Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07852
• Subject: XM_006531149.3
• Aligned Length: 3451
• Identities: 2838
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAAGGGTCCTCACTGAGCAGCGAGTCATCTCCAGTGTCCTCTCCAGCCACCAACCATAGCTCTCCAGCTAG  74

Query    1  -------------------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCTGGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCG  55
                               ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct   75  CACGCCCAAACGAGTGCCCATGGGCCCCATCATCGTCCCCCCCGGGGGTCACAGTGTCCCCAGCACTCCCCCAG  148

Query   56  TGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAGGAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCT--CCA  127
            ||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||..|.||||  |.|
Sbjct  149  TGGTCACTATTGCCCCCACTAAAACCGTCAATGGAGTCTGGAGAAGCGAGAGCCGCCAGGACTCTGGCTCACGA  222

Query  128  GG-AGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATT-GTGGAGCCCCCGCTCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAG  199
            || |||||||||   ||||||||.||||| ||| ||||||||.||.|||.|.|||||.|||||.|.|||.||.|
Sbjct  223  GGCAGCAGCAGT---GGTCGGGAGCGCCT-ATTGGTGGAGCCACCTCTCGCCCAGGAAAAGGCTGCGGGCCCCG  292

Query  200  CCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCCCCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGC  273
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||.||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  293  CCATCCCCTCCCACCTACTCAGCACCCCGTACCCCTTTGGCCTTTCCCCCGGCTCAGTTGTACAGGACTCCCGC  366

Query  274  TTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCCCAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAG  347
            ||||..||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||
Sbjct  367  TTCCAACCACTCAACCTCCAGCGGCCTGTGCACCATGTGGTGCCCCCCAGCACGGTGACTGAGGACTACTTGAG  440

Query  348  AAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCACTGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCA  421
            |||||||||||||||||||||..|.||.|||.|.|||||||||||..|||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  441  AAGCTTCCGGCCCTACCACACTGCTGAAGACTTACGCATGTCCTCCTTGCCTCCGCTTGGCCTGGACCCAGCCA  514

Query  422  CTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGAC  495
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  515  CCGCCGCAGCCTACTATCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCATTCCCCCACCCGGCCTTCAGGATGGATGAC  588

Query  496  TCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCC  569
            |||||.||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  589  TCCTATTGCCTGTCAGCCTTAAGGTCTCCGTTCTACCCCATCCCCACCCCTGGCTCCCTGCCTCCACTGCATCC  662

Query  570  ATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGCTCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGC  643
            .||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  663  GTCGGCGATGCACCTGCATCTCTCCGGCGTACGGTATCCTCCTGAGCTCTCCCACTCGTCCCTGGCGGCGCTAC  736

Query  644  ACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGACGAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGC  717
            ||||||||||.|||||..|||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.||..|||||||||      |.
Sbjct  737  ACTCGGAGCGGATGTCCAGCCTCAGTGCAGAGAGGTTGCAAATGGACGAGGAACTGCGGCGGGAGA------GA  804

Query  718  GAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAAGGAACGTGAGCGCG---AACGCGAGAA  788
            |||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|   |.||.|||||
Sbjct  805  GAGCGAGAGCGGGAACGGGAACGGGAGGCCGACCGGGAGCGGGAGAAGGAGCGGGAGCGGGAGCAGCGGGAGAA  878

Query  789  GGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCGAGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGC  862
            ||||||.|||.|.|||..||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  879  GGAGCGGGAGAAGGAGCTGGAGCGCGAGCGGGAGAAGGAACGGGAGCGCGAGCTGGAGCGGCAGCGGGAGCAGC  952

Query  863  GGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGC---CCAGCTTCCTGCCCGTGGCCGAGCTGCAT  933
            ||||..|||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||   |||.|||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  953  GGGCGAGGGAGAAGGAGCTGCTGGCTGCCAAGGCCTTAGAGCCCACCACCTTCCTGCCTGTGGCCGAGCTGCAC  1026

Query  934  GGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCT  1007
            ||.||.||.||.||...|||.|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  GGACTCCGAGGTCACAGCACGGAGGAGCGGCCCAAGCCCTCGGAGCAGCTGACCCCAACCCGAGCAGAGAAGCT  1100

Query 1008  GAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGGTGCCCACCCCACACCACACGG  1081
            ||||||.|..|||.|||||||||||||||||||.||.|||||..||||.||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct 1101  GAAGGACGTGGGCTTGCAGGCGCCCAAGCCCGTGCAGCACCCTCTGCACCCAGTGCCTGCCCCACACCACACGG  1174

Query 1082  TGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCTGCCACAGCCCTGCTGATCCAG  1155
            ||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.|.|||||.||..||||.|||||||||||||||
Sbjct 1175  TGCCCAGCCTCATCTCCAGCCACGGCATCTTCTCTCTGCCTGGAAGCAGCGCCACCACCGCCCTGCTGATCCAG  1248

Query 1156  CGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGAGAAGGAGGACCGGCAGTCTCA  1229
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1249  CGCACCAACGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCACGGCAGCGCCGCCTGCGGCAGGAGAAGGAAGACCGCCAGTCCCA  1322

Query 1230  GGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGCCCCCGGTGCCGGCGGAGGCAG  1303
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||||.||||||..|.|||||.|
Sbjct 1323  GGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTCCTGGAGCAGCACCTAGACCTGGGCCGGCCCCTGGTGCCCACAGAGGCGG  1396

Query 1304  AGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGTGGCCGTGACCCTCCGCAGCAC  1377
            ||||||||||.|||||   |||||||||||||.|||||||.||.||||..||..|||||||.||.||.||||||
Sbjct 1397  AGCACAGGCCCGAGAG---CACCAGGCCAGGAACAAACCGGCATGAGCAGGGCAGCCGTGAACCCCCACAGCAC  1467

Query 1378  TTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACCCACGGCCCTCTGGAACCCCGT  1451
            |||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||||..||..|.|.||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1468  TTTGGTGGCCCTCCACCCCTCATCTCACCCAAGCCCCAGCAGCACACCGTACCCACAGCCCTCTGGAACCCAGT  1541

Query 1452  GTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGCACAGCCACCCGGCTGCATTTG  1525
            |||.|||||||||||..|..|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||.||||
Sbjct 1542  GTCTCTGATGGACAATGCTCTGGAGACGCGGCGGGCCGAGAGCCACTCTCTGCATAGCCACCCGACTGCTTTTG  1615

Query 1526  AGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGCCCGGAGAAAGCAGAGGAGGGG  1599
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|..|||.|.|||||.||||||||   |
Sbjct 1616  AGCCCAGCCGCCAGGCCGCCGTGCCACTGGTGAAGGTGGAGCGAGTTTATTGCTCAGAGAAGGCAGAGGA---G  1686

Query 1600  CCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCCACCA------CGAGAGGGAGG  1667
            ||.||||||||||||.|..|.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||      ||.||||.|||
Sbjct 1687  CCCCGGAAGCGTGAGGCCACACCACTGGACAAATACCAGCCACCACCACCACCACCACCACCGCGGGAGGCAGG  1760

Query 1668  GAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGAAGTCCACCCAGACCA  1741
            .||.|||||||..|||.||||.|..|.|||.||.|||||.|||||..||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 1761  AAGTCTGGAGCCTCAGACCTTTCCCCACGGACCTGGGCCTTTCCTTACTGAACTTGAAAAGTCAACACAGACCA  1834

Query 1742  TCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGACCCCTGAAGCCTGGC  1815
            ||.||||||||||||||.||||.||..|.|||||..||.||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1835  TCTTGGGCCAGCAGCGGCCCTCTCTTTCCCAGGCAACCTCCTTCGGGGAGCTCAGTGGGCCTCTGAAACCAGGC  1908

Query 1816  TCGCCCTACCGGC-CCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTTCCTGCAGCAGCGCC  1888
            ||.||.|||.|.| |||||..||.| |||.||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1909  TCTCCGTACTGCCACCCCACAGCGA-GGGGCCCCGATCCAGCCTACATCTACGATGAGTTTCTTCAGCAGCGAC  1981

Query 1889  GGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGAC  1962
            |||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982  GGAAGCTGGTCAGCAAACTGGACCTGGAGGAACGCAGGCGGCGCGAGGCCCAGGAGAAAGGGTACTACTACGAC  2055

Query 1963  CTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTGGCCGAGCAGCCGCC  2036
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2056  CTCGATGACTCGTACGACGAGAGTGACGAGGAGGAGGTCAGGGCACACCTCCGCTGTGTGGCTGAGCAGCCGCC  2129

Query 2037  CCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGG  2110
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130  CCTCAAACTGGACACATCCTCGGAGAAGCTAGAGTTCTTGCAACTTTTTGGCTTGACCACCCAACAGCAGAAGG  2203

Query 2111  AGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGTCGCCCCCAACAATT  2184
            |||||.|||||||.||||||||..||||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||||.||..|..||
Sbjct 2204  AGGAACTGGTGGCGCAGAAGCGCCGGAAGCGGAGGCGGATGCTCAGAGAGAGAAGCCCGTCGCCACCTGCCGTT  2277

Query 2185  CAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGATGAGATGAACAACAG  2258
            |||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2278  CAGTGCAAGCGACAGACGCCTTCCCCCAGGCTGGCTCTGTCCACCCGCTACAGCCCCGACGAGATGAACAACAG  2351

Query 2259  TCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGCTGAGAAGAGGAAAG  2332
            .||||||||.||.||.||||.|||||||||||||.||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 2352  CCCCAACTTTGAGGAGAAGAGGAAGTTCCTGACCTTCTTCAACTTGACGCACATCAGTGCGGAGAAGAGGAAAG  2425

Query 2333  ACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAGTGGCCGACTCCTTG  2406
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||..||||||||.||||||      |||||..||
Sbjct 2426  ACAAAGAGAGGCTTGTTGAAATGCTCCGAGCCATGAAGCAGAGAGCACTGTCCGCAGCA------GACTCAGTG  2493

Query 2407  ACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCCTCTCTGGATGTGGA  2480
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||..||||.||...|||
Sbjct 2494  ACAAACTCTTCGAGGGACAGTCCTCCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACACAGCCAGCTCCTCTAGAGACGGA  2567

Query 2481  GAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAAGCTGGAACAGGTCC  2554
            ..||||.||.||.|...||||.||||||||.||..||||||||.||.|||||.|.||||..|||||||||.|||
Sbjct 2568  TCAGCCTGTCGGGGTCCCTGCCTCCTTGTCAGATGTCCCAAAGACCACGGAGACCGGGAGACTGGAACAGCTCC  2641

Query 2555  GGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCT  2628
            |||||||||||||.|.||||||||||||||..||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642  GGCCCCAGGAGCTCTTGAGAGTCCAGGAGCCGGCTCCTCCCAGTGGTGAGAAGGCCAGGCTGAGCGAGGCCCCT  2715

Query 2629  GGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATTCCTGTGCCGCTGTC  2702
            ||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2716  GGTGGCAAGAAGAGCCTGAGCATGCTCCATTACCTCCGGGGCGCCGCGCCCAAGGACATTCCTGTGCCGTTGTC  2789

Query 2703  CCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACATCAGTTCCACGAGT  2776
            .|||||||.|||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2790  TCACAGCATCAACGGGAAGAGCAAGCCCTGGGAGCCTTTCGTGGCCGAAGAGTTTGCACATCAATTCCACGAGT  2863

Query 2777  CAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGTCTGCAGAGCAGAAC  2850
            |.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.|...|||.||||.|||||||||||||.|
Sbjct 2864  CCGTGCTGCAGTCCACACAGAAGGCTCTGCAGAAGCATAAAGGGAACTCTGCTTTGCTATCTGCAGAGCAGAGC  2937

Query 2851  CACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCG-CCCCTCCACCCCAGC  2923
            |||||.||.||||||.|..||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.| ||||| ..|||||||
Sbjct 2938  CACAAAGTCGACACGGCAATCCACTACAACATTCCCGAGCTGCAGTCCTCCAGCAGGGTCCCCT-TGCCCCAGC  3010

Query 2924  ACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCGGGACTCGGAGGAG  2997
            |||||||.||.||||||||.||.|..|..|||||||||||.||.|..||||||..|||||.||||||.||||||
Sbjct 3011  ACAATGGACAACAGGAGCCTCCAATGGGGAGGAAGGGCCCTCCTATGCAGGAGGCGGACCAGGACTCTGAGGAG  3084

Query 2998  GAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGA-GAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGCAAGGGATCGAGG  3070
            ||....||||||||....||    ||| ||||.|   |||||||.|||.|.||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 3085  GACTCTGAGGAGGACAGCGA----GGAGGAAGCT---GAGGAAGCCCCGAGGCGCCAGTGGCAAGGGATTGAGG  3151

Query 3071  CCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAGACACAATGTAGA  3144
            |..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||.||..|.
Sbjct 3152  CAATCTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAACCTGGAGCGGCAGGTGCTGCAGACGCAGTGCCGG  3225

Query 3145  CGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGCGGAGTTGAGGAG  3218
            ||..|||||||.|.|.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||.||||||||.|..||||
Sbjct 3226  CGGTTGGAGGCGCAGAACTACAGCCTCAGCCTGACTGCGGAGCAGCTGTCTCACAGCATGGCGGAGCTTCGGAG  3299

Query 3219  CCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAAAGTGCCTTGCCT  3292
            .||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 3300  TCAGAAACAGAAGATGGTCTCTGAGCGGGAGCGGCTCCAGGCGGAGCTGGACCACTTGCGGAAGTGCCTTGCCT  3373

Query 3293  TGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3339
            ||||..|.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||
Sbjct 3374  TGCCCACCATGCACTGGCCTAGGGGCTACTTTAAGGGATATCCGAGG  3420