Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07990
• Subject: NM_001033518.2
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1274
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGGGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTCTTCGCCAACTTCAACCAGGACAACAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGGGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTCTTCGCCAACTTCAACCAGGACAACAC  74

Query   75  ------------------------------------------------------GTCCCTAGCTGTTGGTAGTA  94
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAAGTGAAAGGGGCATCAAGAGCAGCTGGTCTTGGCCGTCGCGCTGTTGTCTGGTCCCTAGCTGTTGGTAGTA  148

Query   95  AGTCCGGTTATAAATTTTTCTCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCTGGAACAGATCTATGAATGCACCGATACGGAA  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTCCGGTTATAAATTTTTCTCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCTGGAACAGATCTATGAATGCACCGATACGGAA  222

Query  169  GATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTGGCCATCGTGAGCCTTAAAGCACCAAGGAAGCT  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTGGCCATCGTCAGCCTTAAAGCACCAAGGAAGCT  296

Query  243  AAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTACAGCTACTCCAACACGATTCTGGCTGTGAAGC  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTACAGCTACTCCAACACGATTCTGGCTGTGAAGC  370

Query  317  TCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGTACATCCACAACATTCGGGACATGAAGGTGCTG  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGTACATCCACAACATTCGGGACATGAAGGTGCTG  444

Query  391  CATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGTGCGCTGTCAATCAACAACGACAACTGCTACTT  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGTGCGCTGTCAATCAACAACGACAACTGCTACTT  518

Query  465  GGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTTCGATACCATTAATTTGAGAGCTGCAAACATGA  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTTCGATACCATTAATTTGAGAGCTGCAAACATGA  592

Query  539  TTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACGCAAGTGGAACTAAACTTGCCACGGCTTCGGAG  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACGCAAGTGGAACTAAACTTGCCACGGCTTCGGAG  666

Query  613  AAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAAAAACTCTTTGAGTTTCGGAGAGGAGTAAAGAG  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAAAAACTCTTTGAGTTTCGGAGAGGAGTAAAGAG  740

Query  687  GTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCATGTTCCTCTCCGCCTCCAGCAACACTGAGACCG  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCATGTTCCTCTCCGCCTCCAGCAACACTGAGACCG  814

Query  761  TGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAGAGGAGCCCACCACCTGGACCGGGTACTTCGGG  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAGAGGAGCCCACCACCTGGACCGGGTACTTCGGG  888

Query  835  AAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTGACAGAAATGTTCAACCAGGGCAGAGCCTTCGC  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTGACAGAAATGTTCAACCAGGGCAGAGCCTTCGC  962

Query  909  CACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTCGCTAGCCACAATTCAGAAGATCCCGCGGTTGT  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTCGCTAGCCACAATTCAGAAGATCCCGCGGTTGT  1036

Query  983  TGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGGACCCCCAGGAGGGCGGCGAGTGTGCCCTGATG  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGGACCCCCAGGAGGGCGGCGAGTGTGCCCTGATG  1110

Query 1057  AAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAGATCTTGGACTCTGCCTCTCACGACTGCCCCTT  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAGATCTTGGACTCTGCCTCTCACGACTGCCCCTT  1184

Query 1131  AGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAAGGTACTTACGTGCCTTCATCCCCAACGAGACTTGCCTACA  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 |||||||
Sbjct 1185  AGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAA---------------------------------GCCTACA  1225

Query 1205  CAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCGCCTGCCTGGAGGACGAGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGC  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  CAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCGCCTGCCTGGAGGACGAGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGC  1299

Query 1279  GAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACTGAC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  GAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACTGAC  1329