Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07882
Subject:
XM_006514242.3
Aligned Length:
3402
Identities:
2785
Gaps:
270

Alignment

Query    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGC--GACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACT  72
                                ||||||              |||  |        ||||.||             
Sbjct    1  --------------------ATGCCG--------------GGCTGG--------AAGAAGA-------------  19

Query   73  AAATCCGCCAGC--CAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTC  144
            |.|||| |||.|  |..|| ||||     |..|||||          ||||||          .||||||||||
Sbjct   20  ACATCC-CCATCTGCTTAC-AAGC-----GGAGGAGC----------AGGAGA----------GAGAGGAATTC  66

Query  145  AAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGA  218
            ||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct   67  AAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGA  140

Query  219  TAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG  292
            |||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  TAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG  214

Query  293  GTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAG  366
            |.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct  215  GCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAA  288

Query  367  AATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTAT  440
            |||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  289  AATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTAT  362

Query  441  TTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATG  514
            .||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  363  GTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATG  436

Query  515  ATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACG  588
            ||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  437  ATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACC  510

Query  589  ATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAG  662
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct  511  ATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAG  584

Query  663  TATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAA  736
            .||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct  585  CATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGA  658

Query  737  CAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCG  810
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  659  CAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCC  732

Query  811  ATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATT  884
            .|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct  733  GTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCT  806

Query  885  GCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGT  958
            .||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  807  ACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGT  880

Query  959  TCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGG  1032
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  881  TCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGC  954

Query 1033  CCCGACCATG----------------------------------------------------------------  1042
            ||.|||||||                                                                
Sbjct  955  CCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGT  1028

Query 1043  --------------------------------------------------------------------------  1042
                                                                                      
Sbjct 1029  TCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGC  1102

Query 1043  ------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGT  1098
                              |.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1103  TTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGT  1173

Query 1099  TCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACT  1172
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  TCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACT  1247

Query 1173  GAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACA  1246
            |||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1248  GAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACA  1321

Query 1247  CAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTT  1320
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1322  CTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTT  1395

Query 1321  GCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGT  1394
            ||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1396  GCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGT  1469

Query 1395  GCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTC  1468
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1470  GCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATC  1543

Query 1469  AGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATC  1542
            |.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  AACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATC  1617

Query 1543  CCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACC  1616
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1618  CCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCC  1691

Query 1617  ATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGA  1690
            |||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1692  ATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAA  1765

Query 1691  CCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTT  1764
            |.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1766  CTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTC  1839

Query 1765  CAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGA  1838
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1840  CAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGA  1913

Query 1839  AAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAA  1912
            .|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1914  GAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAA  1987

Query 1913  CTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATC  1986
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1988  CTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATC  2061

Query 1987  CACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTT  2060
            |||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2062  CACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTT  2135

Query 2061  GTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCA  2134
            |.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 2136  GCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCA  2209

Query 2135  AGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCA  2208
            ||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.
Sbjct 2210  AGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCT  2283

Query 2209  GGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGC  2282
            ||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct 2284  GGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGG  2357

Query 2283  AATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGA  2356
            ||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 2358  AATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGA  2431

Query 2357  GGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTG  2430
            ||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2432  GGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTG  2505

Query 2431  AGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGA  2504
            |||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.||||||||
Sbjct 2506  AGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGA  2579

Query 2505  GGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGG  2578
            |||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 2580  GGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGG  2653

Query 2579  AGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGT  2652
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2654  AGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGT  2727

Query 2653  TTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCG  2726
            |||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 2728  TTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACG  2801

Query 2727  GCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAA  2800
            |||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.|
Sbjct 2802  GCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGA  2875

Query 2801  AAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGAC  2874
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2876  AAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGAC  2949

Query 2875  TCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCG  2948
            ||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2950  TCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCG  3023

Query 2949  CCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCA  3022
            |||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 3024  CCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGA  3097

Query 3023  GAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGA  3096
            |||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3098  GAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGA  3171

Query 3097  AACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTT  3170
            ||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 3172  AATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTT  3245

Query 3171  TTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AATACATTA-----------  3228
            .||||||||.||.||||||||||| .|||  ||||||          .||| .||||.||.           
Sbjct 3246  CTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTATACTTTTGGCAAAGCCTC  3306