Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07882
- Subject:
- XM_006514236.2
- Aligned Length:
- 3413
- Identities:
- 2869
- Gaps:
- 199
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACATGTAGCGGACCTCTGCATCAGCCAAGAGGAATTAAGCTTTGTCACTCCCCACTGGGACTACCTTTCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGGTATGTGCGCAAGGAATTCACATGCTGCCGCTCGCCGCTGCAGCCACCAGAGCAGAGCCCCTGTGTACACT 148
Query 1 -----------------------ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACT 51
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149 TTGCCAGAGAGCAGAGAGCAAGAATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACC 222
Query 52 AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACA 125
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACA 296
Query 126 GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGA 199
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 297 GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGA 370
Query 200 CGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGA 273
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 371 CGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGA 444
Query 274 AGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGA 347
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 AGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGA 518
Query 348 GATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG 421
||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG 592
Query 422 TGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTA 495
|.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 TACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTC 666
Query 496 ATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCC 569
||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCC 740
Query 570 TGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTA 643
||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 741 TGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCA 814
Query 644 CGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCA 717
|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 CCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCT 888
Query 718 GTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGG 791
||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 GTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGG 962
Query 792 GGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTG 865
||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTG 1036
Query 866 CAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACA 939
|.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1037 CGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACC 1110
Query 940 CTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGAC 1013
||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1111 CTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGAC 1184
Query 1014 CCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCAT 1087
|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 CCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGT 1255
Query 1088 ACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATG 1161
||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256 ACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATG 1329
Query 1162 AGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCA 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1330 AGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCA 1403
Query 1236 GGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGG 1309
|||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1404 GGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGG 1477
Query 1310 GCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAG 1383
||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 GCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAG 1551
Query 1384 AGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGA 1457
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGA 1625
Query 1458 AGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAG 1531
.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAG 1699
Query 1532 AGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACC 1605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 1700 AGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACC 1773
Query 1606 ATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACA 1679
||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1774 ATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACA 1847
Query 1680 CAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGG 1753
||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1848 CAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGG 1921
Query 1754 AAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCA 1827
|||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1922 AAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCA 1995
Query 1828 GATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCAC 1901
||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 GACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCAC 2069
Query 1902 AATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAA 1975
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2070 AATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGA 2143
Query 1976 CTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAA 2049
||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2144 CTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAA 2217
Query 2050 GCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGC 2123
||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2218 GCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGC 2291
Query 2124 ATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAG 2197
|||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||.
Sbjct 2292 ATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAA 2365
Query 2198 CACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGG 2271
.||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2366 TACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGG 2439
Query 2272 GATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACAC 2345
||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||
Sbjct 2440 GATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACAC 2513
Query 2346 CTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAG 2419
||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2514 CTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAG 2587
Query 2420 ATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAG 2493
|||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||.
Sbjct 2588 ATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGAT 2661
Query 2494 ACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAG 2567
.|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 2662 GCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAG 2735
Query 2568 AGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGA 2641
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 AGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGA 2809
Query 2642 GCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGC 2715
|.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2810 GTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGG 2883
Query 2716 AGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGT 2789
|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 2884 AGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGT 2957
Query 2790 AACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCT 2863
|||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2958 AACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCT 3031
Query 2864 TGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTC 2937
|.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 3032 TATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTC 3105
Query 2938 AAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCA 3011
||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3106 AAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCA 3179
Query 3012 TGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGG 3085
.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 3180 CGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGG 3253
Query 3086 TTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAG 3159
|||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.||||||
Sbjct 3254 TTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAG 3327
Query 3160 AACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AATACATTA-- 3228
|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .||| |||||| .||| .||||.||.
Sbjct 3328 AACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTATACTTTTGG 3390
Query 3229 --------- 3228
Sbjct 3391 CAAAGCCTC 3399