Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07907
• Subject: NM_022983.4
• Aligned Length: 1065
• Identities: 900
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGAATGAGTGTCACTATGACAAGCACATGGACTTTTTTTATAATAGGAGCAACACTGATACTGTCGATGACTG  74
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|..||.||.||
Sbjct    1  ATGAATGAGTGTCACTATGACAAGCGCATGGACTTTTTCTACAACAGGAGCAACACAGACACAGCGGACGAGTG  74

Query   75  GACAGGAACAAAGCTTGTGATTGTTTTGTGTGTTGGGACGTTTTTCTGCCTGTTTATTTTTTTTNNTAATTCTC  148
            ||||||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||..|||.||.|
Sbjct   75  GACAGGGACAAAGCTTGTGATCGTCCTGTGCGTGGGGACGTTCTTCTGCCTCTTTATATTTTTTTCTAACTCCC  148

Query  149  TGGTCATCGCGGCAGTGATCAAAAACAGAAAATTTCATTTCCCCTTCTACTACCTGTTGGCTAATTTAGCTGCT  222
            |||||||.||.||.|||||||.||||.|.||.||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct  149  TGGTCATTGCTGCGGTGATCACAAACCGGAAGTTCCACTTTCCCTTCTACTACCTGCTGGCTAACTTAGCTGCT  222

Query  223  GCCGATTTCTTCGCTGGAATTGCCTATGTATTCCTGATGTTTAACACAGGCCCAGTTTCAAAAACTTTGACTGT  296
            ||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  223  GCGGATTTCTTCGCCGGAATCGCTTACGTGTTCCTGATGTTTAACACTGGCCCGGTGTCGAAAACGTTGACCGT  296

Query  297  CAACCGCTGGTTTCTCCGTCAGGGGCTTCTGGACAGTAGCTTGACTGCTTCCCTCACCAACTTGCTGGTTATCG  370
            ||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|||.|||||||.|||||..||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  CAACCGCTGGTTCCTCCGCCAGGGGCTCCTAGACACCAGCCTGACTGCCTCCCTGGCCAATTTGCTGGTTATTG  370

Query  371  CCGTGGAGAGGCACATGTCAATCATGAGGATGCGGGTCCATAGCAACCTGACCAAAAAGAGGGTGACACTGCTC  444
            |.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct  371  CTGTGGAAAGACACATGTCCATCATGAGGATGAGAGTCCACAGCAACTTGACCAAAAAGCGGGTGACGCTGCTC  444

Query  445  ATTTTGCTTGTCTGGGCCATCGCCATTTTTATGGGGGCGGTCCCCACACTGGGCTGGAATTGCCTCTGCAACAT  518
            |||.||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTCTGCTGGTGTGGGCCATCGCCATCTTCATGGGGGCCGTCCCCACGCTGGGATGGAATTGCCTCTGCAACAT  518

Query  519  CTCTGCCTGCTCTTCCCTGGCCCCCATTTACAGCAGGAGTTACCTTGTTTTCTGGACAGTGTCCAACCTCATGG  592
            |||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct  519  CTCGGCCTGCTCTTCTCTGGCTCCCATTTACAGTAGGAGTTACCTCATTTTCTGGACTGTGTCCAACCTCCTGG  592

Query  593  CCTTCCTCATCATGGTTGTGGTGTACCTGCGGATCTACGTGTACGTCAAGAGGAAAACCAACGTCTTGTCTCCG  666
            |||||.||||||||||.|.|||.|||.|.||.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  593  CCTTCTTCATCATGGTGGCGGTATACGTACGCATCTACATGTATGTTAAAAGGAAAACCAACGTCTTATCTCCA  666

Query  667  CATACAAGTGGGTCCATCAGCCGCCGGAGGACACCCATGAAGCTAATGAAGACGGTGATGACTGTCTTAGGGGC  740
            ||.||.|||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  CACACCAGTGGCTCCATCAGCCGCCGGAGGGCTCCCATGAAGCTAATGAAGACAGTGATGACCGTCTTAGGCGC  740

Query  741  GTTTGTGGTATGCTGGACCCCGGGCCTGGTGGTTCTGCTCCTCGACGGCCTGAACTGCAGGCAGTGTGGCGTGC  814
            .||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct  741  CTTCGTGGTGTGCTGGACCCCGGGTCTGGTGGTTCTGCTGCTGGACGGCCTGAACTGCAAGCAGTGTAACGTGC  814

Query  815  AGCATGTGAAAAGGTGGTTCCTGCTGCTGGCGCTGCTCAACTCCGTCGTGAACCCCATCATCTACTCCTACAAG  888
            |.||.|||||..|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  AACACGTGAAGCGCTGGTTCCTGCTGCTCGCACTGCTCAACTCCGTCATGAACCCCATCATCTACTCGTACAAG  888

Query  889  GACGAGGACATGTATGGCACCATGAAGAAGATGATCTGCTGCTTCTCT-CAGGAGA-----ACCCAGAGAGGCG  956
            ||||||||||||||...|||||||..||||||||||||||| |.|.|| |||||.|     |||  ||||||||
Sbjct  889  GACGAGGACATGTACAACACCATGCGGAAGATGATCTGCTG-TGCCCTGCAGGACAGCAATACC--GAGAGGCG  959

Query  957  TCCCTCTCGCATCCCCTCCACAGTCCTCAGCAGGAGTGACACAGGCAGCCAGTACATAGAGGATAGTATTAGCC  1030
            .|||||.||||.|||||||||..|||.|||||||||.||.||.||||||||||||.|.|||||.||.||.||||
Sbjct  960  CCCCTCCCGCAACCCCTCCACCATCCACAGCAGGAGCGAGACGGGCAGCCAGTACCTGGAGGACAGCATCAGCC  1033

Query 1031  AAGGTGCAGTCTGCAATAAAAGCACTTCC  1059
            |.||..|.||.||||||||||.|...|||
Sbjct 1034  AGGGCCCGGTGTGCAATAAAAACGGCTCC  1062