Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07949
• Subject: XM_011243539.1
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1275
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTAC  74
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCTTAAATTTTATCAAATGAAATATATTTTTCAAATATTGGATAAAATGAGATGCTTGCGAAAACGGTCTAC  74

Query   75  AGTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGG  148
            |||||||||||||||.||||||||..|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTGTCATTCTTGGGGGTTCTTGTTGTTTTTCTACTATTCATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGG  148

Query  149  AAGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAG  222
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAGGCGACAAGCAACTTATAAGGGAAACATCGACACACCAACTTAATTCTGAACGCTATGTTCACACTTTCAAG  222

Query  223  GATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCG  296
            ||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  223  GATTTATCAAACTTCTCAGGAACCATAAATGTCACTTATCGCTATCTGGCTGCCACACCTTTACAGAGAAAACG  296

Query  297  GTATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTT  370
            .|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  ATATCTCACAATTGGACTTTCATCAGTGAAACGAAAAAAAGGAAATTATTTACTTGACACAATCAAGTCAATTT  370

Query  371  TTGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGG  444
            ||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  371  TTGAACAGTCCAGCTATGAAGAACTAAAGGAAATTTCAGTCGTAGTACATCTAGCAGACTTCAATTCATCATGG  444

Query  445  CGTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACA  518
            ||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGAGATGCCATGGTCCAAGACATTACACAGAAATTTGCCCATCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACA  518

Query  519  TGCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAAT  592
            ||||||.||.||.|||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct  519  TGCTCCTGAAGAATATTATCCAGTTCTGGATGGTCTTAAAAGAAATTACAATGACCCAGAAGATAGAGTCAGAT  592

Query  593  TTCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATG  666
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  593  TTCGCTCCAAGCAAAACGTAGATTATGCTTTTCTGCTAAATTTCTGTGCCAATACTTCTGACTATTACGTGATG  666

Query  667  CTTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAAC  740
            ||||||||.||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||
Sbjct  667  CTTGAAGACGATGTTCGGTGTTCCAGAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATAGCATCCTTGGAAGGAAC  740

Query  741  TTACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTT  814
            .|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  741  ATACTGGGTAACTCTTGAGTTCTCTAAACTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCACGATCTCCCACGTC  814

Query  815  TGGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTG  888
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct  815  TGGCCCATTTCTTATTAATGTTCTATCAAGAAATGCCCTGCGATTGGCTATTGACTCATTTCCGAGGGCTGCTG  888

Query  889  GCTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGAC  962
            |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  889  GCTCAGAAAAATGTGATTCGATTTAAACCTTCTCTCTTTCAGCACATGGGGTATTATTCATCCTATAAAGGAAC  962

Query  963  GGAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGT  1036
            .||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|
Sbjct  963  AGAGAATAAACTGAAGGATGATGACTTTGAAGAAGAGTCCTTTGACATCCCTGATAACCCCCCAGCGAGTTTCT  1036

Query 1037  ACACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGG  1110
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037  ACACCAACATGAATGTCTTTGAAAACTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTATTTTTGGGGA  1110

Query 1111  AAACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAA  1184
            ||..|||||||||..||||||...||.||.|||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111  AAGTCACCTTCAATGGGAGATACGTTCGTTATTGTATTTGAAAATCCGATTACAATTAAAAAAATTAAAGTGAA  1184

Query 1185  TACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTA  1258
            ||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||..||||...||
Sbjct 1185  TACTGGAACAGAGGACCGGCAGAATGACATCTTACAACATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAAACTTATTTTTA  1258

Query 1259  GCAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGT  1332
            |||||||||..|||||||||..||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1259  GCAAACAAATAAGACAATGTGATACTTACTTAAGACTAGGGGAATTCAAAAATGGATACTTTGAAATGTCAGAT  1332

Query 1333  GTAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAAT  1406
            ||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1333  GTGAATCAAAAAATTCCCTTTGACATACATTGCATGAGGATATGTGTTACCAAAACACAGAAAGAATGGCTGAT  1406

Query 1407  TATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT  1434
            .|||||.||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1407  AATTAGAAGCATCAGTATTTGGACTTCC  1434