Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07882
- Subject:
- NM_133442.2
- Aligned Length:
- 3232
- Identities:
- 2754
- Gaps:
- 134
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGC--GACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACT 72
|||||| ||| | ||||.||
Sbjct 1 --------------------ATGCCG--------------GGCTGG--------AAGAAGA------------- 19
Query 73 AAATCCGCCAGC--CAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTC 144
|.|||| |||.| |..|| |||| |..||||| |||||| .||||||||||
Sbjct 20 ACATCC-CCATCTGCTTAC-AAGC-----GGAGGAGC----------AGGAGA----------GAGAGGAATTC 66
Query 145 AAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGA 218
||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 67 AAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGA 140
Query 219 TAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG 292
|||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 TAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG 214
Query 293 GTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAG 366
|.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct 215 GCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAA 288
Query 367 AATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTAT 440
|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 289 AATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTAT 362
Query 441 TTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATG 514
.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 363 GTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATG 436
Query 515 ATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACG 588
||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 437 ATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACC 510
Query 589 ATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAG 662
||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 511 ATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAG 584
Query 663 TATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAA 736
.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 585 CATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGA 658
Query 737 CAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCG 810
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 659 CAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCC 732
Query 811 ATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATT 884
.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct 733 GTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCT 806
Query 885 GCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGT 958
.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 807 ACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGT 880
Query 959 TCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGG 1032
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 881 TCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGC 954
Query 1033 CCCGACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAA 1106
||.||||||||.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 955 CCTGACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAA 1025
Query 1107 CATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGA 1180
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 CATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGA 1099
Query 1181 AAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACC 1254
|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1100 AAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACC 1173
Query 1255 ACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGA 1328
||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1174 ACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGA 1247
Query 1329 AACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGA 1402
.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1248 GACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGA 1321
Query 1403 TTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTC 1476
|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.
Sbjct 1322 TTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTG 1395
Query 1477 CGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAG 1550
.||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 AGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAG 1469
Query 1551 TGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTA 1624
||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1470 TGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTA 1543
Query 1625 GAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAA 1698
|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1544 GAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAA 1617
Query 1699 CTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCT 1772
||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1618 CTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCT 1691
Query 1773 CCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCG 1846
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1692 CCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCG 1765
Query 1847 GAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAG 1920
||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1766 GAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAG 1839
Query 1921 CCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGG 1994
||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1840 CCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGG 1913
Query 1995 AGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGA 2068
|||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 1914 AGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGA 1987
Query 2069 TGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTC 2142
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1988 TGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTC 2061
Query 2143 CCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCT 2216
||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||
Sbjct 2062 CCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCT 2135
Query 2217 CTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACA 2290
||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..
Sbjct 2136 CTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATG 2209
Query 2291 CCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCA 2364
||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2210 CCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCA 2283
Query 2365 AAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGA 2438
||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 2284 AAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGA 2357
Query 2439 AGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACT 2512
|||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 2358 AGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACT 2431
Query 2513 TCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCT 2586
|||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 2432 TCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGA---------- 2495
Query 2587 GACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCA 2660
|||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2496 -----------------------------------GGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCA 2534
Query 2661 TGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACT 2734
|||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 2535 TGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACT 2608
Query 2735 ACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAA 2808
|.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.
Sbjct 2609 ATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAG 2682
Query 2809 CAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACAT 2882
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 2683 CAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCAT 2756
Query 2883 GGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTG 2956
|||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2757 GGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTG 2830
Query 2957 GGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTT 3030
|||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2831 GGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTT 2904
Query 3031 GACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACT 3104
|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2905 GACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACT 2978
Query 3105 GGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGC 3178
|||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2979 GGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGC 3052
Query 3179 AGCCTAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA 3228
|.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3053 AACCCAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA 3102