Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07918
• Subject: XM_005258696.3
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1288
• Gaps: 137

Alignment

Query    1  ATGGCTCTGGCGGTGGCCCCGTGGGGGCGACAGTGGGAAGAGGCCCGCGCCCTGGGCCGGGCAGTCAGGATGCT  74
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Sbjct    1  ATGGCTCTGGCGGTGGCCCCGTGGGGGCGACAGTGGGAAGAGGCCCGCGCCCTGGGCCGGGCAGTCAGGATGCT  74

Query   75  GCAGCGCCTAGAAGAGCAATGCGTCGACCCCCGGCTGTCCGTGAGTCCCCCTTCGCTGCGGGACCTGCTGCCCC  148
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Sbjct   75  GCAGCGCCTAGAAGAGCAATGCGTCGACCCCCGGCTGTCCGTGAGTCCCCCTTCGCTGCGGGACCTGCTGCCCC  148

Query  149  GCACAGCGCAGCTGCTTCGAGAGGTGGCCCATTCTCGGCGGGCGGCCGGCGGAGGCGGCCCCGGGGGTCCCGGC  222
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Sbjct  149  GCACAGCGCAGCTGCTTCGAGAGGTGGCCCATTCTCGGCGGGCGGCCGGCGGAGGCGGCCCCGGGGGTCCCGGC  222

Query  223  GGCTCTGGGGACTTTCTACTCATCTACCTGGCCAATCTGGAGGCCAAGAGCAGGCAGGTGGCCGCGCTGCTGCC  296
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Sbjct  223  GGCTCTGGGGACTTTCTACTCATCTACCTGGCCAATCTGGAGGCCAAGAGCAGGCAGGTGGCCGCGCTGCTGCC  296

Query  297  TCCCCGGGGCCGAAGGAGTGCCAACGACGAGCTCTTCCGGGCGGGCTCCAGACTCAGGCGACAGCTGGCCAAGC  370
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Sbjct  297  TCCCCGGGGCCGAAGGAGTGCCAACGACGAGCTCTTCCGGGCGGGCTCCAGACTCAGGCGACAGCTGGCCAAGC  370

Query  371  TGGCCATCATCTTCAGCCACATGCACGCAGAGCTGCACGCACTCTTCCCCGGGGGAAAGTACTGTGGACACATG  444
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Sbjct  371  TGGCCATCATCTTCAGCCACATGCACGCAGAGCTGCACGCACTCTTCCCCGGGGGAAAGTACTGTGGACACATG  444

Query  445  TACCAGCTCACCAAGGCCCCCGCCCACACCTTCTGGAGGGAAAGTTGCGGAGCCCGGTGTGTGCTGCCCTGGGC  518
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Sbjct  445  TACCAGCTCACCAAGGCCCCCGCCCACACCTTCTGGAGGGAAAGTTGCGGAGCCCGGTGTGTGCTGCCCTGGGC  518

Query  519  TGAGTTTGAGTCCCTCCTGGGCACCTGCCACCCTGTGGAACCAGGCTGCACAGCCCTGGCCTTGCGCACCACCA  592
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Sbjct  519  TGAGTTTGAGTCCCTCCTGGGCACCTGCCACCCTGTGGAACCAGGCTGCACAGCCCTGGCCTTGCGCACCACCA  592

Query  593  TTGACCTCACCTGCAGCGGGCACGTGTCCATCTTCGAGTTCGACGTCTTCACCAGGCTCTTTCAGCCATGGCCA  666
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Sbjct  593  TTGACCTCACCTGCAGCGGGCACGTGTCCATCTTCGAGTTCGACGTCTTCACCAGGCTCTTTCAGCCATGGCCA  666

Query  667  ACACTCCTCAAGAACTGGCAGCTCCTGGCAGTCAACCACCCAGGCTACATGGCCTTCCTCACCTATGATGAGGT  740
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Sbjct  667  ACACTCCTCAAGAACTGGCAGCTCCTGGCAGTCAACCACCCAGGCTACATGGCCTTCCTCACCTATGATGAGGT  740

Query  741  CCAAGAGCGTCTGCAGGCCTGCAGGGACAAGCCAGGCAGTTACATCTTCCGGCCCAGCTGTACTCGCCTGGGGC  814
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Sbjct  741  CCAAGAGCGTCTGCAGGCCTGCAGGGACAAGCCAGGCAGTTACATCTTCCGGCCCAGCTGTACTCGCCTGGGGC  814

Query  815  AGTGGGCCATCGGCTATGTGAGCTCAGATGGCAGCATCCTGCAGACCATCCCTGCCAACAAACCCCTGTCCCAG  888
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Sbjct  815  AGTGGGCCATCGGCTATGTGAGCTCAGATGGCAGCATCCTGCAGACCATCCCTGCCAACAAACCCCTGTCCCAG  888

Query  889  GTGCTCCTGGAGGGACAGAAGGACGGCTTCTACCTCTACCCAGATGGAAAGACCCACAACCCAGACCTGACTGA  962
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Sbjct  889  GTGCTCCTGGAGGGACAGAAGGACGGCTTCTACCTCTACCCAGATGGAAAGACCCACAACCCAGACCTGACTGA  962

Query  963  GCTCGGCCAGGCAGAACCCCAGCAGCGCATCCACGTGTCAGAGGAGCAGCTGCAGCTCTACTGGGCCATGGACT  1036
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Sbjct  963  GCTCGGCCAGGCAGAACCCCAGCAGCGCATCCACGTGTCAGAGGAGCAGCTGCAGCTCTACTGGGCCATGGACT  1036

Query 1037  CCACATTTGAGCTCTGCAAGATCTGTGCTGAGAGCAACAAGGATGTGAAGATTGAGCCGTGCGGGCACCTGCTC  1110
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Sbjct 1037  CCACATTTGAGCTCTGCAAGATCTGTGCTGAGAGCAACAAGGATGTGAAGATTGAGCCGTGCGGGCACCTGCTC  1110

Query 1111  TGCAGCTGCTGCCTGGCTGCCTGGCAGCACTCGGACAGCCAGACCTGCCCCTTCTGCCGCTGCGAGATCAAGGG  1184
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Sbjct 1111  TGCAGCTGCTGCCTGGCTGCCTGGCAGCACTCGGACAGCCAGACCTGCCCCTTCTGCCGCTGCGAGATCAAGGG  1184

Query 1185  CTGGGAGGCCGTGAGTATCTACCAGTTCCACGGTCAGGCTACTGCTGAGGACCCAGGGAACAGCAGTGACCAGG  1258
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Sbjct 1185  CTGGGAGGCCGTGAGTATCTACCAGTTCCACGGTCAGGCTACTGCTGAGGACTCAGGGAACAGCAGTGACCAGG  1258

Query 1259  AAGGCAGGGAGTTGGAGCTGGGGCAG----GTGCCCCTTTCGGCTCCTCCATTGCCCCCACGGCCAGATCTGCC  1328
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Sbjct 1259  AAGGCAGGGAGTTGGAGCTGGGGCAGAACAGTGCC---------------------------------------  1293

Query 1329  CCCCAGGAAGCCCAGAAATGCCCAGCCGAAAGTGAGACTCCTAAAGGGGAACTCCCCTCCAGCTGCGCTGGGAC  1402
                                                                                      
Sbjct 1294  --------------------------------------------------------------------------  1293

Query 1403  CCCAGGACCCTGCCCCGGCC  1422
                                
Sbjct 1294  --------------------  1293