Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07852
• Subject: XM_011522965.3
• Aligned Length: 3759
• Identities: 3338
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACCGAGGCCACCGCTGCTCCTCGGGCTACCAGGCCAGGGCAGGGGGGCCAGGGGCTGGGCCAGGCAGTGCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATGGACCAGAAGAGCCCCAAGTGGAAAGTGCTCCTGCCGGGCATGAGCCATGAGCCCAAGTCCCCTTCGCTAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGATGCTTTCCACCGCGACCAGGACCACCGCCACCGTCAACCCCCTCACCCCCTCGCCGCTCAATGGCGCCCTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTGCCCAGCGGCAGCCCCGCCACCAGCAGCGCGCTGTCGGCCCAGGCCGCGCCATCCTCCAGCTTTGCCGCCGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GCTGCGCAAGCTCGCCAAACAGGCGGAGGAGCCCAGAGGGTCCTCACTGAGCAGCGAGTCGTCCCCCGTGTCCT  370

Query    1  --------------------------------------------------ATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCT  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCGGCCACCAACCACAGCTCCCCCGCCAGCACACCCAAGCGCGTGCCCATGGGCCCTATCATCGTCCCCCCT  444

Query   25  GGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAG  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGGCCACAGCGTGCCCAGCACCCCCCCCGTGGTGACCATCGCTCCAACCAAAACCGTGAATGGTGTCTGGAG  518

Query   99  GAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGC  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGTGAGAGCCGGCAGGATGCCGGCTCCAGGAGCAGCAGTGGAGGTCGGGAACGCCTCATTGTGGAGCCCCCGC  592

Query  173  TCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCC  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCTCAGGAGAAGGCAGGGGGACCAGCCATCCCCTCGCACCTGCTCAGCACCCCCTACCCCTTCGGCCTCTCC  666

Query  247  CCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCC  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAGCTCAGTTGTGCAGGATTCCCGCTTCCCGCCACTCAACCTCCAGCGGCCCGTGCACCACGTGGTGCCCCC  740

Query  321  CAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCAC  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTACCGTGACCGAGGACTACCTGAGAAGCTTCCGGCCCTACCACACCACCGACGACCTCCGCATGTCCTCAC  814

Query  395  TGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTC  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCCTCCCCTCGGCCTGGACCCGGCCACTGCTGCAGCCTACTACCACCCCAGCTACCTGGCCCCACACCCCTTC  888

Query  469  CCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCAC  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCCACCCGGCCTTCAGGATGGACGACTCCTACTGCCTGTCTGCCCTGAGGTCCCCGTTCTACCCCATCCCCAC  962

Query  543  CCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGC  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCGGCTCCCTGCCCCCACTGCACCCATCAGCGATGCACCTGCACCTCTCTGGGGTCCGCTACCCTCCCGAGC  1036

Query  617  TCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGAC  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTCCCACTCATCCCTGGCAGCGCTGCACTCGGAGCGCATGTCTGGCCTCAGCGCGGAGAGGCTGCAGATGGAC  1110

Query  691  GAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAA  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGAGCTAAGGCGGGAGAGGGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGTGAGCGTGAGGCTGACCGCGAGCGGGAGAA  1184

Query  765  GGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCG  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAACGTGAGCGCGAACGCGAGAAGGAGCGCGAGCAAGAGAAGGAGCGTGAGCGTGAGAAGGAGCGCGAGCGCG  1258

Query  839  AGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTC  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTGGAGCGCCAGCGGGAGCAGCGGGCCCGGGAGAAGGAGCTGCTGGCCGCCAAGGCCCTGGAGCCCAGCTTC  1332

Query  913  CTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGAC  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCCCGTGGCCGAGCTGCATGGGCTGCGTGGCCATGCCACTGAGGAGCGGGGCAAGCCCTCGGAGCAGCTGAC  1406

Query  987  CCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGG  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCCAACCCGAGCAGAGAAGCTGAAGGATGCCGGCCTGCAGGCGCCCAAGCCCGTCCAACACCCCTTGCATCCGG  1480

Query 1061  TGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCT  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCCCACCCCACACCACACGGTGCCCAGCCTCATCTCCAACCATGGCATCTTCTCTCTGCCTAGCAGCAGTGCT  1554

Query 1135  GCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGA  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCACAGCCCTGCTGATCCAGCGCACCAATGAGGAGGAGAAGTGGCTGGCGCGGCAGCGGCGGCTGCGGCAGGA  1628

Query 1209  GAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGC  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAAGGAGGACCGGCAGTCTCAGGTGTCCGAGTTCCGGCAGCAGGTGCTGGAGCAGCACCTGGATATGGGCCGGC  1702

Query 1283  CCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGT  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCCGGTGCCGGCGGAGGCAGAGCACAGGCCGGAGAGCACCACCAGGCCAGGACCAAACCGTCACGAGCCAGGT  1776

Query 1357  GGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACC  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGCCGTGACCCTCCGCAGCACTTTGGGGGGCCACCACCTCTGATTTCGCCCAAGCCCCAGCTCCATGCTGCACC  1850

Query 1431  CACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGC  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACGGCCCTCTGGAACCCCGTGTCCCTGATGGACAACACCTTGGAGACGCGGCGGGCCGAAAGCCACTCTCTGC  1924

Query 1505  ACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGC  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACAGCCACCCGGCTGCATTTGAGCCCAGCCGCCAGGCAGCCGTGCCGCTGGTGAAGGTGGAGCGGGTCTTCTGC  1998

Query 1579  CCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCC  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCGGAGAAAGCAGAGGAGGGGCCACGGAAGCGTGAGCCTGCCCCTCTGGACAAGTACCAGCCACCTCCGCCGCC  2072

Query 1653  ACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGA  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACCACGAGAGGGAGGGAGCCTGGAGCACCAGCCCTTCCTGCCCGGGCCCGGGCCCTTCCTGGCTGAGCTCGAGA  2146

Query 1727  AGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGA  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGTCCACCCAGACCATCCTGGGCCAGCAGCGGGCCTCCCTCCCACAGGCGGCCACCTTCGGGGAGCTCAGCGGA  2220

Query 1801  CCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTT  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCCCTGAAGCCTGGCTCGCCCTACCGGCCCCCAGTGCCACGGGCCCCCGACCCTGCCTACATCTATGATGAGTT  2294

Query 1875  CCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAG  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTGCAGCAGCGCCGGAGGCTGGTCAGCAAGCTGGACCTGGAGGAGCGCAGGCGGCGGGAGGCCCAGGAGAAAG  2368

Query 1949  GGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTG  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGTACTACTACGACCTCGATGACTCTTACGACGAGAGCGATGAGGAGGAGGTCAGGGCCCACCTCCGTTGCGTG  2442

Query 2023  GCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCAC  2096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCCGAGCAGCCGCCCCTCAAACTGGACACGTCCTCTGAGAAGCTAGAGTTTTTGCAACTTTTTGGCTTGACCAC  2516

Query 2097  CCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGT  2170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCAACAGCAGAAGGAGGAATTGGTGGCCCAGAAGCGGAGGAAGCGGCGGAGGATGCTGCGAGAGAGAAGCCCGT  2590

Query 2171  CGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGAT  2244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CGCCCCCAACAATTCAGAGCAAGCGGCAGACGCCTTCACCGAGACTGGCGCTGTCTACCCGCTACAGCCCTGAT  2664

Query 2245  GAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGC  2318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAGATGAACAACAGTCCCAACTTCGAAGAAAAGAAGAAGTTCCTGACCATCTTCAACCTGACCCACATCAGCGC  2738

Query 2319  TGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAG  2392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGAGAAGAGGAAAGACAAAGAGAGACTTGTTGAAATGCTCCGTGCCATGAAGCAGAAGGCACTGTCAGCAGCAG  2812

Query 2393  TGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCC  2466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TGGCCGACTCCTTGACAAACTCTCCGAGGGACAGTCCTGCCGTCTCCCTGAGTGAACCAGCCACGCAGCAAGCC  2886

Query 2467  TCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGCTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAA  2540
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TCTCTGGATGTGGAGAAGCCGGTTGGTGTTGCTGCTTCCTTGTCTGACATCCCAAAGGCCGCGGAGCCTGGGAA  2960

Query 2541  GCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGC  2614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCTGGAACAGGTCCGGCCCCAGGAGCTGTCGAGAGTCCAGGAGCTAGCTCCTGCCAGCGGGGAGAAGGCCAGGC  3034

Query 2615  TGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATT  2688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TGAGCGAGGCCCCTGGAGGCAAAAAGAGTCTGAGCATGCTTCACTATATCCGGGGCGCTGCACCCAAGGACATT  3108

Query 2689  CCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACA  2762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CCTGTGCCGCTGTCCCACAGCACCAATGGGAAGAGCAAGCCGTGGGAGCCCTTTGTGGCAGAAGAGTTTGCACA  3182

Query 2763  TCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGT  2836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TCAGTTCCACGAGTCAGTGCTGCAGTCCACCCAGAAGGCCCTGCAGAAGCATAAAGGGAGCGTGGCTGTGCTGT  3256

Query 2837  CTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCC  2910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CTGCAGAGCAGAACCACAAGGTTGACACGTCCGTCCACTACAACATTCCTGAGCTGCAGTCCTCCAGCCGCGCC  3330

Query 2911  CCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCG  2984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  CCTCCACCCCAGCACAATGGGCAGCAGGAGCCCCCCACTGCAAGGAAGGGCCCCCCAACCCAGGAGTTGGACCG  3404

Query 2985  GGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGC  3058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GGACTCGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGATGATGAAGATGGAGAAGATGAGGAGGAAGTCCCCAAGCGCAAGTGGC  3478

Query 3059  AAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAG  3132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  AAGGGATCGAGGCCGTTTTTGAAGCTTACCAGGAACACATAGAAGAGCAAAATCTGGAGCGGCAGGTGTTACAG  3552

Query 3133  ACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGC  3206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  ACACAATGTAGACGACTGGAGGCCCGGCACTACAGCCTCAGCCTGACGGCAGAGCAGCTCTCCCACAGCGTGGC  3626

Query 3207  GGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAA  3280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  GGAGTTGAGGAGCCAGAAACAGAAGATGGTCTCAGAAAGGGAGCGGCTCCAGGCAGAACTGGACCACTTACGAA  3700

Query 3281  AGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3339
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  AGTGCCTTGCCTTGCCTGCAATGCACTGGCCTAGGGGCTACCTGAAGGGATATCCCAGG  3759