Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08016
• Subject: XM_006507737.2
• Aligned Length: 2769
• Identities: 2036
• Gaps: 474

Alignment

Query    1  ATGGGGACTCCCAGGGCCCAGCACCCGCCGCCTCCCCAGCTGCTGTTCCTAATTCTGCTGAGCTGTCCCTGGAT  74
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGGGACTCCCAAGGCCCAGCACCCGCCGCCTTCCCAGCTGCTGCTCCTAATTCTGCTGAGCTGTGCCTGGAT  74

Query   75  CCAGGGTCTGCCCCTGAAGGAGGAGGAGATATTGCCAGAGCCTGGAAGTGAGACCCCCACGGTGGCCTCTGAGG  148
                                                            ||||                      
Sbjct   75  ------------------------------------------------TGAG----------------------  78

Query  149  CCCTGGCTGAACTGCTTCATGGGGCCCTGCTGAGGAGGGGCCCAGAGATGGGCTACCTGCCAGGATCTGATCCG  222
                                                                          ||||||||.||.
Sbjct   79  --------------------------------------------------------------GGATCTGACCCA  90

Query  223  GACCCCACGCTAGCCACCCCTCCGGCCGGCCAGACTCTCGCAGTGCCCTCCCTGCCACGGGCCACTGAGCCGGG  296
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct   91  GACCCCACACTAGCCACCCCTCCAGCCGGCCAGACTCTTGCAGCACCTTCCCTGCCACGTGCCACTGAGCCAGG  164

Query  297  GACAGGGCCTCTGACAACAGCCGTCACCCCTAACGGGGTCAGGGGGGCAGGCCCCACTGCGCCAGAACTGCTGA  370
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  165  GACAGGGCCTCTGACGACAGCTGTCACCCCCAAGGGAGTCAGGGGGGCAGGCCCCACCGCGCCAGAGCTGCTGA  238

Query  371  CCCCGCCCCCAGGAACCACAGCCCCACCCCCACCCAGCCCTGCCTCCCCAGGGCCTCCCCTTGGGCCTGAGGGA  444
            ||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||..||||.||||||||||..||.|||||..|||||||||||
Sbjct  239  CCCCACCCCCTGGAACTACAGCCCCGCCCCCGCCTGGCCCCGCCTCCCCAGTCCCACCCCTCAGGCCTGAGGGA  312

Query  445  GGAGAGGAGGAGACGACGACCACCATCATCACCACGACAACTGTTACCACTACGGTGACCAGCCCA--------  510
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||        
Sbjct  313  GGAGAGGAGGAAACCACCACCACCATCATCACCACAACAACTGTCACCACCACTGTCACCAGCCCAGTTCTGTG  386

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  387  CAATAACAACATCTCGGAGGGCGAAGGGTTTGTGGAGTCTCCGGACTTGGGGAGCACTGCCAGCCGCTCCGTGG  460

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  461  AGCTCCTAGATTGCACCTACAGCATCCATGTCTACCCTGGTTATGGCATTGAGATTCAGGTGCAGACACTCAAC  534

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  535  CTGTCTCAGGAGGAAGAACTTCTGGTGTTGGCCGGTGGGGGTTCTCCAGGCCTGGCCCCCAGACTCCTGGCCAA  608

Query  511  --------------------------------------------------------------------------  510
                                                                                      
Sbjct  609  TTCCTCCATGCTGGGAGAAGGACAAGTGCTGCGGAGCCCAACAAACCGGCTGCTCCTGCATTTCCAGAGTCCTC  682

Query  511  --------------------------------------GCCTACCTCCTGAGCTGTGGCTTCCCTCCCCGGCCG  546
                                                  ||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  683  GAGTCCCAAGGGGCAATGGCTTCAGGATTCACTATCAGGCATACCTTCTGAGCTGCGGCTTCCCACCCCGGCCA  756

Query  547  GCCCATGGGGACGTGAGTGTGACGGACCTGCACCCTGGGGGCACTGCCACCTTTCACTGTGATTCGGGCTACCA  620
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  757  GCCCACGGGGATGTGAGCGTGACAGACTTGCATCCTGGGGGCACTGCCACCTTCCACTGTGACTCAGGATACCA  830

Query  621  GCTGCAGGGAGAGGAGACCCTCATCTGCCTCAATGGCACCCGGCCATCCTGGAACGGTGAAACCCCCAGCTGCA  694
            |||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||..||||||.||||.|||||.|
Sbjct  831  GCTACAGGGTGAGGAGACCCTCATTTGCCTCAATGGTACCCGGCCAGCCTGGACTGGTGAACCCCCTAGCTGTA  904

Query  695  TGGCATCCTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACCCTGGGCCGCATCGTGTCCCCAGAGCCTGGGGGAGCCGTA  768
            ..|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|.|
Sbjct  905  CAGCATCTTGTGGTGGCACCATCCACAATGCCACACTGGGTCGCATTGTATCCCCTGAGCCTGGGGGAGCTGCA  978

Query  769  GGGCCCAACCTCACCTGCCGTTGGGTCATTGAAGCAGCTGAGGGGCGCCGGCTGCACCTGCACTTTGAAAGGGT  842
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct  979  GGGCCCAACCTCACCTGCCGCTGGGTCATTGAAGCGGCCGAGGGACGCCGGCTTCACCTACACTTTGAGAGAGT  1052

Query  843  CTCGCTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGCAGCCCCCTATCCCCCGTGATCTATGATT  916
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1053  CTCACTGGATGAGGACAATGACCGGCTGATGGTGCGCTCAGGGGGAAGCCCCCTGTCCCCTGTGATTTACGACT  1126

Query  917  CGGACATGGACGATGTCCCCGAGCGGGGTCTCATCAGTGACGCCCAGTCCCTCTACGTGGAGCTGCTGTCAGAG  990
            |.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1127  CTGACATGGATGATGTCCCTGAACGCGGTCTCATCAGTGATGCCCAGTCCCTCTACGTAGAACTGCTTTCAGAG  1200

Query  991  ACACCTGCCAATCCCCTGCTGTTAAGCCTTCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGATCGCTGCTTCGCCCCCTTCCT  1064
            |||||.|||||.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||
Sbjct 1201  ACACCAGCCAACCCCCTGCTGCTCAGCCTCCGATTTGAAGCCTTTGAGGAGGACCGCTGCTTCCCCCCGTTCCT  1274

Query 1065  GGCACATGGAAATGTCACTACCACGGACCCTGAGTATCGCCCAGGGGCACTGGCAACCTTCTCGTGCCTCCCAG  1138
            |||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||..|.||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1275  GGCTCACGGCAATGTGACCACTACAGATCCTGAGTTCCACCCAGGAGCACTGGCCACCTTCTCATGCCTCCCAG  1348

Query 1139  GATATGCCCTGGAGCCCCCTGGGCCCCCCAATGCCATCGAATGTGTGGATCCCACAGAACCCCACTGGAACGAC  1212
            |||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1349  GATATGCTCTGGAGCCACCAGGACCCCCCAATGCTATCGAATGTGTGGATCCCACCGAACCCCACTGGAACGAC  1422

Query 1213  ACAGAGCCGGCCTGCAAAGCCATGTGTGGAGGGGAGCTGTCGGAACCAGCTGGCGTGGTCCTCTCTCCCGACTG  1286
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1423  ACAGAGCCAGCCTGCAAGGCCATGTGTGGAGGAGAGCTGTCTGAGCCAGCTGGTGTGGTACTCTCTCCCGACTG  1496

Query 1287  GCCCCAGAGCTATAGCCCGGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCGTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC  1360
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  GCCCCAGAGTTACAGCCCTGGCCAAGACTGCGTGTGGGGCCTGCACGTCCAGGAAGAGAAGCGCATCTTGCTCC  1570

Query 1361  AAGTTGAGATATTGAATGTGCGGGAAGGGGACATGCTGACGCTGTTCGACGGGGACGGTCCCAGCGCCCGAGTC  1434
            |||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1571  AAGTTGAAATCTTGAATGTTCGCGAAGGGGATATGCTAACACTGTTCGACGGGGACGGTCCGAGCGCTCGAGTC  1644

Query 1435  TTGGCCCAGCTGCGGGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTTCTCTCCTCTGGGCCCGACCTCACACTGCAGTTTCA  1508
            .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1645  CTGGCCCAGCTGCGAGGACCTCAGCCGCGCCGCCGCCTCCTCTCCTCTGGACCTGATCTCACTCTGCAGTTTCA  1718

Query 1509  GGCACCGCCCGGGCCCCCAAATCCAGGCCTGGGCCAGGGCTTCGTATTGCACTTCAAAGAGGTCCCGAGGAACG  1582
            ||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1719  GGCACCCCCTGGTCCCCCAAATCCGGGCCTAGGCCAGGGTTTCGTGTTACATTTCAAAGAGGTCCCGAGAAACG  1792

Query 1583  ACACGTGCCCCGAGCTGCCACCTCCGGAGTGGGGCTGGAGAACGGCATCCCACGGGGACCTGATCCGGGGCACG  1656
            |.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1793  ATACGTGCCCGGAGCTACCACCACCTGAGTGGGGCTGGAGGACAGCATCCCACGGGGACCTTATCCGGGGTACA  1866

Query 1657  GTGCTCACCTACCAGTGCGAGCCTGGCTACGAGCTGCTAGGCTCCGACATTCTCACTTGCCAGTGGGACCTGTC  1730
            |||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1867  GTGCTCACCTATCAATGCGAGCCTGGCTATGAACTACTGGGATCAGACATCCTCACTTGCCAATGGGACCTGTC  1940

Query 1731  TTGGAGCGCCGCGCCGCCCGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATTGCCAACGGGCACC  1804
            .||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||.|
Sbjct 1941  CTGGAGCGCGGCGCCACCTGCCTGCCAAAAGATCATGACTTGTGCTGACCCTGGCGAGATCACCAATGGCCATC  2014

Query 1805  GCACCGCCTCGGACGCCGGCTTCCCCGTTGGCTCCCACGTCCAGTACCGCTGCCTGCCAGGGTACAGCCTCGAG  1878
            |.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2015  GGACTGCCTCAGATGCTGGTTTCCCTGTGGGCTCCCACGTCCAGTATCGCTGTCTGCCAGGGTACAGCCTGGAA  2088

Query 1879  GGGGCAGCCATGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGCGATAGGGTCCCCAAATGCGC  1952
            ||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 2089  GGAGCAGCTGTGCTCACCTGCTACAGCCGGGACACAGGCACACCCAAGTGGAGTGATCGGGTCCCCAAATGCGC  2162

Query 1953  CTTGAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCGGGGGTTCCCGAGAATGGCTACCAGACGCTGTACAAGCACCACTACC  2026
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2163  CTTAAAGTACGAGCCGTGCCTGAACCCCGGTGTTCCTGAGAATGGTTACCAAACTCTGTACAAGCATCACTACC  2236

Query 2027  AGGCGGGCGAGTCTCTGCGCTTCTTCTGCTATGAGGGCTTTGAGCTTATCGGCGAGGTCACCATCACCTGTGTG  2100
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2237  AAGCGGGCGAGTCGCTACGCTTCTTCTGCTACGAGGGCTTTGAGCTCATCGGCGAGGTCACCATCACATGTGTA  2310

Query 2101  CCCGGCCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTTGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG  2174
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311  CCCGGTCACCCCTCCCAGTGGACCAGCCAGCCCCCACTCTGCAAAGTGGCCTATGAGGAGCTCCTGGACAACCG  2384

Query 2175  AAAACTGGAAGTGACCCAGACCACAGATCCATCACGGCAGCTGGAAGGGGGGAACCTGGCCCTGGCCATCCTGC  2248
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||..|||||||||||.
Sbjct 2385  AAAACTGGAAGTGACCCAGACTACAGACCCATCACGGCAGCTGGAGGGTGGTAATCTCGCTTTGGCCATCCTGT  2458

Query 2249  TGCCTCTAGGCTTGGTCATTGTCCTCGGCAGTGGCGTTTACATCTACTACACCAAGCTTCAGGGAAAGTCCCTT  2322
            ||||.||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 2459  TGCCCCTGGGCTTGGTCATTGTCCTTGGCATTGGCGTTTACATATACTACACTAAGCTACAAGGAAAATCCCTC  2532

Query 2323  TTCGGCTTCTCGGGCTCCCACTCCTACAGCCCCATCACCGTGGAGTCGGACTTCAGCAACCCGCTGTATGAAGC  2396
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2533  TTTGGCTTCTCGGGTTCTCACTCTTACAGTCCCATTACGGTGGAGTCAGACTTCAGCAACCCACTGTATGAAGC  2606

Query 2397  TGGGGATACGCGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2427
            ||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2607  TGGGGATACGAGGGAGTATGAAGTTTCCATC  2637