Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07945
Subject:
NM_001330268.1
Aligned Length:
729
Identities:
641
Gaps:
78

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------ATGGCC  6
                                                                               .|.|..
Sbjct   1  ATGTGGAGAAGACAGGAGGAAGTCCTTCCTAAAATAAACCTGACCTCCTGTGGGTTCCCAAACACTAACTTGTT  74

Query   7  TACCCGGG-ATACGGAGGAGGG---------TTTGGAAATTTTAGCATTCAGGTGCCAGGAATGCAGATGGGAC  70
           |.||.||| ||..|||||.|||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCCTGGGAATTTGGAGGTGGGTTCGAAAAATTTGGAAATTTTAGCATTCAGGTGCCAGGAATGCAGATGGGAC  148

Query  71  AGCCAGTGCCAGAAACAGGCCCAGCTATACTCCTCGATGGATACTCTGGGCCAGCATATTCAGACACTTATTCC  144
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGCCAGTGCCAGAAACAGGCCCAGCTATACTCCTCGATGGATACTCTGGGCCAGCATATTCAGACACTTATTCC  222

Query 145  TCAGCTGGTGACTCCGTGTATACTTACTTCAGTGCTGTTGCTGGACAGGATGGTGAAGTGGATGCTGAAGAACT  218
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TCAGCTGGTGACTCCGTGTATACTTACTTCAGTGCTGTTGCTGGACAGGATGGTGAAGTGGATGCTGAAGAACT  296

Query 219  TCAGAGATGTTTGACACAGTCTGGAATTAATGGAACTTACTCTCCCTTCAGTTTGGAAACCTGCAGAATTATGA  292
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TCAGAGATGTTTGACACAGTCTGGAATTAATGGAACTTACTCTCCCTTCAGTTTGGAAACCTGCAGAATTATGA  370

Query 293  TTGCCATGTTGGATAGAGATCACACAGGAAAAATGGGATTTAATGCATTCAAAGAGCTATGGGCAGCTCTTAAT  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGCCATGTTGGATAGAGATCACACAGGAAAAATGGGATTTAATGCATTCAAAGAGCTATGGGCAGCTCTTAAT  444

Query 367  GCCTGGAAGGAAAACTTCATGACTGTTGATCAAGATGGAAGTGGCACAGTAGAACATCATGAGTTGCGTCAAGC  440
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCCTGGAAGGAAAACTTCATGACTGTTGATCAAGATGGAAGTGGCACAGTAGAACATCATGAGTTGCGTCAAGC  518

Query 441  CATTGGTCTTATGGGTTATAGGTTGAGTCCTCAAACATTAACTACAATTGTTAAACGTTATAGCAAGAATGGCA  514
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CATTGGTCTTATGGGTTATAGGTTGAGTCCTCAAACATTAACTACTATTGTTAAACGTTATAGCAAGAATGGCA  592

Query 515  GAATTTTCTTTGATGATTATGTTGCTTGCTGTGTGAAGCTTCGAGCATTGACAGATTTCTTTAGGAAAAGAGAC  588
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GAATTTTCTTTGATGATTATGTTGCTTGCTGTGTGAAGCTTCGAGCATTGACAGATTTCTTTAGGAAAAGAGAC  666

Query 589  CACTTGCAACAAGGGTCTGCGAATTTCATATATGACGATTTTTTGCAGGGCACTATGGCAATT  651
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CACTTGCAACAAGGGTCTGCGAATTTCATATATGACGATTTTTTGCAGGGCACTATGGCAATT  729