Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07849
- Subject:
- NM_001354339.1
- Aligned Length:
- 1352
- Identities:
- 1112
- Gaps:
- 238
Alignment
Query 1 MAHTTKVNGSASGKAGDILSGDQDKEQKDPYFVETPYGYQLDLDFLKYVDDIQKGNTIKRLNIQKRRKPSVPCP 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 EPRTTSGQQGIWTSTESLSSSNSDDNKQCPNFLIARSQVTSTPISKPPPPLETSLPFLTIPENRQLPPPSPQLP 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 KHNLHVTKTLMETRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHKPAKHQLQNGYQGNGDY 222
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Sbjct 1 ----------METRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDY 64
Query 223 GSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQE 296
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Sbjct 65 GSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQE 138
Query 297 EKRQLVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFRQL 370
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Sbjct 139 EKRQLVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFRQL 212
Query 371 TADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVGTLVQMRNCGVSVTEAM 444
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Sbjct 213 TADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVGTLVEMRNCGVSVTEAM 286
Query 445 LGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEA 518
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Sbjct 287 LGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEA 360
Query 519 VVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKS 592
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Sbjct 361 VVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKS 434
Query 593 VSVEVSVCETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVP 666
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Sbjct 435 VSVEVSVCETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVP 508
Query 667 RTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDINSSTKTRSIGVGT 740
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Sbjct 509 RTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDINSSTKTRSIGVGT 582
Query 741 LLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQ 814
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Sbjct 583 LLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQ 656
Query 815 APLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNP 888
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Sbjct 657 APLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNP 730
Query 889 DFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAA 962
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Sbjct 731 DFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAA 804
Query 963 GLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEE 1036
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Sbjct 805 GLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGG---------------------------------- 844
Query 1037 EEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKD 1110
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Sbjct 845 ----------------------------------------------YELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKD 872
Query 1111 MRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDA 1184
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Sbjct 873 MRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDA 946
Query 1185 DVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGA 1258
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Sbjct 947 DVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGA 1020
Query 1259 DVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSP 1332
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Sbjct 1021 DVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSP 1094
Query 1333 GTPRLGRKTSPGPTHRGSFD 1352
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Sbjct 1095 GTPRLGRKTSPGPTHRGSFD 1114