Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07852
Subject:
XM_006531148.3
Aligned Length:
3481
Identities:
2838
Gaps:
173

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTCGGACTGAAGCCGCCTCTCTATTACTTACCAGGGTCCTCACTGAGCAGCGAGTCATCTCCAGTGTCCTC  74

Query    1  -------------------------------------------------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTG  25
                                                             ||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct   75  TCCAGCCACCAACCATAGCTCTCCAGCTAGCACGCCCAAACGAGTGCCCATGGGCCCCATCATCGTCCCCCCCG  148

Query   26  GGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGG  99
            ||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  GGGGTCACAGTGTCCCCAGCACTCCCCCAGTGGTCACTATTGCCCCCACTAAAACCGTCAATGGAGTCTGGAGA  222

Query  100  AGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCT--CCAGG-AGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATT-GTGGAGCCCC  169
            ||.||||||||.|||||..|.||||  |.||| |||||||||   ||||||||.||||| ||| ||||||||.|
Sbjct  223  AGCGAGAGCCGCCAGGACTCTGGCTCACGAGGCAGCAGCAGT---GGTCGGGAGCGCCT-ATTGGTGGAGCCAC  292

Query  170  CGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTC  243
            |.|||.|.|||||.|||||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  293  CTCTCGCCCAGGAAAAGGCTGCGGGCCCCGCCATCCCCTCCCACCTACTCAGCACCCCGTACCCCTTTGGCCTT  366

Query  244  TCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCC  317
            ||||||.||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  367  TCCCCCGGCTCAGTTGTACAGGACTCCCGCTTCCAACCACTCAACCTCCAGCGGCCTGTGCACCATGTGGTGCC  440

Query  318  CCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCT  391
            ||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.||.|||.|.||||||||||
Sbjct  441  CCCCAGCACGGTGACTGAGGACTACTTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACTGCTGAAGACTTACGCATGTCCT  514

Query  392  CACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCC  465
            |..|||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  515  CCTTGCCTCCGCTTGGCCTGGACCCAGCCACCGCCGCAGCCTACTATCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCA  588

Query  466  TTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCC  539
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  589  TTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGATGACTCCTATTGCCTGTCAGCCTTAAGGTCTCCGTTCTACCCCATCCC  662

Query  540  CACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCG  613
            ||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|
Sbjct  663  CACCCCTGGCTCCCTGCCTCCACTGCATCCGTCGGCGATGCACCTGCATCTCTCCGGCGTACGGTATCCTCCTG  736

Query  614  AGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATG  687
            |||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||.||||||.||||.|||
Sbjct  737  AGCTCTCCCACTCGTCCCTGGCGGCGCTACACTCGGAGCGGATGTCCAGCCTCAGTGCAGAGAGGTTGCAAATG  810

Query  688  GACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGA  761
            ||||||||.||..|||||||||      |.|||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  811  GACGAGGAACTGCGGCGGGAGA------GAGAGCGAGAGCGGGAACGGGAACGGGAGGCCGACCGGGAGCGGGA  878

Query  762  GAAGGAACGTGAGCGCG---AACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCG  832
            ||||||.||.|||||.|   |.||.|||||||||||.|||.|.|||..||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  879  GAAGGAGCGGGAGCGGGAGCAGCGGGAGAAGGAGCGGGAGAAGGAGCTGGAGCGCGAGCGGGAGAAGGAACGGG  952

Query  833  AGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGC--  904
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||  
Sbjct  953  AGCGCGAGCTGGAGCGGCAGCGGGAGCAGCGGGCGAGGGAGAAGGAGCTGCTGGCTGCCAAGGCCTTAGAGCCC  1026

Query  905  -CCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGA  977
             |||.|||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||...|||.|||||||||..||||||||||||
Sbjct 1027  ACCACCTTCCTGCCTGTGGCCGAGCTGCACGGACTCCGAGGTCACAGCACGGAGGAGCGGCCCAAGCCCTCGGA  1100

Query  978  GCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCT  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||.|||||||||||||||||||.||.|||||..
Sbjct 1101  GCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGACGTGGGCTTGCAGGCGCCCAAGCCCGTGCAGCACCCTC  1174

Query 1052  TGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGC  1125
            ||||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1175  TGCACCCAGTGCCTGCCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAGCCACGGCATCTTCTCTCTGCCTGGA  1248

Query 1126  AGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCT  1199
            |||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1249  AGCAGCGCCACCACCGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAACGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCACGGCAGCGCCGCCT  1322

Query 1200  GCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATA  1273
            |||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..
Sbjct 1323  GCGGCAGGAGAAGGAAGACCGCCAGTCCCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTCCTGGAGCAGCACCTAGACC  1396

Query 1274  TGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCAC  1347
            ||||||||||||.||||||..|.|||||.|||||||||||.|||||   |||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 1397  TGGGCCGGCCCCTGGTGCCCACAGAGGCGGAGCACAGGCCCGAGAG---CACCAGGCCAGGAACAAACCGGCAT  1467

Query 1348  GAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCA  1421
            ||||..||..|||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||..||
Sbjct 1468  GAGCAGGGCAGCCGTGAACCCCCACAGCACTTTGGTGGCCCTCCACCCCTCATCTCACCCAAGCCCCAGCAGCA  1541

Query 1422  TGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCC  1495
            ..|.|.||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|..|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1542  CACCGTACCCACAGCCCTCTGGAACCCAGTGTCTCTGATGGACAATGCTCTGGAGACGCGGCGGGCCGAGAGCC  1615

Query 1496  ACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGG  1569
            ||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1616  ACTCTCTGCATAGCCACCCGACTGCTTTTGAGCCCAGCCGCCAGGCCGCCGTGCCACTGGTGAAGGTGGAGCGA  1689

Query 1570  GTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACC  1643
            ||.|..|||.|.|||||.||||||||   |||.||||||||||||.|..|.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1690  GTTTATTGCTCAGAGAAGGCAGAGGA---GCCCCGGAAGCGTGAGGCCACACCACTGGACAAATACCAGCCACC  1760

Query 1644  TCCGCCGCCACCA------CGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCC  1711
            .||.||.||||||      ||.||||.|||.||.|||||||..|||.||||.|..|.|||.||.|||||.||||
Sbjct 1761  ACCACCACCACCACCACCGCGGGAGGCAGGAAGTCTGGAGCCTCAGACCTTTCCCCACGGACCTGGGCCTTTCC  1834

Query 1712  TGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTC  1785
            |..||||.||.||.|||||.||.|||||||||.||||||||||||||.||||.||..|.|||||..||.|||||
Sbjct 1835  TTACTGAACTTGAAAAGTCAACACAGACCATCTTGGGCCAGCAGCGGCCCTCTCTTTCCCAGGCAACCTCCTTC  1908

Query 1786  GGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGC-CCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCT  1858
            |||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||.|.| |||||..||.| |||.||||||.||.||||
Sbjct 1909  GGGGAGCTCAGTGGGCCTCTGAAACCAGGCTCTCCGTACTGCCACCCCACAGCGA-GGGGCCCCGATCCAGCCT  1981

Query 1859  ACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGG  1932
            |||||||.||||||||.||.||||||||.||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1982  ACATCTACGATGAGTTTCTTCAGCAGCGACGGAAGCTGGTCAGCAAACTGGACCTGGAGGAACGCAGGCGGCGC  2055

Query 1933  GAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGC  2006
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2056  GAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGACCTCGATGACTCGTACGACGAGAGTGACGAGGAGGAGGTCAGGGC  2129

Query 2007  CCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAAC  2080
            .||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2130  ACACCTCCGCTGTGTGGCTGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACATCCTCGGAGAAGCTAGAGTTCTTGCAAC  2203

Query 2081  TTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTG  2154
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||..||||||||.||.|||||||.
Sbjct 2204  TTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGGAGGAACTGGTGGCGCAGAAGCGCCGGAAGCGGAGGCGGATGCTC  2277

Query 2155  CGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTAC  2228
            .|||||||||||||||||||.||..|..|||||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 2278  AGAGAGAGAAGCCCGTCGCCACCTGCCGTTCAGTGCAAGCGACAGACGCCTTCCCCCAGGCTGGCTCTGTCCAC  2351

Query 2229  CCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACC  2302
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||.|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2352  CCGCTACAGCCCCGACGAGATGAACAACAGCCCCAACTTTGAGGAGAAGAGGAAGTTCCTGACCTTCTTCAACT  2425

Query 2303  TGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAG  2376
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||..
Sbjct 2426  TGACGCACATCAGTGCGGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGGCTTGTTGAAATGCTCCGAGCCATGAAGCAGAGA  2499

Query 2377  GCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACC  2450
            ||||||||.||||||      |||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2500  GCACTGTCCGCAGCA------GACTCAGTGACAAACTCTTCGAGGGACAGTCCTCCCGTCTCCCTGAGTGAACC  2567

Query 2451  AGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGG  2524
            ||||||.||||.|||..||||.||...|||..||||.||.||.|...||||.||||||||.||..||||||||.
Sbjct 2568  AGCCACACAGCCAGCTCCTCTAGAGACGGATCAGCCTGTCGGGGTCCCTGCCTCCTTGTCAGATGTCCCAAAGA  2641

Query 2525  CCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGC  2598
            ||.|||||.|.||||..|||||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||..||||||.||||.
Sbjct 2642  CCACGGAGACCGGGAGACTGGAACAGCTCCGGCCCCAGGAGCTCTTGAGAGTCCAGGAGCCGGCTCCTCCCAGT  2715

Query 2599  GGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGC  2672
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||||||||
Sbjct 2716  GGTGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCTGGTGGCAAGAAGAGCCTGAGCATGCTCCATTACCTCCGGGGCGC  2789

Query 2673  TGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGG  2746
            .||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 2790  CGCGCCCAAGGACATTCCTGTGCCGTTGTCTCACAGCATCAACGGGAAGAGCAAGCCCTGGGAGCCTTTCGTGG  2863

Query 2747  CAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGG  2820
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2864  CCGAAGAGTTTGCACATCAATTCCACGAGTCCGTGCTGCAGTCCACACAGAAGGCTCTGCAGAAGCATAAAGGG  2937

Query 2821  AGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCA  2894
            |.|...|||.||||.|||||||||||||.||||||.||.||||||.|..||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2938  AACTCTGCTTTGCTATCTGCAGAGCAGAGCCACAAAGTCGACACGGCAATCCACTACAACATTCCCGAGCTGCA  3011

Query 2895  GTCCTCCAGCCGCG-CCCCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCA  2967
            ||||||||||.|.| ||||| ..||||||||||||||.||.||||||||.||.|..|..|||||||||||.||.
Sbjct 3012  GTCCTCCAGCAGGGTCCCCT-TGCCCCAGCACAATGGACAACAGGAGCCTCCAATGGGGAGGAAGGGCCCTCCT  3084

Query 2968  ACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGA-GAAGATGAGGAGGAAG  3040
            |..||||||..|||||.||||||.||||||||....||||||||....||    ||| ||||.|   |||||||
Sbjct 3085  ATGCAGGAGGCGGACCAGGACTCTGAGGAGGACTCTGAGGAGGACAGCGA----GGAGGAAGCT---GAGGAAG  3151

Query 3041  TCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTG  3114
            .|||.|.||||.|||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3152  CCCCGAGGCGCCAGTGGCAAGGGATTGAGGCAATCTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAACCTG  3225

Query 3115  GAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCA  3188
            ||||||||||||.|.|||||.||.||..|.||..|||||||.|.|.|||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 3226  GAGCGGCAGGTGCTGCAGACGCAGTGCCGGCGGTTGGAGGCGCAGAACTACAGCCTCAGCCTGACTGCGGAGCA  3299

Query 3189  GCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAG  3262
            |||.||.||||||.||||||||.|..||||.||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.|
Sbjct 3300  GCTGTCTCACAGCATGGCGGAGCTTCGGAGTCAGAAACAGAAGATGGTCTCTGAGCGGGAGCGGCTCCAGGCGG  3373

Query 3263  AACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCC  3336
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct 3374  AGCTGGACCACTTGCGGAAGTGCCTTGCCTTGCCCACCATGCACTGGCCTAGGGGCTACTTTAAGGGATATCCG  3447

Query 3337  AGG  3339
            |||
Sbjct 3448  AGG  3450