Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08016
- Subject:
- NM_001243332.1
- Aligned Length:
- 2769
- Identities:
- 2426
- Gaps:
- 342
Alignment
Query 1 ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT 74
Query 75 CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG 148
Query 149 CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 149 CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCGG 222
Query 223 GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG 296
Query 297 GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA 370
Query 371 CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA 444
Query 445 GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCA-------- 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCAGTTCTGTG 518
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 519 TAATAACAACATCTCCGAGGGCGAAGGGTATGTGGAGTCTCCAGATCTGGGGAGCCCCGTCAGCCGCACCCTGG 592
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 593 GGCTCCTGGACTGCACTTACAGCATCCATGTCTACCCTGGCTACGGCATTGAGATCCAGGTGCAGACGCTGAAC 666
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 667 CTGTCACAGGAAGAGGAGCTCCTGGTGCTGGCTGGTGGGGGATCCCCAGGCCTGGCCCCCCGACTCCTGGCCAA 740
Query 511 -------------------------------------------------------------------------- 510
Sbjct 741 CTCATCCATGCTTGGAGAAGGACAAGTCCTTCGGAGCCCAACCAACCGGCTGCTTCTGCACTTCCAGAGCCCAC 814
Query 511 --------------------------------------GCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGTCCCAAGGGGCGGTGGCTTCAGGATCCACTATCAGGCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG 888
Query 547 GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA 962
Query 621 GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA 1036
Query 695 TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA 1110
Query 769 GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT 1184
Query 843 CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT 1258
Query 917 CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG 1332
Query 991 ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT 1406
Query 1065 GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG 1480
Query 1139 GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC 1554
Query 1213 ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG 1628
Query 1287 GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC 1702
Query 1361 AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC 1776
Query 1435 TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA 1850
Query 1509 GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG 1924
Query 1583 ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG 1998
Query 1657 GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC 2072
Query 1731 TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC 2146
Query 1805 GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG 1878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG 2220
Query 1879 GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC 2294
Query 1953 CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC 2368
Query 2027 AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG 2442
Query 2101 CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG 2516
Query 2175 AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC 2590
Query 2249 TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT 2664
Query 2323 TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC 2738
Query 2397 TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC 2427
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC 2769