Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07852
• Subject: NM_001145896.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 997
• Gaps: 116

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MKGMSHEPKSPSIGMLSTATRTTATVNPLTPSPLNGALVPTGSPATSSTLSAQAAPSSSFAAALRKLAKQAEEP  74

Query    1  ------------------------------MGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDAGSRS  44
                                          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct   75  RGSSLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDSGSRG  148

Query   45  SSGGRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGLSPSSVVQDSRFPPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSF  118
            ||.|||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  SSSGRERLLVEPPLAQEKAAGPAIPSHLLSTPYPFGLSPGSVVQDSRFQPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSF  222

Query  119  RPYHTTDDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPSA  192
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  RPYHTAEDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPSA  296

Query  193  MHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSGLSAERLQMDEELRREREREREREREREADREREKERERE-REKER  265
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  297  MHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSSLSAERLQMDEELR--REREREREREREADREREKEREREQREKER  368

Query  266  EQEKEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEP-SFLPVAELHGLRGHATEERGKPSEQLTPTRAEKLKD  338
            |.|.||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  369  EKELEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEPTTFLPVAELHGLRGHSTEERPKPSEQLTPTRAEKLKD  442

Query  339  AGLQAPKPVQHPLHPVPTPHHTVPSLISNHGIFSLPSSSAATALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVS  412
            .||||||||||||||||.||||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  VGLQAPKPVQHPLHPVPAPHHTVPSLISSHGIFSLPGSSATTALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVS  516

Query  413  EFRQQVLEQHLDMGRPPVPAEAEHRPESTTRPGPNRHEPGGRDPPQHFGGPPPLISPKPQLHAAPTALWNPVSL  486
            ||||||||||||.|||.||.|||||||| ||||.||||.|.|.|||||||||||||||||.|..||||||||||
Sbjct  517  EFRQQVLEQHLDLGRPLVPTEAEHRPES-TRPGTNRHEQGSREPPQHFGGPPPLISPKPQQHTVPTALWNPVSL  589

Query  487  MDNTLETRRAESHSLHSHPAAFEPSRQAAVPLVKVERVFCPEKAEEGPRKREPAPLDKYQ--PPPPPPREGGSL  558
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||| |||||..||||||  ||||||||.|||
Sbjct  590  MDNALETRRAESHSLHSHPTAFEPSRQAAVPLVKVERVYCSEKAEE-PRKREATPLDKYQPPPPPPPPREAGSL  662

Query  559  EHQPFLPGPGPFLAELEKSTQTILGQQRASLPQAATFGELSGPLKPGSPYRPPVPRAPDPAYIYDEFLQQRRRL  632
            |.|.|..||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||||||..|..|.|||||||||||||||.|
Sbjct  663  EPQTFPHGPGPFLTELEKSTQTILGQQRPSLSQATSFGELSGPLKPGSPYCHPTARGPDPAYIYDEFLQQRRKL  736

Query  633  VSKLDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEEL  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  VSKLDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEEL  810

Query  707  VAQKRRKRRRMLRERSPSPPTIQSKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKKKFLTIFNLTHISAEKRKDKE  780
            ||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  811  VAQKRRKRRRMLRERSPSPPAVQCKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKRKFLTFFNLTHISAEKRKDKE  884

Query  781  RLVEMLRAMKQKALSAAVADSLTNSPRDSPAVSLSEPATQQASLDVEKPVGAAASLSDIPKAAEPGKLEQVRPQ  854
            |||||||||||.||||  |||.|||.||||.|||||||||.|.|....|||..|||||.||..|.|.|||.|||
Sbjct  885  RLVEMLRAMKQRALSA--ADSVTNSSRDSPPVSLSEPATQPAPLETDQPVGVPASLSDVPKTTETGRLEQLRPQ  956

Query  855  ELSRVQELAPASGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYIRGAAPKDIPVPLSHSTNGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVL  928
            ||.||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  ELLRVQEPAPPSGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYLRGAAPKDIPVPLSHSINGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVL  1030

Query  929  QSTQKALQKHKGSVAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRAPPPQHNGQQEPPTARKGPPTQELDRDSEEEEE  1002
            ||||||||||||..|.|||||.|||||..||||||||||||.|.||||||||||..|||||.||.|.||||..|
Sbjct 1031  QSTQKALQKHKGNSALLSAEQSHKVDTAIHYNIPELQSSSRVPLPQHNGQQEPPMGRKGPPMQEADQDSEEDSE  1104

Query 1003  EDDEDGEDEEEVPKRKWQGIEAVFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEARHYSLSLTAEQLSHSVAELRSQKQ  1076
            ||.|  |..||.|.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||
Sbjct 1105  EDSE--EEAEEAPRRQWQGIEAIFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEAQNYSLSLTAEQLSHSMAELRSQKQ  1176

Query 1077  KMVSERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYLKGYPR  1113
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1177  KMVSERERLQAELDHLRKCLALPTMHWPRGYFKGYPR  1213