACCAG 222
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Sbjct 149 AGGTGGTCAAGGAGCTCATGCCGCTGGTGGTGAACGTGCTGGAGAACCTAGACTCGGTGCTCAGCGAGAACCAG 222
Query 223 GAGCACGAGGTGGAGCTGGAGCTGCTGCGCGAGGACAACGAGCAGCTGCTCACCCAGTACGAGCGTGAGAAGGC 296
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Sbjct 223 GAGCACGAGGTGGAGCTGGAGCTGCTGCGCGAGGACAACGAGCAGCTGCTCACCCAGTACGAGCGTGAGAAGGC 296
Query 297 GCTGCGCAGGCAGGCGGAGGAGAAATTCATTGAGTTTGAAGATGCTCTGGAACAAGAGAAGAAAGAGCTGCAAA 370
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Sbjct 297 GCTGCGCAGGCAGGCGGAGGAGAAATTCATTGAGTTTGAAGATGCTCTGGAACAAGAGAAGAAAGAGCTGCAAA 370
Query 371 TCCAGGTGGAGCACTACGAGTTCCAGACGCGCCAGCTGGAGCTGAAGGCCAAGAACTATGCCGATCAGATTTCC 444
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Sbjct 371 TCCAGGTGGAGCACTACGAGTTCCAGACGCGCCAGCTGGAGCTGAAGGCCAAGAACTATGCCGATCAGATTTCC 444
Query 445 CGGTTGGAGGAGCGGGAGTCGGAGATGAAGAAGGAGTACAATGCCCTGCACCAGCGGCACACAGAGATGATACA 518
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Sbjct 445 CGGTTGGAGGAGCGGGAGTCGGAGATGAAGAAGGAGTACAATGCCCTGCACCAGCGGCACACAGAGATGATACA 518
Query 519 GACCTACGTGGAGCACATTGAGAGGTCCAAGATGCAGCAGGTCGGAGGAAACAGCCAGACCGAGAGCAGCCTGC 592
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Sbjct 519 GACCTACGTGGAGCACATTGAGAGGTCCAAGATGCAGCAGGTCGGAGGAAACAGCCAGACCGAGAGCAGCCTGC 592
Query 593 CGGGGCGG---AGGAAGGAGCGCCCCACCTCCCTGAACGTGTTCCCCCTGGCTGACGGCACGGTACGTGCACAG 663
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Sbjct 593 CGGGGCGGAGCAGGAAGGAGCGCCCCACCTCCCTGAACGTGTTCCCCCTGGCTGACGGCACGGTACGTGCACAG 666
Query 664 ATCGGGGGCAAGCTCGTGCCTGCGGGGGACCACTGGCACCTGAGTGACCTCGGCCAGCTGCAGTCCAGCTCCAG 737
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Sbjct 667 ATCGGGGGCAAGCTCGTGCCTGCGGGGGACCACTGGCACCTGAGTGACCTCGGCCAGCTGCAGTCCAGCTCCAG 740
Query 738 CTACCAGTGTCCACAGGATGAAATGTCCGAGTCAGGCCAGTCCTCGGCGGCCGCCACACCCAGCACCACAGGCA 811
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Sbjct 741 CTACCAGTGTCCACAGGATGAAATGTCCGAGTCAGGCCAGTCCTCGGCGGCCGCCACACCCAGCACCACAGGCA 814
Query 812 CCAAGTCCAACACGCCCACATCCTCCGTGCCCTCGGCCGCCGTCACACCCCTCAACGAGAGCCTGCAGCCCCTG 885
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Sbjct 815 CCAAGTCCAACACGCCCACATCCTCCGTGCCCTCGGCCGCCGTCACACCCCTCAACGAGAGCCTGCAGCCCCTG 888
Query 886 GGGGACTATGGCGTGGGCTCCAAGAACAGCAAGCGTGCCCGGGAGAAGCGCGACAGCCGCAACATGGAAGTACA 959
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Sbjct 889 GGGGACTATGGCGTGGGCTCCAAGAACAGCAAGCGTGCCCGGGAGAAGCGCGACAGCCGCAACATGGAAGTACA 962
Query 960 GGTCACCCAGGAGATGCGCAACGTCAGTATAGGCATGGGCAGCAGTGACGAGTGGTCTGATGTTCAAGACATTA 1033
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Sbjct 963 GGTCACCCAGGAGATGCGCAACGTCAGTATAGGCATGGGCAGCAGTGACGAGTGGTCTGATGTTCAAGACATTA 1036
Query 1034 TTGACTCCACGCCAGAGCTGGACATGTGTCCAGAGACCCGCCTGGACCGCACAGGAAGCAGCCCAACCCAGGGC 1107
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Sbjct 1037 TTGACTCCACGCCAGAGCTGGACATGTGTCCAGAGACCCGCCTGGACCGCACAGGAAGCAGCCCAACCCAGGGC 1110
Query 1108 ATCGTGAACAAAGCTTTCGGCATCAACACCGACTCCCTGTACCATGAGCTGTCGACGGCAGGGTCTGAGGTCAT 1181
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Sbjct 1111 ATCGTGAACAAAGCTTTCGGCATCAACACCGACTCCCTGTACCATGAGCTGTCGACGGCAGGGTCTGAGGTCAT 1184
Query 1182 CGGGGATGTGGACGAAGGGGCCGACCTCCTAGGGGAGTTCTCAGTGCGCGATGATTTCTTTGGAATGGGCAAAG 1255
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Sbjct 1185 CGGGGATGTGGACGAAGGGGCCGACCTCCTAGGGGAGTTCTCAGTGCGCGATGATTTCTTTGGAATGGGCAAAG 1258
Query 1256 AAGTGGGGAATCTGCTACTGGAAAACTCACAGCTTCTGGAAACCAAAAACGCCTTGAATGTGGTGAAGAATGAC 1329
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Sbjct 1259 AAGTGGGGAATCTGCTACTGGAAAACTCACAGCTTCTGGAAACCAAAAACGCCTTGAATGTGGTGAAGAATGAC 1332
Query 1330 CTGATTGCCAAGGTCGACCAGCTGTCCGGGGAGCAGGAGGTGCTGAGGGGCGAGTTGGAGGCTGCTAAGCAGGC 1403
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Sbjct 1333 CTGATTGCCAAGGTCGACCAGCTGTCCGGGGAGCAGGAGGTGCTGAGGGGCGAGTTGGAGGCTGCTAAGCAGGC 1406
Query 1404 CAAAGTCAAGCTGGAAAACCGTATCAAGGAGCTGGAAGAGGAACTGAAAAGAGTGAAGTCCGAGGCCATCATCG 1477
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Sbjct 1407 CAAAGTCAAGCTGGAAAACCGTATCAAGGAGCTGGAAGAGGAACTGAAAAGAGTGAAGTCCGAGGCCATCATCG 1480
Query 1478 CCCGCCGTGAACCCAAAGAAGAGGCGGAGGATGTAAGCAGCTATCTCTGTACAGAATCGGACAAAATCCCCATG 1551
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Sbjct 1481 CCCGCCGTGAACCCAAAGAAGAGGCGGAGGAT---------------------------GACAAAATCCCCATG 1527
Query 1552 GCCCAGCGCCGCCGCTTCACGCGGGTGGAGATGGCCCGTGTGCTCATGGAGCGGAACCAGTACAAGGAGCGGCT 1625
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Sbjct 1528 GCCCAGCGCCGCCGCTTCACGCGGGTGGAGATGGCCCGTGTGCTCATGGAGCGGAACCAGTACAAGGAGCGGCT 1601
Query 1626 GATGGAGCTGCAGGAGGCTGTGCGGTGGACTGAGATGATCAGAGCGTCCCGAGAGCACCCATCCGTCCAGGAGA 1699
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Sbjct 1602 GATGGAGCTGCAGGAGGCTGTGCGGTGGACTGAGATGATCAGAGCGTCCCGAGAGCACCCATCCGTCCAGGAGA 1675
Query 1700 AGAAGAAGTCGACCATCTGGCAGTTCTTCAGCCGCCTCTTCAGCTCTTCCTCCAGCCCCCCTCCGGCCAAGCGC 1773
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Sbjct 1676 AGAAGAAGTCGACCATCTGGCAGTTCTTCAGCCGCCTCTTCAGCTCTTCCTCCAGCCCCCCTCCGGCCAAGCGC 1749
Query 1774 CCCTATCCCTCGGTGAACATCCACTACAAGTCACCCACCACTGCCGGCTTCAGCCAGCGCCGCAACCATGCCAT 1847
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Sbjct 1750 CCCTATCCCTCGGTGAACATCCACTACAAGTCACCCACCACTGCCGGCTTCAGCCAGCGCCGCAACCATGCCAT 1823
Query 1848 GTGCCCGATCTCGGCAGGCAGCCGGCCCCTGGAATTCTTCCCTGACGACGACTGCACGTCCTCCGCCCGTCGAG 1921
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Sbjct 1824 GTGCCCGATCTCGGCAGGCAGCCGGCCCCTGGAATTCTTCCCTGACGACGACTGCACGTCCTCCGCCCGTCGAG 1897
Query 1922 AGCAGAAGCGCGAGCAGTACCGCCAGGTGCGTGAGCACGTGCGTAACGACGACGGCCGTCTGCAGGCCTGCGGC 1995
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Sbjct 1898 AGCAGAAGCGCGAGCAGTACCGCCAGGTGCGTGAGCACGTGCGTAACGACGACGGCCGTCTGCAGGCCTGCGGC 1971
Query 1996 TGGAGCCTGCCCGCCAAGTACAAGCAGCTGAGTCCCAACGGGGGCCAGGAGGACACGCGGATGAAGAACGTGCC 2069
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Sbjct 1972 TGGAGCCTGCCCGCCAAGTACAAGCAGCTGAGTCCCAACGGGGGCCAGGAGGACACGCGGATGAAGAACGTGCC 2045
Query 2070 GGTGCCGGTGTACTGCCGCCCTCTGGTGGAGAAGGACCCCACCATGAAGCTGTGGTGTGCCGCGGGCGTCAACC 2143
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Sbjct 2046 GGTGCCGGTGTACTGCCGCCCTCTGGTGGAGAAGGACCCCACCATGAAGCTGTGGTGTGCCGCGGGCGTCAACC 2119
Query 2144 TGAGCGGGTGGAGGCCCAATGAGGACGACGCTGGGAATGGAGTCAAGCCAGCGCCAGGCCGCGATCCCCTGACC 2217
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Sbjct 2120 TGAGCGGGTGGAGGCCCAATGAGGACGACGCTGGGAATGGAGTCAAGCCAGCGCCAGGCCGCGATCCCCTGACC 2193
Query 2218 TGCGACCGAGAAGGAGACGGCGAGCCCAAGAGCGCCCACACGTCTCCCGAGAAGAAGAAGGCCAAGGAGCTCCC 2291
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Sbjct 2194 TGCGACCGCGAAGGAGACGGCGAGCCCAAGAGCGCCCACACGTCTCCCGAGAAGAAGAAGGCCAAGGAGCTCCC 2267
Query 2292 TGAAATGGACGCCACCTCCAGCCGGGTGTGGATCCTGACCAGCACCCTGACCACCAGCAAGGTGGTGATCATCG 2365
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Sbjct 2268 TGAAATGGACGCCACCTCCAGCCGGGTGTGGATCCTGACCAGCACCCTGACCACCAGCAAGGTGGTGATCATCG 2341
Query 2366 ACGCCAACCAGCCGGGCACGGTGGTGGACCAGTTCACCGTCTGCAACGCGCACGTGCTGTGCATCTCCAGCATC 2439
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Sbjct 2342 ACGCCAACCAGCCGGGCACGGTGGTGGACCAGTTCACCGTCTGCAACGCGCACGTGCTGTGCATCTCCAGCATC 2415
Query 2440 CCCGCGGCCAGCGACAGCGACTACCCTCCCGGGGAGATGTTCCTGGACAGCGACGTGAACCCAGAGGACCCGGG 2513
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Sbjct 2416 CCCGCGGCCAGCGACAGCGACTACCCTCCCGGGGAGATGTTCCTGGACAGCGACGTGAACCCAGAGGACCCGGG 2489
Query 2514 CGCAGATGGCGTGCTGGCCGGTATCACCCTGGTGGGCTGTGCCACCCGCTGCAACGTGCCGCGGAGCAACTGCT 2587
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Sbjct 2490 CGCAGATGGCGTGCTGGCCGGTATCACCCTGGTGGGCTGTGCCACCCGCTGCAACGTGCCGCGGAGCAACTGCT 2563
Query 2588 CCTCCCGAGGGGACACCCCAGTGCTAGACAAGGGGCAGGGGGAGGTGGCCACCATCGCCAACGGGAAGGTCAAC 2661
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Sbjct 2564 CCTCCCGAGGGGACACCCCAGTGCTAGACAAGGGGCAGGGGGAGGTGGCCACCATCGCCAACGGGAAGGTCAAC 2637
Query 2662 CCGTCCCAGTCCACAGAGGAGGCCACAGAGGCCACGGAGGTGCCAGACCCTGGGCCCAGCGAGCCAGAGACAGC 2735
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Sbjct 2638 CCGTCCCAGTCCACAGAGGAGGCCACAGAGGCCACGGAGGTGCCAGACCCTGGGCCCAGCGAGCCAGAGACAGC 2711
Query 2736 CACATTGCGGCCCGGGCCTCTCACAGAGCACGTCTTCACTGACCCAGCCCCGACCCCGTCCTCTGGCCCCCAGC 2809
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Sbjct 2712 CACATTGCGGCCCGGGCCTCTCACAGAGCACGTCTTCACTGACCCAGCCCCGACCCCGTCCTCTGGCCCCCAGC 2785
Query 2810 CTGGCAGCGAGAACGGGCCAGAGCCTGACAGCAGCAGCACACGGCCAGAGCCAGAGCCCAGCGGGGACCCCACG 2883
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Sbjct 2786 CTGGCAGCGAGAACGGGCCAGAGCCTGACAGCAGCAGCACACGGCCAGAGCCAGAGCCCAGCGGGGACCCCACG 2859
Query 2884 GGAGCAGGCAGCAGTGCTGCACCCACCATGTGGCTGGGAGCCCAGAACGGCTGGCTCTATGTGCACTCGGCTGT 2957
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Sbjct 2860 GGAGCAGGCAGCAGTGCTGCACCCACCATGTGGCTGGGAGCCCAGAACGGCTGGCTCTATGTGCACTCGGCTGT 2933
Query 2958 GGCCAACTGGAAGAAGTGCCTGCACTCCATCAAGCTGAAGGATTCTGTGCTGAGCCTGGTGCATGTCAAAGGCC 3031
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Sbjct 2934 GGCCAACTGGAAGAAGTGCCTGCACTCCATCAAGCTGAAGGATTCTGTGCTGAGCCTGGTGCATGTCAAAGGCC 3007
Query 3032 GTGTGCTGGTGGCTCTGGCGGACGGGACCCTGGCCATCTTCCACCGTGGTGAAGATGGCCAGTGGGATCTGAGC 3105
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Sbjct 3008 GTGTGCTGGTGGCTCTGGCGGACGGGACCCTGGCCATCTTCCACCGTGGTGAAGATGGCCAGTGGGATCTGAGC 3081
Query 3106 AACTATCACCTAATGGACCTGGGCCACCCGCACCACTCCATCCGCTGCATGGCTGTTGTGTACGACCGCGTGTG 3179
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Sbjct 3082 AACTATCACCTAATGGACCTGGGCCACCCGCACCACTCCATCCGCTGCATGGCTGTTGTGTACGACCGCGTGTG 3155
Query 3180 GTGTGGCTACAAGAACAAGGTGCACGTCATCCAGCCCAAGACCATGCAGATAGAGAAGTCATTTGACGCCCACC 3253
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Sbjct 3156 GTGTGGCTACAAGAACAAGGTGCACGTCATCCAGCCCAAGACCATGCAGATAGAGAAGTCATTTGACGCCCACC 3229
Query 3254 CGCGGCGGGAGAGCCAGGTGCGGCAGCTGGCGTGGATCGGCGATGGCGTATGGGTGTCCATCCGCCTGGACTCC 3327
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Sbjct 3230 CGCGGCGGGAGAGCCAGGTGCGGCAGCTGGCGTGGATCGGCGATGGCGTATGGGTGTCCATCCGCCTGGACTCC 3303
Query 3328 ACCCTGAGGCTCTACCATGCACACACGCACCAGCATCTACAGGACGTGGACATTGAGCCCTACGTCAGCAAGAT 3401
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Sbjct 3304 ACCCTGAGGCTCTACCATGCACACACGCACCAGCATCTACAGGACGTGGACATTGAGCCCTACGTCAGCAAGAT 3377
Query 3402 GCTAGGCACTGGCAAGCTGGGTTTCTCCTTCGTACGCATCACGGCCCTGCTTGTCGCGGGCAGCCGGCTCTGGG 3475
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Sbjct 3378 GCTAGGCACTGGCAAGCTGGGTTTCTCCTTCGTACGCATCACGGCCCTGCTTGTCGCGGGCAGCCGGCTCTGGG 3451
Query 3476 TGGGCACCGGCAACGGAGTGGTCATCTCCATCCCCCTGACAGAGA----------------------------- 3520
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Sbjct 3452 TGGGCACCGGCAACGGAGTGGTCATCTCCATCCCCCTGACAGAGAGTGAGTGGCCTGCACACCTGCAGGGGCAG 3525
Query 3521 -------------------------------------------------------------------------- 3520
Sbjct 3526 TGGTGCTGCCAGAGGTGTACGTGGGTTCACGGGGTGGCTCTGCAGGGCCACCTTGGAGGGTGCCTTGCTGCCCC 3599
Query 3521 -----------------------------------------------CTGTGGTCCTGCACCGAGGCCAGCTCC 3547
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Sbjct 3600 TACGCTGACCGCTCTCCTCTTCTCCCATGCTCCTCCCATGTCCCCAGCTGTGGTCCTGCACCGAGGCCAGCTCC 3673
Query 3548 TGGGGCTCCGAGCCAATAAGACATCCCCCACCTCTGGGGAGGGCGCCCGTCCCGGGGGCATCATCCACGTGTAT 3621
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Sbjct 3674 TGGGGCTCCGAGCCAATAAGACATCCCCCACCTCTGGGGAGGGCGCCCGTCCCGGGGGCATCATCCACGTGTAT 3747
Query 3622 GGCGATGACAGCAGTGACAGGGCGGCCAGCAGCTTCATCCCCTACTGCTCCATGGCCCAGGCCCAGCTATGCTT 3695
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Sbjct 3748 GGCGATGACAGCAGTGACAGGGCGGCCAGCAGCTTCATCCCCTACTGCTCCATGGCCCAGGCCCAGCTATGCTT 3821
Query 3696 CCATGGGCACCGCGATGCCGTGAAGTTCTTTGTCTCGGTGCCAGGGAACGTGCTGGCCACCCTGAATGGCAGTG 3769
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Sbjct 3822 CCATGGGCACCGCGATGCCGTGAAGTTCTTTGTCTCGGTGCCAGGGAACGTGCTGGCCACCCTGAATGGGAGTG 3895
Query 3770 TGCTGGACAGCCCAGCCGAGGGCCCTGGGCCAGCTGCCCCTGCCTCGGAGGTCGAGGGCCAGAAGCTGCGGAAC 3843
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Sbjct 3896 TGCTGGACAGCCCAGCCGAGGGCCCTGGGCCAGCTGCCCCTGCCTCGGAGGTCGAGGGCCAGAAGCTGCGGAAC 3969
Query 3844 GTGCTGGTGCTGAGCGGCGGGGAGGGCTACATCGACTTCCGCATTGGAGACGGAGAGGACGACGAGACGGAGGA 3917
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Sbjct 3970 GTGCTGGTGCTGAGCGGCGGGGAGGGCTACATCGACTTCCGCATTGGAGACGGAGAGGACGACGAGACGGAGGA 4043
Query 3918 GGGCGCAGGGGACATGAGCCAGGTGAAGCCCGTGCTGTCCAAGGCAGAGCGCAGTCACATCATCGTGTGGCAGG 3991
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Sbjct 4044 GGGCGCAGGGGACATGAGCCAGGTGAAGCCCGTGCTGTCCAAGGCAGAGCGCAGTCACATCATCGTGTGGCAGG 4117
Query 3992 TGTCCTACACCCCCGAG 4008
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Sbjct 4118 TGTCCTACACCCCCGAG 4134