Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07852
- Subject:
- XM_006531148.3
- Aligned Length:
- 3481
- Identities:
- 2838
- Gaps:
- 173
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTTCGGACTGAAGCCGCCTCTCTATTACTTACCAGGGTCCTCACTGAGCAGCGAGTCATCTCCAGTGTCCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTG 25
||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 75 TCCAGCCACCAACCATAGCTCTCCAGCTAGCACGCCCAAACGAGTGCCCATGGGCCCCATCATCGTCCCCCCCG 148
Query 26 GGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGG 99
||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 149 GGGGTCACAGTGTCCCCAGCACTCCCCCAGTGGTCACTATTGCCCCCACTAAAACCGTCAATGGAGTCTGGAGA 222
Query 100 AGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCT--CCAGG-AGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATT-GTGGAGCCCC 169
||.||||||||.|||||..|.|||| |.||| ||||||||| ||||||||.||||| ||| ||||||||.|
Sbjct 223 AGCGAGAGCCGCCAGGACTCTGGCTCACGAGGCAGCAGCAGT---GGTCGGGAGCGCCT-ATTGGTGGAGCCAC 292
Query 170 CGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTC 243
|.|||.|.|||||.|||||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 293 CTCTCGCCCAGGAAAAGGCTGCGGGCCCCGCCATCCCCTCCCACCTACTCAGCACCCCGTACCCCTTTGGCCTT 366
Query 244 TCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCC 317
||||||.||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 367 TCCCCCGGCTCAGTTGTACAGGACTCCCGCTTCCAACCACTCAACCTCCAGCGGCCTGTGCACCATGTGGTGCC 440
Query 318 CCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCT 391
||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.||.|||.|.||||||||||
Sbjct 441 CCCCAGCACGGTGACTGAGGACTACTTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACTGCTGAAGACTTACGCATGTCCT 514
Query 392 CACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCC 465
|..|||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 515 CCTTGCCTCCGCTTGGCCTGGACCCAGCCACCGCCGCAGCCTACTATCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCA 588
Query 466 TTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCC 539
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 589 TTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGATGACTCCTATTGCCTGTCAGCCTTAAGGTCTCCGTTCTACCCCATCCC 662
Query 540 CACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCG 613
||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 663 CACCCCTGGCTCCCTGCCTCCACTGCATCCGTCGGCGATGCACCTGCATCTCTCCGGCGTACGGTATCCTCCTG 736
Query 614 AGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATG 687
|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||.||||||.||||.|||
Sbjct 737 AGCTCTCCCACTCGTCCCTGGCGGCGCTACACTCGGAGCGGATGTCCAGCCTCAGTGCAGAGAGGTTGCAAATG 810
Query 688 GACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGA 761
||||||||.||..||||||||| |.|||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 811 GACGAGGAACTGCGGCGGGAGA------GAGAGCGAGAGCGGGAACGGGAACGGGAGGCCGACCGGGAGCGGGA 878
Query 762 GAAGGAACGTGAGCGCG---AACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCG 832
||||||.||.|||||.| |.||.|||||||||||.|||.|.|||..||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 879 GAAGGAGCGGGAGCGGGAGCAGCGGGAGAAGGAGCGGGAGAAGGAGCTGGAGCGCGAGCGGGAGAAGGAACGGG 952
Query 833 AGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGC-- 904
||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct 953 AGCGCGAGCTGGAGCGGCAGCGGGAGCAGCGGGCGAGGGAGAAGGAGCTGCTGGCTGCCAAGGCCTTAGAGCCC 1026
Query 905 -CCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGA 977
|||.|||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||...|||.|||||||||..||||||||||||
Sbjct 1027 ACCACCTTCCTGCCTGTGGCCGAGCTGCACGGACTCCGAGGTCACAGCACGGAGGAGCGGCCCAAGCCCTCGGA 1100
Query 978 GCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCT 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||.|||||||||||||||||||.||.|||||..
Sbjct 1101 GCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGACGTGGGCTTGCAGGCGCCCAAGCCCGTGCAGCACCCTC 1174
Query 1052 TGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGC 1125
||||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1175 TGCACCCAGTGCCTGCCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAGCCACGGCATCTTCTCTCTGCCTGGA 1248
Query 1126 AGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCT 1199
|||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1249 AGCAGCGCCACCACCGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAACGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCACGGCAGCGCCGCCT 1322
Query 1200 GCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATA 1273
|||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..
Sbjct 1323 GCGGCAGGAGAAGGAAGACCGCCAGTCCCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTCCTGGAGCAGCACCTAGACC 1396
Query 1274 TGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCAC 1347
||||||||||||.||||||..|.|||||.|||||||||||.||||| |||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 1397 TGGGCCGGCCCCTGGTGCCCACAGAGGCGGAGCACAGGCCCGAGAG---CACCAGGCCAGGAACAAACCGGCAT 1467
Query 1348 GAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCA 1421
||||..||..|||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||..||
Sbjct 1468 GAGCAGGGCAGCCGTGAACCCCCACAGCACTTTGGTGGCCCTCCACCCCTCATCTCACCCAAGCCCCAGCAGCA 1541
Query 1422 TGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCC 1495
..|.|.||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|..|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1542 CACCGTACCCACAGCCCTCTGGAACCCAGTGTCTCTGATGGACAATGCTCTGGAGACGCGGCGGGCCGAGAGCC 1615
Query 1496 ACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGG 1569
||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1616 ACTCTCTGCATAGCCACCCGACTGCTTTTGAGCCCAGCCGCCAGGCCGCCGTGCCACTGGTGAAGGTGGAGCGA 1689
Query 1570 GTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACC 1643
||.|..|||.|.|||||.|||||||| |||.||||||||||||.|..|.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1690 GTTTATTGCTCAGAGAAGGCAGAGGA---GCCCCGGAAGCGTGAGGCCACACCACTGGACAAATACCAGCCACC 1760
Query 1644 TCCGCCGCCACCA------CGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCC 1711
.||.||.|||||| ||.||||.|||.||.|||||||..|||.||||.|..|.|||.||.|||||.||||
Sbjct 1761 ACCACCACCACCACCACCGCGGGAGGCAGGAAGTCTGGAGCCTCAGACCTTTCCCCACGGACCTGGGCCTTTCC 1834
Query 1712 TGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTC 1785
|..||||.||.||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||.||||.||..|.|||||..||.|||||
Sbjct 1835 TTACTGAACTTGAAAAGTCAACACAGACCATCTTGGGCCAGCAGCGGCCCTCTCTTTCCCAGGCAACCTCCTTC 1908
Query 1786 GGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGC-CCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCT 1858
|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||.|.| |||||..||.| |||.||||||.||.||||
Sbjct 1909 GGGGAGCTCAGTGGGCCTCTGAAACCAGGCTCTCCGTACTGCCACCCCACAGCGA-GGGGCCCCGATCCAGCCT 1981
Query 1859 ACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGG 1932
|||||||.||||||||.||.||||||||.||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1982 ACATCTACGATGAGTTTCTTCAGCAGCGACGGAAGCTGGTCAGCAAACTGGACCTGGAGGAACGCAGGCGGCGC 2055
Query 1933 GAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGC 2006
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2056 GAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCGTACGACGAGAGTGACGAGGAGGAGGTCAGGGC 2129
Query 2007 CCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAAC 2080
.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2130 ACACCTCCGCTGTGTGGCTGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACATCCTCGGAGAAGCTAGAGTTCTTGCAAC 2203
Query 2081 TTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTG 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||..||||||||.||.|||||||.
Sbjct 2204 TTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAACTGGTGGCGCAGAAGCGCCGGAAGCGGAGGCGGATGCTC 2277
Query 2155 CGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTAC 2228
.|||||||||||||||||||.||..|..|||||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 2278 AGAGAGAGAAGCCCGTCGCCACCTGCCGTTCAGTGCAAGCGACAGACGCCTTCCCCCAGGCTGGCTCTGTCCAC 2351
Query 2229 CCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACC 2302
||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||.|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2352 CCGCTACAGCCCCGACGAGATGAACAACAGCCCCAACTTTGAGGAGAAGAGGAAGTTCCTGACCTTCTTCAACT 2425
Query 2303 TGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAG 2376
||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||..
Sbjct 2426 TGACGCACATCAGTGCGGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGGCTTGTTGAAATGCTCCGAGCCATGAAGCAGAGA 2499
Query 2377 GCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACC 2450
||||||||.|||||| |||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2500 GCACTGTCCGCAGCA------GACTCAGTGACAAACTCTTCGAGGGACAGTCCTCCCGTCTCCCTGAGTGAACC 2567
Query 2451 AGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGG 2524
||||||.||||.|||..||||.||...|||..||||.||.||.|...||||.||||||||.||..||||||||.
Sbjct 2568 AGCCACACAGCCAGCTCCTCTAGAGACGGATCAGCCTGTCGGGGTCCCTGCCTCCTTGTCAGATGTCCCAAAGA 2641
Query 2525 CCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGC 2598
||.|||||.|.||||..|||||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||..||||||.||||.
Sbjct 2642 CCACGGAGACCGGGAGACTGGAACAGCTCCGGCCCCAGGAGCTCTTGAGAGTCCAGGAGCCGGCTCCTCCCAGT 2715
Query 2599 GGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGC 2672
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||||||||
Sbjct 2716 GGTGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGTGGCAAGAAGAGCCTGAGCATGCTCCATTACCTCCGGGGCGC 2789
Query 2673 TGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGG 2746
.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 2790 CGCGCCCAAGGACATTCCTGTGCCGTTGTCTCACAGCATCAACGGGAAGAGCAAGCCCTGGGAGCCTTTCGTGG 2863
Query 2747 CAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGG 2820
|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2864 CCGAAGAGTTTGCACATCAATTCCACGAGTCCGTGCTGCAGTCCACACAGAAGGCTCTGCAGAAGCATAAAGGG 2937
Query 2821 AGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCA 2894
|.|...|||.||||.|||||||||||||.||||||.||.||||||.|..||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2938 AACTCTGCTTTGCTATCTGCAGAGCAGAGCCACAAAGTCGACACGGCAATCCACTACAACATTCCCGAGCTGCA 3011
Query 2895 GTCCTCCAGCCGCG-CCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCA 2967
||||||||||.|.| ||||| ..||||||||||||||.||.||||||||.||.|..|..|||||||||||.||.
Sbjct 3012 GTCCTCCAGCAGGGTCCCCT-TGCCCCAGCACAATGGACAACAGGAGCCTCCAATGGGGAGGAAGGGCCCTCCT 3084
Query 2968 ACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGA-GAAGATGAGGAGGAAG 3040
|..||||||..|||||.||||||.||||||||....||||||||....|| ||| ||||.| |||||||
Sbjct 3085 ATGCAGGAGGCGGACCAGGACTCTGAGGAGGACTCTGAGGAGGACAGCGA----GGAGGAAGCT---GAGGAAG 3151
Query 3041 TCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTG 3114
.|||.|.||||.|||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3152 CCCCGAGGCGCCAGTGGCAAGGGATTGAGGCAATCTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAACCTG 3225
Query 3115 GAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCA 3188
||||||||||||.|.|||||.||.||..|.||..|||||||.|.|.|||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 3226 GAGCGGCAGGTGCTGCAGACGCAGTGCCGGCGGTTGGAGGCGCAGAACTACAGCCTCAGCCTGACTGCGGAGCA 3299
Query 3189 GCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAG 3262
|||.||.||||||.||||||||.|..||||.||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.|
Sbjct 3300 GCTGTCTCACAGCATGGCGGAGCTTCGGAGTCAGAAACAGAAGATGGTCTCTGAGCGGGAGCGGCTCCAGGCGG 3373
Query 3263 AACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCC 3336
|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct 3374 AGCTGGACCACTTGCGGAAGTGCCTTGCCTTGCCCACCATGCACTGGCCTAGGGGCTACTTTAAGGGATATCCG 3447
Query 3337 AGG 3339
|||
Sbjct 3448 AGG 3450