Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08018
• Subject: NM_012336.4
• Aligned Length: 1368
• Identities: 1223
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTAAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74

Query   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAG------------------------------------------  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT  148

Query  107  --------------------------------------------------------------------------  106
                                                                                      
Sbjct  149  TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG  222

Query  107  ----------------------------AGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  152
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  296

Query  153  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  370

Query  227  TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA  444

Query  301  AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC  518

Query  375  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  592

Query  449  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  666

Query  523  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  740

Query  597  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAG  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAG  814

Query  671  ATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGAC  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGAC  888

Query  745  GGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCG  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCG  962

Query  819  AGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAG  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAG  1036

Query  893  CCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAG  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAG  1110

Query  967  GTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGC  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGC  1184

Query 1041  CCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGG  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGG  1258

Query 1115  AGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGC  1188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGC  1332

Query 1189  CAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1368