Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07993
- Subject:
- XM_011245986.2
- Aligned Length:
- 2239
- Identities:
- 1850
- Gaps:
- 236
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAAATGCGAAAGGGAAGCAGTAGGAAGAAACCCAAGACAGCTGAAAACCAGAAGGCATCTGAGGAGAATGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GATTACTCAGCCGGGCGGATCCAGCGCCAAGCCGGCCCTTCCCTGCCTGAACTTTGAAGCTGTTTTGTCTCCAG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCCCAGCCCTCATCCACTCGACACATTCACTGACAAACTCTCACGCTCACACCGGGTCATCTGATTGTGACATC 222
Query 1 ------------ATGACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGTGCTCGAGACCCT 62
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Sbjct 223 AGTTGCAAGGGGATGACCGAGCGCATTCACAGCATCAACCTTCACAACTTCAGCAATTCCGTGCTCGAGACCCT 296
Query 63 CAACGAGCAGCGCAACCGTGGCCACTTCTGTGACGTAACGGTGCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACACC 136
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Sbjct 297 CAACGAGCAGCGCAACCGTGGCCACTTCTGTGACGTGACGGTTCGCATCCACGGGAGCATGCTGCGCGCACATC 370
Query 137 GCTGCGTGCTGGCAGCCGGCAGCCCCTTCTTCCAGGACAAACTGCTGCTTGGCTACAGCGACATCGAGATCCCG 210
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Sbjct 371 GCTGCGTGCTGGCAGCCGGCAGCCCCTTCTTCCAAGACAAGCTGCTGCTGGGCTACAGCGACATCGAAATCCCG 444
Query 211 TCGGTGGTGTCAGTGCAGTCAGTGCAAAAGCTCATTGACTTCATGTACAGCGGCGTGCTACGGGTCTCGCAGTC 284
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Sbjct 445 TCGGTGGTGTCCGTACAATCGGTGCAAAAGCTCATTGACTTCATGTACAGCGGTGTGCTGAGAGTCTCACAGTC 518
Query 285 GGAAGCTCTGCAGATCCTCACGGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATCGACGAGTGCACGCGCATCG 358
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Sbjct 519 GGAAGCTCTGCAGATCCTCACAGCCGCCAGCATCCTGCAGATCAAAACAGTCATAGATGAGTGCACTCGCATCG 592
Query 359 TGTCACAGAACGTGGGCGATGTGTTCCCGGGGATCCAGGACTCGGGCCAGGACACGCCGCGGGGCACTCCCGAG 432
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Sbjct 593 TGTCACAGAACGTGGGCGATGTGTTCCCAGGCATCCAGGATTCTGGCCAGGACACACCAAGAGGCACACCAGAG 666
Query 433 TCAGGCACGTCAGGCCAGAGCAGCGACACGGAGTCGGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCACAGCGTGGACAG 506
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Sbjct 667 TCAGGCACATCTGGCCAGAGCAGTGACACGGAATCAGGCTACCTGCAGAGCCACCCACAGCATAGTGTGGACCG 740
Query 507 GATCTACTCGGCACTCTACGCGTGCTCCATGCAGAATGGCAGCGGCGAGCGCTCTTTTTACAGCGGCGCAGTGG 580
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Sbjct 741 AATCTACTCCGCACTCTACGCCTGCTCCATGCAGAATGGCAGCGGCGAGCGCTCCTTCTACAGTGGTGCAGTGG 814
Query 581 TCAGCCACCACGAGACTGCGCTCGGCCTGCCCCGCGACCACCACATGGAAGACCCCAGCTGGATCACACGCATC 654
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Sbjct 815 TCAGCCACCACGAAACAGCTCTCGGCCTGCCCCGTGACCACCACATGGAAGACCCTAGCTGGATCACACGCATT 888
Query 655 CATGAGCGCTCGCAGCAGATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCCGAGACCACGCACTGCCGCAAGCAGCCCCG 728
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Sbjct 889 CATGAGCGCTCCCAGCAAATGGAGCGCTACCTGTCCACCACCCCTGAGACCACGCACTGCCGGAAGCAGCCCCG 962
Query 729 GCCTGTGCGCATCCAGACCCTAGTGGGCAACATCCACATCAAGCAGGAGATGGAGGACGATTACGACTACTACG 802
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Sbjct 963 GCCTGTGCGTATCCAGACCCTGGTGGGTAACATCCACATCAAGCAGGAAATGGAAGATGACTATGACTACTATG 1036
Query 803 GGCAGCAAAGGGTGCAGATCCTGGAACGCAACGAATCCGAGGAGTGCACGGAAGACACAGACCAGGCCGAGGGC 876
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Sbjct 1037 GGCAGCAAAGGGTGCAGATCCTAGAACGCAATGAATCCGAGGAGTGCACAGAAGACACTGACCAAGCAGAGGGC 1110
Query 877 ACCGAGAGTGAGCCCAAAGGTGAAAGCTTCGACTCGGGCGTCAGCTCCTCCATAGGCACCGAGCCTGACTCGGT 950
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Sbjct 1111 ACTGAGAGCGAGCCCAAAGGTGAAAGCTTTGATTCTGGGGTCAGCTCCTCCATCGGCACCGAACCTGACTCAGT 1184
Query 951 GGAGCAGCAGTTTGGGCCTGGGGCGGCGCGGGACAGCCAGGCTGAACCCACCCAACCCGAGCAGGCTGCAGAAG 1024
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Sbjct 1185 GGAGCAACAGTTTGGGGCAGCAGCCCCAAGGGACGGTCAGGCAGAACCCGCCCAACCTGAGCAGGCAGCAGAAG 1258
Query 1025 CCCCCGCTGAGGGTGGTCCGCAGACAAACCAGCTAGAAACAGGTGCTTCCTCTCCGGAGAGAAGCAATGAAGT- 1097
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Sbjct 1259 CCCCAGCTGAGAGCAGTGCCCAGCCAAACCAGCTAGAACCAGGTGCCTCCTCTCCTGAGAGAAGCAACG-AGTC 1331
Query 1098 GGAGATGGACAGCACTGTTATCACTGTCAGCAACAGCTCCGACAAGAGCGTCCTACAACAGCCTTCGGTCAACA 1171
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Sbjct 1332 AGAGATGGACAACACAGTCATCACTGTCAGTAACAGCTCCGATAAGGGCGTCCTACAGCAGCCTTCAGTCAACA 1405
Query 1172 CGTCCATCGGGCAGCCATTGCCAAGTACCCAGCTCTACTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGG 1245
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Sbjct 1406 CATCCATCGGGCAGCCATTGCCAAGTACCCAGCTCTATTTACGCCAGACAGAAACCCTCACCAGCAACCTGAGG 1479
Query 1246 ATGCCTCTGACCTTGACCAGCAACACGCAGGTCATTGGCACAGCTGGCAACACCTACCTGCCAGCCCTCTTCAC 1319
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Sbjct 1480 ATGCCTCTGACCTTGACCAGCAACACACAGGTCATTGGCACCGCTGGCAACACCTATCTGCCAGCCCTCTTCAC 1553
Query 1320 TACCCAGCCCGCGGGCAGTGGCCCCAAGCCTTTCCTCTTCAGCCTGCCACAGCCCCTGGCAGGCCAGCAGACCC 1393
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Sbjct 1554 TACCCAACCCGCGGGCAGTGGCCCCAAGCCTTTTCTCTTCAGCCTGCCGCAGCCCCTGACAGGCCAGCAGACCC 1627
Query 1394 AGTTTGTGACAGTGTTCCAGCCCGGTCTGTCGACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGCCACAGCCCCTGGCCTCA 1467
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Sbjct 1628 AGTTTGTGACAGTGTCCCAGCCCGGTCTGTCCACCTTTACTGCACAGCTGCCAGCGCCACAGCCCCTGGCCTCA 1701
Query 1468 TCCGCAGGCCACAGCACAGCCAGTGGGCAAGGCGAAAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTT 1541
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Sbjct 1702 TCTGCAGGCCACAGCACAGCCAGTGGGCAAGGCGACAAAAAGCCTTATGAGTGCACTCTCTGCAACAAGACTTT 1775
Query 1542 CACCGCCAAACAGAACTACGTCAAGCACATGTTCGTACACACAGGTGAGAAGCCCCACCAATGCAGCATCTGTT 1615
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Sbjct 1776 CACAGCCAAACAGAACTACGTCAAGCACATGTTCGTACATACAGGTGAGAAGCCCCACCAGTGCAGCATCTGCT 1849
Query 1616 GGCGCTCCTTCTCCTTAAAGGATTACCTTATCAAGCACATGGTGACACACACAGGAGTGAGGGCATACCAGTGT 1689
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Sbjct 1850 GGCGCTCCTTCTCCTTGAAGGATTACCTTATCAAGCACATGGTGACGCACACCGGCGTGAGAGCGTACCAGTGT 1923
Query 1690 AGTATCTGCAACAAGCGCTTCACCCAGAAGAGCTCCCTCAACGTGCACATGCGCCTCCACCGGGGAGAGAAGTC 1763
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Sbjct 1924 AGCATCTGCAACAAGCGCTTCACCCAGAAGAGTTCCCTCAACGTGCACATGCGCCTGCACCGCGGGGAGAAGTC 1997
Query 1764 CTACGAGTGCTACATCTGCAAAAAGAAGTTCTCTCACAAGACCCTCCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTG 1837
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Sbjct 1998 CTATGAGTGCTACATCTGCAAAAAGAAGTTCTCCCACAAGACCCTGCTGGAGCGACACGTGGCCCTGCACAGTG 2071
Query 1838 CCAGCAATGGGACCCCCCCTGCAGGCACACCCCCAGGTGCCCGCGCTGGCCCCCCAGGCGTGGTGGCCTGCACG 1911
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Sbjct 2072 CCAGCAACGGGACCCCTCCGGCAGGCACGCCCCCAGGTGCCCGCGCGGGTCCGCCAGGCGTGGTGGCCTGCACA 2145
Query 1912 GAGGGGACCACTTACGTCTGCTCCGTCTGCCCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAG 1985
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Sbjct 2146 GAGGGGACCACTTACGTCTGCTCCGTCTGCCCAGCAAAGTTTGACCAAATCGAGCAGTTCAACGACCACATGAG 2219
Query 1986 GATGCATGTGTCTGACGGA 2004
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Sbjct 2220 GATGCATGTGTCTGACGGA 2238