Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07859
- Subject:
- NM_019677.2
- Aligned Length:
- 3653
- Identities:
- 3130
- Gaps:
- 139
Alignment
Query 1 ATGGCCGGGGCTCAACCCGGAGTGCACGCCTTGCAACTCAAGCCCGTGTGCGTGTCCGACAGCCTCAAGAAGGG 74
|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGGGCTCAGCCCGGAGTGCACGCCTTGCAACTCAAGCCCGTGTGCGTGTCCGACAGCCTCAAGAAGGG 74
Query 75 CACCAAATTCGTCAAGTGGGATGATGACTCAACTATTGTTACTCCAATTATTTTGAGGACTGACCCTCAGGGAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CACCAAATTCGTCAAGTGGGATGATGACTCCACTATTGTTACTCCAATTATTTTGAGGACTGATCCTCAGGGAT 148
Query 149 TTTTCTTTTACTGGACAGATCAAAACAAGGAGACAGAGCTACTGGATCTCAGCCTTGTCAAAGATGCCAGATGT 222
|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 TTTTCTTTTACTGGACAGACCAGAATAAGGAGACGGAGCTGTTAGATCTCAGCCTTGTCAAGGATGCCAGGTGT 222
Query 223 GGGAGACACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAATTACGTGAACTTTTGGATGTGGGGAACATCGGGCGCCTGGA 296
||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|.|.||||
Sbjct 223 GGGAAGCACGCCAAAGCTCCCAAGGACCCCAAGTTGCGTGAACTTCTGGATGTTGGGAACATCGGACACTTGGA 296
Query 297 GCAGCGCATGATCACAGTGGTGTATGGGCCTGACCTCGTGAACATCTCCCATTTGAATCTCGTGGCTTTCCAAG 370
.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297 ACAGCGCATGATAACTGTGGTGTATGGACCAGACCTGGTGAACATTTCCCACTTGAATCTTGTGGCTTTTCAAG 370
Query 371 AAGAAGTGGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGTTTGGCAACAAACCTGCTGGCCCAAAACATGTCCAGG 444
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 371 AGGAAGTAGCCAAGGAATGGACAAATGAGGTTTTCAGCTTGGCAACAAACCTGCTGGCTCAGAACATGTCCAGG 444
Query 445 GATGCATTTCTGGAAAAAGCCTATACTAAACTTAAGCTGCAAGTCACTCCAGAAGGGCGTATTCCTCTCAAAAA 518
||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 445 GACGCATTTCTGGAGAAAGCATATACTAAGCTCAAGCTCCAGGTCACCCCAGAAGGCCGCATTCCTCTTAAAAA 518
Query 519 CATATATCGCTTGTTTTCAGCAGATCGGAAGCGAGTTGAAACTGCTTTAGAGGCTTGTAGTCTTCCATCTTCAA 592
|||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CATCTATCGATTGTTCTCAGCAGACCGGAAGCGCGTTGAAACTGCACTAGAGGCTTGTAGTCTTCCATCTTCGA 592
Query 593 GGAATGATTCAATACCTCAAGAAGATTTCACTCCAGAAGTGTACAGAGTTTTCCTCAACAACCTTTGCCCTCGA 666
|||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 593 GGAATGACTCCATTCCCCAAGAGGACTTCACTCCAGATGTATACAGAGTTTTCCTGAACAATCTCTGTCCCCGA 666
Query 667 CCTGAAATTGATAACATCTTTTCAGAATTTGGTGCAAAAAGCAAACCATATCTTACCGTTGATCAGATGATGGA 740
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTGAAATTGATAACATCTTTTCTGAATTTGGTGCCAAAAGCAAACCGTACCTGACGGTTGATCAGATGATGGA 740
Query 741 TTTTATCAACCTTAAGCAGCGAGATCCTCGGCTTAATGAAATACTTTATCCACCTCTAAAACAAGAGCAAGTCC 814
|||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 741 TTTTATCAACCTTAAGCAGAGAGATCCCCGGCTCAATGAAATCCTTTACCCACCTCTGAAGCAGGAGCAGGTCC 814
Query 815 AAGTATTGATTGAGAAGTATGAACCCAACAACAGCCTCGCCAGAAAAGGACAAATATCAGTGGATGGGTTCATG 888
||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||..|||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 815 AAGTGTTGATTGAGAAATATGAGCCCAACAGCAGCCTCGCCAAGAAAGGGCAGATGTCAGTGGATGGATTCATG 888
Query 889 CGCTATCTGAGTGGAGAAGAAAACGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAATGAAGACATGTCTCAGCC 962
|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 CGCTACCTGAGCGGAGAAGAAAATGGAGTCGTTTCACCTGAGAAACTGGATTTGAACGAAGACATGTCTCAGCC 962
Query 963 CCTTTCTCACTATTTCATTAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAACTGGCTGGAAACTCCTCTG 1036
|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||
Sbjct 963 CCTGTCTCACTATTTCATCAATTCCTCGCACAACACCTACCTCACAGCTGGCCAGTTGGCTGGGAACTCGTCTG 1036
Query 1037 TTGAGATGTATCGCCAAGTGCTCCTGTCTGGTTGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGACGGACTGCA 1110
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.
Sbjct 1037 TAGAGATGTATCGCCAGGTGCTTCTGTCTGGATGTCGCTGTGTGGAGCTGGACTGCTGGAAGGGAAGGACCGCT 1110
Query 1111 GAAGAGGAACCTGTCATCACCCATGGCTTCACCATGACAACTGAAATATCTTTCAAGGAAGTGATAGAAGCAAT 1184
||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111 GAGGAAGAGCCTGTCATTACCCATGGATTCACCATGACAACAGAAATATCCTTCAAGGAAGTCATAGAAGCCAT 1184
Query 1185 TGCGGAGTGTGCATTTAAGACTTCACCTTTTCCAATTCTCCTTTCGTTTGAGAACCATGTGGATTCCCCAAAGC 1258
.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185 CGCAGAGTGTGCGTTCAAGACGTCTCCTTTCCCCATCCTCCTTTCCTTTGAGAACCACGTGGATTCCCCGAAGC 1258
Query 1259 AGCAAGCCAAGATGGCGGAGTACTGCCGACTGATCTTTGGGGATGCCCTTCTCATGGAGCCCCTGGAAAAATAT 1332
|.||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1259 AACAAGCCAAGATGGCCGAGTATTGCCGATTAATCTTTGGTGATGCCCTCCTGATGGAACCACTGGAAAAATAC 1332
Query 1333 CCACTGGAATCTGGAGTTCCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATTTTGGTGAAAAATAAGAAGAA 1406
||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 CCACTGGAATCTGGGGTACCTCTTCCAAGCCCTATGGATTTAATGTATAAAATCTTGGTGAAAAACAAGAAGAA 1406
Query 1407 ATCACACAAGTCATCAGAAGGAAGCGGCAAAAAGAAGCTCTCAGAACAAGCCTCCAACACCTACAGTGACTCCT 1480
.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 GTCGCACAAGTCGTCAGAGGGAAGTGGTAAGAAGAAGCTTTCAGAGCAAGCTTCCAACACCTACAGCGACTCCT 1480
Query 1481 CCAGCATGTTCGAGCCCTCATCCCCAGGAGCCGGAGAAGCTGATACGGAAAGTGACGACGACGATGATGATGAT 1554
||||..||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1481 CCAGTGTGTTCGAGCCTTCGTCTCCAGGAGCTGGGGAAGCAGATACGGAGAGTGATGACGATGACGACGACGAT 1554
Query 1555 GACTGTAAAAAATCTTCAATGGATGAGGGGACTGCTGGAAGTGAGGCTATGGCCACAGAAGAAATGTCTAATCT 1628
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1555 GACTGTAAAAAGTCTTCCATGGATGAGGGGACAGCTGGCAGCGAAGCCATGGCCACAGAAGAGATGTCTAACCT 1628
Query 1629 GGTGAACTATATTCAGCCAGTCAAGTTTGAGTCATTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGTTTTGAAATGT 1702
||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629 GGTGAACTATATTCAGCCTGTCAAGTTTGAGTCCTTTGAAATTTCAAAAAAAAGAAATAAAAGCTTTGAAATGT 1702
Query 1703 CTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTCACCAAGTCTCCAGTGGAATTTGTAGAATATAACAAAATG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703 CTTCCTTCGTGGAAACCAAAGGACTTGAACAACTTACAAAGTCTCCGGTGGAATTTGTAGAATACAACAAGATG 1776
Query 1777 CAGCTTAGCAGGATATATCCAAAAGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTATATGCCTCAGCTCTTCTGGAATGC 1850
||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 CAACTTAGCAGGATATATCCCAAGGGAACACGTGTGGATTCATCCAACTACATGCCTCAACTCTTCTGGAATGC 1850
Query 1851 AGGTTGTCAGATGGTGGCACTTAATTTCCAGACAATGGACCTGGCTATGCAAATAAATATGGGGATGTATGAAT 1924
.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1851 TGGCTGTCAGATGGTGGCGCTCAACTTCCAGACAGTGGATCTAGCTATGCAGATAAACATGGGCATGTATGAGT 1924
Query 1925 ACAACGGGAAGAGTGGCTACAGATTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCTGACAAGCATTTTGATCCATTTACT 1998
||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACAATGGGAAGAGCGGCTATAGGCTGAAGCCAGAGTTCATGAGGAGGCCGGACAAGCATTTTGATCCATTTACT 1998
Query 1999 GAAGGCATCGTAGATGGGATAGTGGCAAACACTTTGTCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTTCTTTCTGATAA 2072
|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1999 GAAGGAATCGTAGATGGGATAGTGGCCAACACTCTATCTGTTAAGATTATTTCAGGTCAGTTCCTCTCTGATAA 2072
Query 2073 GAAAGTTGGGACTTACGTGGAAGTAGATATGTTTGGTTTGCCTGTGGATACAAGGAGGAAGGCATTTAAGACCA 2146
|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073 GAAAGTTGGGACTTATGTGGAAGTGGATATGTTTGGCTTGCCTGTGGACACAAGGAGGAAGGCATTTAAAACCA 2146
Query 2147 AAACATCCCAAGGAAATGCTGTGAATCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTGTTCAAAAAGGTGGTTCTTCCT 2220
|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2147 AGACATCCCAAGGAAATGCTGTAAACCCTGTCTGGGAAGAAGAACCTATTGTATTCAAAAAGGTAGTTCTACCT 2220
Query 2221 ACTCTGGCCTGTTTGAGAATAGCAGTTTATGAAGAAGGAGGTAAATTCATTGGCCACCGTATCTTGCCAGTGCA 2294
.||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2221 TCTCTGGCCTGTTTGAGGATAGCAGCATATGAAGAGGGAGGCAAATTTATTGGCCACCGGATATTGCCTGTGCA 2294
Query 2295 AGCCATTCGGCCAGGCTATCACTATATCTGTCTAAGGAATGAAAGGAACCAGCCTCTGACGCTGCCTGCTGTCT 2368
.||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2295 GGCTATTCGGCCAGGCTATCACTACATCTGCCTGCGGAATGAGAGGAACCAGCCCCTGACGCTGCCAGCTGTCT 2368
Query 2369 TTGTCTACATAGAAGTGAAAGACTATGTGCCAGACACATATGCAGATGTCATCGAAGCTTTATCAAACCCAATC 2442
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2369 TTGTCTACATAGAAGTCAAAGATTATGTGCCAGACACGTATGCAGATGTAATCGAAGCTCTATCAAACCCAATC 2442
Query 2443 CGATATGTGAACCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAATTGGCTGCTTTGACACTGGAAGATGAAGAAGAAGTAAA 2516
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2443 CGATATGTCAATCTGATGGAACAGAGAGCTAAGCAGCTGGCTGCGTTGACCCTGGAGGATGAAGAGGAAGTAAA 2516
Query 2517 GAAAGAGGCTGATCCTGGAGAAACACCATCAGAGGCTCCAAGTGAAGCGAGAACGACTCCAGCAGAAAATGGGG 2590
|||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||.|.||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2517 GAAGGAGGCTGACCCTGGAGAAACATCTTCCGAGGCTCCAAGCGAAACCAGGACAACGCCAGCAGAGAATGGGG 2590
Query 2591 TGAATCACACTACAACCCTGACACCCAAGCCACCCTCCCAGGCTCTCCACAGCCAGCCAGCTCCAGGTTCTGTA 2664
||||||||||..||.||||..||||||||||.||.||||||||||..|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2591 TGAATCACACCGCATCCCTTGCACCCAAGCCGCCTTCCCAGGCTCCACACAGCCAGCCTGCTCCAGGGTCTGTG 2664
Query 2665 AAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTTATTCAGAGTGTCTTAACAGAAGTGGAAGCACAGACCATCGAAGAACT 2738
||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 2665 AAGGCACCTGCCAAAACAGAAGATCTGATCCAGAGCGTGTTAACAGAAGTAGAGGCGCAAACCATCGAAGAGCT 2738
Query 2739 AAAGCAACAGAAATCGTTTGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTTAAGAGACACC 2812
.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2739 CAAGCAACAGAAATCGTTCGTGAAACTTCAAAAGAAACACTACAAAGAAATGAAAGACCTGGTGAAGAGACACC 2812
Query 2813 ACAAGAAAACCACTGACCTTATCAAAGAACACACTACCAAGTATAATGAAATTCAGAATGACTACTTGAGAAGG 2886
|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2813 ACAAGAAAACCACGGAGCTCATTAAGGAGCACACGACCAAGTACAACGAGATTCAGAATGACTACCTGAGAAGG 2886
Query 2887 AGAGCCGCTTTGGAAAAGTCCGCCAAAAAGGACAGTAAGAAAAAATCGGAACCCAGCAGCCCTGATCATGGTTC 2960
||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 2887 AGGGCAGCCTTGGAGAAGTCCGCCAAAAAGGACAGCAAGAAGAAATCTGAACCCAGCAGCCCTGACCACGGCTC 2960
Query 2961 ATCAACGATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCTGAAATGACCCAAAAGTTAATAGACTTGAAGGACAAAC 3034
||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 2961 ATCAGCCATTGAGCAAGACCTCGCTGCCCTGGATGCAGAAATGACTCAGAAGTTGATAGACTTGAAAGACAAGC 3034
Query 3035 AACAGCAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAACAGTATTATAGTGAAAAATACCAGAAGCGAGAACATATTAAA 3108
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 3035 AACAACAGCAGCTGCTTAATCTTCGGCAAGAGCAGTATTACAGCGAGAAGTACCAAAAGCGAGAACACATTAAA 3108
Query 3109 CTGCTTATTCAAAAGTTGACGGATGTCGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTCAAAGAAATCTG 3182
|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 3109 CTGCTTATTCAGAAGTTGACAGATGTTGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTGAAGGAAATCTG 3182
Query 3183 TGAGAAAGAAAAGAAAGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAAAAGAGGCAGGAGAAGATAACAGAAGCTAAATCCA 3256
.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 3183 CGAGAAAGAGAAGAAGGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAGAAGAGGCAAGAGAAGATAACAGAAGCCAAGTCCA 3256
Query 3257 AAGACAAAAGTCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGGTCATATATCCAGGAAGTGGTGCAGTATATC 3330
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 3257 AAGACAAAAGCCAGATGGAAGAGGAGAAGACAGAGATGATCCGATCGTACATCCAGGAGGTGGTTCAGTACATC 3330
Query 3331 AAGAGGCTAGAAGAAGCGCAAAGTAAACGGCAAGAAAAACTCGTAGAGAAACACAAGGAAATACGTCAGCAGAT 3404
||||||.||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 3331 AAGAGGTTAGAGGAAGCACAAAGTAAAAGACAAGAAAAACTCGTGGAGAAACACAATGAGATCCGCCAGCAGAT 3404
Query 3405 CCTGGATGAAAAGCCCAAGCTGCAGGTGGAGCTGGAGCAAGAATACCAAGACAAATTCAAAAGACTGCCCCTC- 3477
|||.|||||.||||||||| ||.|.|| |||||||
Sbjct 3405 CCTCGATGAGAAGCCCAAG-----GGGGAAG-----------------------------------GCCCCTCC 3438
Query 3478 -GAGATTTTGGAATTCGTGCAGGAAGCCATGAAAGGAAAGATCAGTGAAGACAGCAATCACGGTTCTGCCCCTC 3550
.|| |.||| ||| |.|||..|||||| |.|||| .|.|.||||..|||..|
Sbjct 3439 TCAG-TCTTG----TCG-GAAGGTTGCCATG------AGGATC--------------CCTCTGTTCCCCCCAAC 3486
Query 3551 T---CTCCCTGTCCTCAGACCCTGGAAAAGTGAACCACAAGACTCCCTCCAGTGAGGAGCTGGGAGGAGACATC 3621
| |||| ||.|| ||||| |||| |.|||.||||.
Sbjct 3487 TTTACTCC----CCCCA-ACCCT--------------CAAG---CTCTCAAGTGG------------------- 3519
Query 3622 CCAGGAAAAGAATTTGATACTCCTCTG 3648
Sbjct 3520 --------------------------- 3519