Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07949
• Subject: NM_001351284.2
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1433
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTTGGGAAGGACATGGTCAGATTTGTTGTAAGAAAGACTGTGCAGAGGAGTGTGGCAAAGGGATCCAGAAG  74

Query    1  -------------ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGA  61
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATGCAAGAAGAGAATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGA  148

Query   62  GAAAACGTTCTACAGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGAT  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAAACGTTCTACAGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGAT  222

Query  136  AGCTATGTTCTGGAAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGT  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTATGTTCTGGAAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGT  296

Query  210  TCATACTTTCAAGGATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTT  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATACTTTCAAGGATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTT  370

Query  284  TACAAAGAAAGCGGTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACA  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACAAAGAAAGCGGTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACA  444

Query  358  ATTAAGTCAATTTTTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTT  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTAAGTCAATTTTTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTT  518

Query  432  TAATTCTTCCTGGCGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGAT  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAATTCTTCCTGGCGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGAT  592

Query  506  TAATGGTTATACATGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAA  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAATGGTTATACATGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAA  666

Query  580  GATAGAGTCAAATTTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGA  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATAGAGTCAAATTTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGA  740

Query  654  CTATTATGTAATGCTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCAT  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTATTATGTAATGCTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCAT  814

Query  728  CCCTAGAAGGAACTTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCAT  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTAGAAGGAACTTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCAT  888

Query  802  GATCTCCCACGTTTGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTT  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCTCCCACGTTTGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTT  962

Query  876  CCGTGGTCTGTTGGCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCAT  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGTGGTCTGTTGGCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCAT  1036

Query  950  CATACAAAGGGACGGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCC  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATACAAAGGGACGGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCC  1110

Query 1024  CCTGCAAGTCTGTACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGA  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGCAAGTCTGTACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGA  1184

Query 1098  GTACTTTTGGGGGAAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAA  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTACTTTTGGGGGAAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAA  1258

Query 1172  AAATTAAAGTAAATACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAA  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAATTAAAGTAAATACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAA  1332

Query 1246  AACGTTATGCCTAGCAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTT  1319
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACGTTATGCCTAGCAAACAAAGGAGACAATGTTCTACTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTT  1406

Query 1320  TGAAATGTCAGGTGTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAA  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAAATGTCAGGTGTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAA  1480

Query 1394  AGGAATGGCTAATTATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT  1434
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAATGGCTAATTATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT  1521