Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07849
• Subject: NM_001354335.1
• Aligned Length: 1352
• Identities: 1192
• Gaps: 158

Alignment

Query    1  MAHTTKVNGSASGKAGDILSGDQDKEQKDPYFVETPYGYQLDLDFLKYVDDIQKGNTIKRLNIQKRRKPSVPCP  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  EPRTTSGQQGIWTSTESLSSSNSDDNKQCPNFLIARSQVTSTPISKPPPPLETSLPFLTIPENRQLPPPSPQLP  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  KHNLHVTKTLMETRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHKPAKHQLQNGYQGNGDY  222
                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------METRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDY  64

Query  223  GSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQE  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  GSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQE  138

Query  297  EKRQLVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFRQL  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  EKRQLVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFRQL  212

Query  371  TADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVGTLVQMRNCGVSVTEAM  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  213  TADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVGTLVEMRNCGVSVTEAM  286

Query  445  LGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  LGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEA  360

Query  519  VVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKS  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  VVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKS  434

Query  593  VSVEVSVCETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVP  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  VSVEVSVCETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVP  508

Query  667  RTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDINSSTKTRSIGVGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  RTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDINSSTKTRSIGVGT  582

Query  741  LLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  LLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQ  656

Query  815  APLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNP  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  APLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNP  730

Query  889  DFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  DFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAA  804

Query  963  GLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEE  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  GLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEE  878

Query 1037  EEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKD  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  EEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKD  952

Query 1111  MRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  MRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDA  1026

Query 1185  DVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  DVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGA  1100

Query 1259  DVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSP  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  DVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSP  1174

Query 1333  GTPRLGRKTSPGPTHRGSFD  1352
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  GTPRLGRKTSPGPTHRGSFD  1194