Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07852
• Subject: NM_001145897.1
• Aligned Length: 1218
• Identities: 997
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSHEPKSPSIGMLSTATRTTATVNPLTPSPLNGALVPTGSPATSSTLSAQAAPSSSFAAALRKLAKQAEEPRGS  74

Query    1  ---------------------------MGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDAGSRSSSG  47
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.
Sbjct   75  SLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRSESRQDSGSRGSSS  148

Query   48  GRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGLSPSSVVQDSRFPPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSFRPY  121
            |||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GRERLLVEPPLAQEKAAGPAIPSHLLSTPYPFGLSPGSVVQDSRFQPLNLQRPVHHVVPPSTVTEDYLRSFRPY  222

Query  122  HTTDDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPSAMHL  195
            ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  HTAEDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTPGSLPPLHPSAMHL  296

Query  196  HLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSGLSAERLQMDEELRREREREREREREREADREREKERERE-REKEREQE  268
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||.|
Sbjct  297  HLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSSLSAERLQMDEELR--REREREREREREADREREKEREREQREKEREKE  368

Query  269  KEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEP-SFLPVAELHGLRGHATEERGKPSEQLTPTRAEKLKDAGL  341
            .||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||
Sbjct  369  LEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEPTTFLPVAELHGLRGHSTEERPKPSEQLTPTRAEKLKDVGL  442

Query  342  QAPKPVQHPLHPVPTPHHTVPSLISNHGIFSLPSSSAATALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVSEFR  415
            ||||||||||||||.||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  QAPKPVQHPLHPVPAPHHTVPSLISSHGIFSLPGSSATTALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQEKEDRQSQVSEFR  516

Query  416  QQVLEQHLDMGRPPVPAEAEHRPESTTRPGPNRHEPGGRDPPQHFGGPPPLISPKPQLHAAPTALWNPVSLMDN  489
            |||||||||.|||.||.|||||||| ||||.||||.|.|.|||||||||||||||||.|..|||||||||||||
Sbjct  517  QQVLEQHLDLGRPLVPTEAEHRPES-TRPGTNRHEQGSREPPQHFGGPPPLISPKPQQHTVPTALWNPVSLMDN  589

Query  490  TLETRRAESHSLHSHPAAFEPSRQAAVPLVKVERVFCPEKAEEGPRKREPAPLDKYQ--PPPPPPREGGSLEHQ  561
            .|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||| |||||..||||||  ||||||||.||||.|
Sbjct  590  ALETRRAESHSLHSHPTAFEPSRQAAVPLVKVERVYCSEKAEE-PRKREATPLDKYQPPPPPPPPREAGSLEPQ  662

Query  562  PFLPGPGPFLAELEKSTQTILGQQRASLPQAATFGELSGPLKPGSPYRPPVPRAPDPAYIYDEFLQQRRRLVSK  635
            .|..||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||||||..|..|.|||||||||||||||.||||
Sbjct  663  TFPHGPGPFLTELEKSTQTILGQQRPSLSQATSFGELSGPLKPGSPYCHPTARGPDPAYIYDEFLQQRRKLVSK  736

Query  636  LDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEELVAQ  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  LDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFGLTTQQQKEELVAQ  810

Query  710  KRRKRRRMLRERSPSPPTIQSKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKKKFLTIFNLTHISAEKRKDKERLV  783
            |||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct  811  KRRKRRRMLRERSPSPPAVQCKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKRKFLTFFNLTHISAEKRKDKERLV  884

Query  784  EMLRAMKQKALSAAVADSLTNSPRDSPAVSLSEPATQQASLDVEKPVGAAASLSDIPKAAEPGKLEQVRPQELS  857
            ||||||||.||||  |||.|||.||||.|||||||||.|.|....|||..|||||.||..|.|.|||.|||||.
Sbjct  885  EMLRAMKQRALSA--ADSVTNSSRDSPPVSLSEPATQPAPLETDQPVGVPASLSDVPKTTETGRLEQLRPQELL  956

Query  858  RVQELAPASGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYIRGAAPKDIPVPLSHSTNGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVLQST  931
            ||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  RVQEPAPPSGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYLRGAAPKDIPVPLSHSINGKSKPWEPFVAEEFAHQFHESVLQST  1030

Query  932  QKALQKHKGSVAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRAPPPQHNGQQEPPTARKGPPTQELDRDSEEEEEEDD  1005
            |||||||||..|.|||||.|||||..||||||||||||.|.||||||||||..|||||.||.|.||||..|||.
Sbjct 1031  QKALQKHKGNSALLSAEQSHKVDTAIHYNIPELQSSSRVPLPQHNGQQEPPMGRKGPPMQEADQDSEEDSEEDS  1104

Query 1006  EDGEDEEEVPKRKWQGIEAVFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEARHYSLSLTAEQLSHSVAELRSQKQKMV  1079
            |  |..||.|.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1105  E--EEAEEAPRRQWQGIEAIFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEAQNYSLSLTAEQLSHSMAELRSQKQKMV  1176

Query 1080  SERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYLKGYPR  1113
            ||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1177  SERERLQAELDHLRKCLALPTMHWPRGYFKGYPR  1210