Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07852
Subject:
NM_001134473.3
Aligned Length:
3339
Identities:
3338
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAAC  74
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Sbjct    1  ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAAC  74

Query   75  CAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGG  148

Query  149  AACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGC  222

Query  223  ACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCG  296

Query  297  GCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCA  370

Query  371  CCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCC  444

Query  445  AGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAG  518

Query  519  GTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCT  592
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Sbjct  519  GTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCT  592

Query  593  CTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTC  666
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Sbjct  593  CTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTC  666

Query  667  AGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCG  740

Query  741  TGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTG  814
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Sbjct  741  TGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTG  814

Query  815  AGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCC  888

Query  889  GCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCG  962
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Sbjct  889  GCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCG  962

Query  963  GGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGC  1036

Query 1037  CCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATC  1110

Query 1111  TTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGC  1184

Query 1185  GCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGG  1258

Query 1259  AGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCA  1332

Query 1333  GGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCC  1406

Query 1407  CAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGC  1480

Query 1481  GGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTG  1554

Query 1555  GTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGA  1628

Query 1629  CAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCG  1702

Query 1703  GGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCG  1776

Query 1777  GCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGA  1850
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Sbjct 1777  GCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGA  1850

Query 1851  CCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCA  1924
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Sbjct 1851  CCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCA  1924

Query 1925  GGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAG  1998

Query 1999  GTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTT  2072

Query 2073  TTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGA  2146

Query 2147  GGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCG  2220
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Sbjct 2147  GGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCG  2220

Query 2221  CTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCAT  2294

Query 2295  CTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGA  2368

Query 2369  AGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTG  2442

Query 2443  AGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGTCTGACAT  2516

Query 2517  CCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTC  2590
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Sbjct 2517  CCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTC  2590

Query 2591  CTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATC  2664
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Sbjct 2591  CTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATC  2664

Query 2665  CGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCC  2738
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Sbjct 2665  CGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCC  2738

Query 2739  CTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGC  2812

Query 2813  ATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCT  2886
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Sbjct 2813  ATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCT  2886

Query 2887  GAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGG  2960
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Sbjct 2887  GAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGG  2960

Query 2961  CCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGG  3034

Query 3035  AGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAA  3108
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Sbjct 3035  AGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAA  3108

Query 3109  AATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGC  3182
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Sbjct 3109  AATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGC  3182

Query 3183  AGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCC  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCC  3256

Query 3257  AGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGA  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGA  3330

Query 3331  TATCCCAGG  3339
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Sbjct 3331  TATCCCAGG  3339