Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07882
- Subject:
- XM_006514232.2
- Aligned Length:
- 3569
- Identities:
- 2866
- Gaps:
- 358
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACATGTAGCGGACCTCTGCATCAGCCAAGAGGAATTAAGCTTTGTCACTCCCCACTGGGACTACCTTTCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGGTATGTGCGCAAGGAATTCACATGCTGCCGCTCGCCGCTGCAGCCACCAGAGCAGAGCCCCTGTGTACACT 148
Query 1 -----------------------ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACT 51
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149 TTGCCAGAGAGCAGAGAGCAAGAATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACC 222
Query 52 AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACA 125
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACA 296
Query 126 GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGA 199
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 297 GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGA 370
Query 200 CGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGA 273
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 371 CGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGA 444
Query 274 AGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGA 347
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 AGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGA 518
Query 348 GATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG 421
||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG 592
Query 422 TGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTA 495
|.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 TACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTC 666
Query 496 ATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCC 569
||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCC 740
Query 570 TGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTA 643
||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 741 TGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCA 814
Query 644 CGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCA 717
|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 CCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCT 888
Query 718 GTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGG 791
||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 GTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGG 962
Query 792 GGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTG 865
||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTG 1036
Query 866 CAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACA 939
|.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1037 CGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACC 1110
Query 940 CTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGAC 1013
||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1111 CTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGAC 1184
Query 1014 CCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG--------------------------------------------- 1042
|||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185 CCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGG 1258
Query 1043 -------------------------------------------------------------------------- 1042
Sbjct 1259 CCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCC 1332
Query 1043 -------------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCAT 1079
|.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCAT 1403
Query 1080 GAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAA 1153
||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1404 GAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAA 1477
Query 1154 CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1478 CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTG 1551
Query 1228 GCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCA 1301
|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1552 GCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCA 1625
Query 1302 ACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCC 1375
||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1626 ACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCC 1699
Query 1376 CAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGC 1449
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1700 CAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGC 1773
Query 1450 ACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGA 1523
||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1774 ACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGA 1847
Query 1524 TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTG 1597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct 1848 TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTG 1921
Query 1598 GAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGT 1671
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1922 GAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGT 1995
Query 1672 GTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTG 1745
||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1996 GTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTG 2069
Query 1746 TTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG 1819
|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 TTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG 2143
Query 1820 ATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTT 1893
||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2144 ATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTT 2217
Query 1894 GGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC 1967
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC 2291
Query 1968 TGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTC 2041
||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2292 TGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTC 2365
Query 2042 TGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC 2115
||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 TGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC 2439
Query 2116 CAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTC 2189
||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.|
Sbjct 2440 CAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCC 2513
Query 2190 CTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGG 2263
|||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2514 CTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGG 2587
Query 2264 ATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAAT 2337
|.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2588 ACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAAT 2661
Query 2338 TTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGAC 2411
|.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 2662 TACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGAC 2735
Query 2412 TTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATA 2485
.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.|
Sbjct 2736 GTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACA 2809
Query 2486 GTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGA 2559
|||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 2810 GTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGG 2883
Query 2560 ATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCAT 2633
||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2884 ATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCAT 2957
Query 2634 GTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC 2707
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958 GTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC 3031
Query 2708 AGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGG 2781
||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 3032 AGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGA 3105
Query 2782 AAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAA 2855
|||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 3106 AAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAA 3179
Query 2856 GGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAG 2929
|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 3180 GGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCG 3253
Query 2930 TGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAG 3003
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3254 TGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAG 3327
Query 3004 GTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCT 3077
||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 3328 GTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCT 3401
Query 3078 GGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGA 3151
|||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.||||
Sbjct 3402 GGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGA 3475
Query 3152 GTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AAT 3222
|.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||| .||| |||||| .||| .||
Sbjct 3476 GCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGG----GATTCCTGGAGA----------TACTGTAT 3535
Query 3223 ACATTA----------- 3228
||.||.
Sbjct 3536 ACTTTTGGCAAAGCCTC 3552