Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07949
- Subject:
- XM_017019143.2
- Aligned Length:
- 1581
- Identities:
- 1433
- Gaps:
- 147
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGTATCAACGGTTTCTGTACAGCACAGATTATGACAGCGTCTTTCTTAAGACTTATCATTTGGAGCACTGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------A 1
|
Sbjct 75 CTCAGGAGTCGAAATCACCAATGGCTCATCCATCAATCAACCAGAAGTGAAGACGAAAGCTTCAAAGAAGAGAA 148
Query 2 TGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTACA 75
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTTTAAATTTCATCAAATGAAACATATTTTTGAAATACTTGATAAAATGAGATGCCTGAGAAAACGTTCTACA 222
Query 76 GTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGGA 149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGTCATTCTTGGGAGTTCTTGTCATTTTTCTCCTTTTTATGAACTTGTACATTGAAGATAGCTATGTTCTGGA 296
Query 150 AGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAGG 223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGAGACAAACAACTTATAAGGGAAACATCCACACATCAACTGAATTCAGAACGCTATGTTCATACTTTCAAGG 370
Query 224 ATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCGG 297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTATCTAATTTCTCAGGAGCCATAAATGTCACCTATCGCTACCTAGCTGCCACACCTTTACAAAGAAAGCGG 444
Query 298 TATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTTT 371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TATCTTACAATTGGACTTTCTTCAGTAAAGCGAAAAAAAGGAAACTATTTACTTGAGACAATTAAGTCAATTTT 518
Query 372 TGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGGC 445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAGCAATCCAGCTATGAAGAGCTGAAGGAAATTTCAGTGGTGGTTCACCTAGCAGACTTTAATTCTTCCTGGC 592
Query 446 GTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACAT 519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGATGCCATGGTCCAGGATATTACACAGAAATTTGCGCACCATATTATTGCAGGAAGATTAATGGTTATACAT 666
Query 520 GCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAATT 593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTCCAGAGGAGTATTACCCAATCCTAGATGGCCTTAAAAGAAATTACAATGATCCAGAAGATAGAGTCAAATT 740
Query 594 TCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATGC 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCGTTCCAAGCAAAATGTAGATTATGCTTTTCTGCTTAATTTTTGTGCCAATACTTCAGACTATTATGTAATGC 814
Query 668 TTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAACT 741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGAAGATGATGTTCGATGTTCAAAAAATTTCTTAACTGCCATCAAGAAAGTCATTGCATCCCTAGAAGGAACT 888
Query 742 TACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTTT 815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACTGGGTAACTCTTGAATTCTCTAAGCTTGGCTACATTGGTAAACTCTATCATTCTCATGATCTCCCACGTTT 962
Query 816 GGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTGG 889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCCATTTTTTATTAATGTTTTATCAAGAAATGCCTTGTGATTGGCTATTGACTCATTTCCGTGGTCTGTTGG 1036
Query 890 CTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGACG 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCAGAAAAATGTGATCCGTTTTAAACCATCTCTCTTTCAGCACATGGGCTATTATTCATCATACAAAGGGACG 1110
Query 964 GAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGTA 1037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGAATAAGCTGAAGGATGATGATTTTGAAGAGGAGTCATTTGACATTCCTGATAACCCCCCTGCAAGTCTGTA 1184
Query 1038 CACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGGA 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACCAACATGAATGTGTTTGAAAATTATGAAGCAAGCAAGGCTTACAGTAGTGTTGATGAGTACTTTTGGGGGA 1258
Query 1112 AACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAAT 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AACCACCTTCAACAGGAGATGTTTTTGTGATTGTATTTGAAAATCCAATTATAATAAAAAAAATTAAAGTAAAT 1332
Query 1186 ACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTAG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTGGAACAGAAGATCGGCAAAATGATATTTTGCATCATGGAGCCCTAGATGTTGGGGAAAACGTTATGCCTAG 1406
Query 1260 CAAACAAAGGAGACAATGTTCTAGTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGTG 1333
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAAACAAAGGAGACAATGTTCTACTTACTTAAGACTAGGAGAATTCAAAAATGGAAACTTTGAAATGTCAGGTG 1480
Query 1334 TAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAATT 1407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TAAATCAAAAAATTCCATTTGATATACATTGTATGAGGATATATGTCACCAAAACACAAAAGGAATGGCTAATT 1554
Query 1408 ATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1434
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTAGGAGTATTAGCATTTGGACTTCT 1581