Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07852
Subject:
NM_198671.2
Aligned Length:
1231
Identities:
997
Gaps:
126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MFGLKPPLYYLPGMSHEPKSPSIGMLSTATRTTATVNPLTPSPLNGALVPTGSPATSSTLSAQAAPSSSFAAAL  74

Query    1  ----------------------------------------MGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRS  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  RKLAKQAEEPRGSSLSSESSPVSSPATNHSSPASTPKRVPMGPIIVPPGGHSVPSTPPVVTIAPTKTVNGVWRS  148

Query   35  ESRQDAGSRSSSGGRERLIVEPPLPQEKAGGPAIPSHLLSTPYPFGLSPSSVVQDSRFPPLNLQRPVHHVVPPS  108
            |||||.|||.||.|||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  ESRQDSGSRGSSSGRERLLVEPPLAQEKAAGPAIPSHLLSTPYPFGLSPGSVVQDSRFQPLNLQRPVHHVVPPS  222

Query  109  TVTEDYLRSFRPYHTTDDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTP  182
            |||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TVTEDYLRSFRPYHTAEDLRMSSLPPLGLDPATAAAYYHPSYLAPHPFPHPAFRMDDSYCLSALRSPFYPIPTP  296

Query  183  GSLPPLHPSAMHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSGLSAERLQMDEELRREREREREREREREADREREKE  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  ||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GSLPPLHPSAMHLHLSGVRYPPELSHSSLAALHSERMSSLSAERLQMDEELR--REREREREREREADREREKE  368

Query  257  RERE-REKEREQEKEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEP-SFLPVAELHGLRGHATEERGKPSEQL  328
            |||| ||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||.||||.||||||
Sbjct  369  REREQREKEREKELEREREKERERELERQREQRAREKELLAAKALEPTTFLPVAELHGLRGHSTEERPKPSEQL  442

Query  329  TPTRAEKLKDAGLQAPKPVQHPLHPVPTPHHTVPSLISNHGIFSLPSSSAATALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQ  402
            ||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  TPTRAEKLKDVGLQAPKPVQHPLHPVPAPHHTVPSLISSHGIFSLPGSSATTALLIQRTNEEEKWLARQRRLRQ  516

Query  403  EKEDRQSQVSEFRQQVLEQHLDMGRPPVPAEAEHRPESTTRPGPNRHEPGGRDPPQHFGGPPPLISPKPQLHAA  476
            ||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||| ||||.||||.|.|.|||||||||||||||||.|..
Sbjct  517  EKEDRQSQVSEFRQQVLEQHLDLGRPLVPTEAEHRPES-TRPGTNRHEQGSREPPQHFGGPPPLISPKPQQHTV  589

Query  477  PTALWNPVSLMDNTLETRRAESHSLHSHPAAFEPSRQAAVPLVKVERVFCPEKAEEGPRKREPAPLDKYQ--PP  548
            |||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||| |||||..||||||  ||
Sbjct  590  PTALWNPVSLMDNALETRRAESHSLHSHPTAFEPSRQAAVPLVKVERVYCSEKAEE-PRKREATPLDKYQPPPP  662

Query  549  PPPPREGGSLEHQPFLPGPGPFLAELEKSTQTILGQQRASLPQAATFGELSGPLKPGSPYRPPVPRAPDPAYIY  622
            ||||||.||||.|.|..||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||||||..|..|.|||||||
Sbjct  663  PPPPREAGSLEPQTFPHGPGPFLTELEKSTQTILGQQRPSLSQATSFGELSGPLKPGSPYCHPTARGPDPAYIY  736

Query  623  DEFLQQRRRLVSKLDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFG  696
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  DEFLQQRRKLVSKLDLEERRRREAQEKGYYYDLDDSYDESDEEEVRAHLRCVAEQPPLKLDTSSEKLEFLQLFG  810

Query  697  LTTQQQKEELVAQKRRKRRRMLRERSPSPPTIQSKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKKKFLTIFNLTH  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  811  LTTQQQKEELVAQKRRKRRRMLRERSPSPPAVQCKRQTPSPRLALSTRYSPDEMNNSPNFEEKRKFLTFFNLTH  884

Query  771  ISAEKRKDKERLVEMLRAMKQKALSAAVADSLTNSPRDSPAVSLSEPATQQASLDVEKPVGAAASLSDIPKAAE  844
            |||||||||||||||||||||.||||  |||.|||.||||.|||||||||.|.|....|||..|||||.||..|
Sbjct  885  ISAEKRKDKERLVEMLRAMKQRALSA--ADSVTNSSRDSPPVSLSEPATQPAPLETDQPVGVPASLSDVPKTTE  956

Query  845  PGKLEQVRPQELSRVQELAPASGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYIRGAAPKDIPVPLSHSTNGKSKPWEPFVAEE  918
            .|.|||.|||||.||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  957  TGRLEQLRPQELLRVQEPAPPSGEKARLSEAPGGKKSLSMLHYLRGAAPKDIPVPLSHSINGKSKPWEPFVAEE  1030

Query  919  FAHQFHESVLQSTQKALQKHKGSVAVLSAEQNHKVDTSVHYNIPELQSSSRAPPPQHNGQQEPPTARKGPPTQE  992
            ||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||..||||||||||||.|.||||||||||..|||||.||
Sbjct 1031  FAHQFHESVLQSTQKALQKHKGNSALLSAEQSHKVDTAIHYNIPELQSSSRVPLPQHNGQQEPPMGRKGPPMQE  1104

Query  993  LDRDSEEEEEEDDEDGEDEEEVPKRKWQGIEAVFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEARHYSLSLTAEQLSH  1066
            .|.||||..|||.|  |..||.|.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 1105  ADQDSEEDSEEDSE--EEAEEAPRRQWQGIEAIFEAYQEHIEEQNLERQVLQTQCRRLEAQNYSLSLTAEQLSH  1176

Query 1067  SVAELRSQKQKMVSERERLQAELDHLRKCLALPAMHWPRGYLKGYPR  1113
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1177  SMAELRSQKQKMVSERERLQAELDHLRKCLALPTMHWPRGYFKGYPR  1223