Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08019
- Subject:
- NM_026272.3
- Aligned Length:
- 1527
- Identities:
- 1144
- Gaps:
- 162
Alignment
Query 1 ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGT---- 70
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGTGTGAGCACTGCACACGAAAGGAATGTAGTAAAAAATCAAAAACTGATGACCAGGAGAATGTGTCCAG 74
Query 71 ----------CAGC----CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGG 130
|||| |||||...|.||.||||||.||||.|.||.||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 75 TGATGGGGCCCAGCCAAGCGATGGGGCCAGCCCAGCCAAGGAGAGTGAAGAGAAGGGAGAGTTCCATAAATTGG 148
Query 131 CTGATGCCAAGATATTTTTGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTT 204
|||||||.||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||..||||||||.|||||.|||
Sbjct 149 CTGATGCAAAAATATTTCTGAGTGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTGTGACTGTGGAGGAAGGTGTCCAGCTT 222
Query 205 TCCCAGCAAAATGCCAAGGACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGT 278
||.|||||.|.|||||||||||||.|.|..||.|||||.|||||.||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 TCTCAGCAGAGTGCCAAGGACTTCCTTCATGTCCTGAATCTTAATAAGAGATGTGATACCTCAAAGCACAGAGT 296
Query 279 GCTGGTAGTGTCTGTGTGTCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCAT 352
.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 TCTGGTTGTGTCTGTGTGTCCTCAGTCTCTACCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTCACTGATGCAT 370
Query 353 CCAGAAGACTCTGTGGTTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTT 426
|.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 371 CTAGAAGGCTGTGTGGCTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTCGACACCACAATCGCTGCAGATTTC 444
Query 427 AGTATCCTGGAGAGTCAAAAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCAT 500
||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||.|||.|||||||||||..|.||....||||||||
Sbjct 445 AGCATTCTGGAGAGTCAGAAGGAGTTTGTACGCCGGTATCACCAACACAGTGAGGAACAGCGTGAACTGCCCAT 518
Query 501 GCTGACCTCTGCCTGTCCTGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCC--ACCT 572
|.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||| .||| |.||
Sbjct 519 GTTGACCTCTGCCTGTCCTGGTTGGGTCAGATATGCTGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCA--TCCCATATCT 590
Query 573 CTGCACCGCCAAGTCCCCCCAGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGT 646
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 591 CTGTACCGCCAAGTCCCCCCAGCAGGTCATGGGCTCCTTGGTGAAGGATTACTTTGCCAGGCAGCAGAATCTGT 664
Query 647 CTCCAGAGAAGATTTTCCACGTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTT 720
||||||||||.||.|||||.||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||..||..|.|||
Sbjct 665 CTCCAGAGAAAATCTTCCATGTTGTCGTGGCTCCTTGCTATGATAAGAAGCTGGAAGCTCTTCGAGAGGGACTT 738
Query 721 CCCCCTGCTTTGCATGGCTCCCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAC 794
.||.||.||||..||||..|.||||||.|||||||.|||.|.|||||
Sbjct 739 TCCACTACTTTAAATGGTGCTCGGGGCACTGACTGTGTGCTGACATC--------------------------- 785
Query 795 ACCTGTGATCACAGCTACTCGGGAGGCTGCGGCAAGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGCGAG 868
Sbjct 786 -------------------------------------------------------------------------- 785
Query 869 ACAAGATTGCACCACTGGACTCCAGCCTGGGCGGCGGAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTC 942
|||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 786 -------------------------------------AGGTGAAATTGCTCAGATAATGGAGCAAAGTGACCTC 822
Query 943 TCAGTGAGAGATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGC 1016
||.||||.|||...|||.||.||.|||.|||||||||||.|||||||||....|||...||||||||||||||.
Sbjct 823 TCTGTGAAAGACATTGCTGTGGATACTTTGTTTGGAGACATGAAGGAGGTGGCAGTCCAGCGTCATGATGGAGT 896
Query 1017 CAGCTCAGACGGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGG 1090
.||.|||||.|||||.|||||.|||.|.||||||||.||.||||||||||||||...||||.|.|||||||||.
Sbjct 897 GAGTTCAGATGGGCATCTGGCTCACGTTTTCAGACACGCAGCCAAGGAGCTGTTTGGCGAGCACGTGGAGGAGA 970
Query 1091 TCACTTACCGAGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGC 1164
||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||..|..|.|||
Sbjct 971 TCACCTACCGTGCACTCAGGAACAAAGACTTCCATGAGGTTACCCTTGAGAAGAACGGGGAGGTCCTACTGCGC 1044
Query 1165 TTTGCTGCAGCCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCA 1238
|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||..||||||.|||
Sbjct 1045 TTTGCTGCAGCGTACGGCTTTCGCAACATTCAGAACATGATCCAGAAGCTCAAGAAGGGCAAACTCCCATACCA 1118
Query 1239 CTTTGTGGAGGTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATG 1312
||||||||||||.|||||.|||.|..||||.|||||||||||||||||||||||.|||||....|||||.||..
Sbjct 1119 CTTTGTGGAGGTGCTCGCGTGTCCCAGAGGTTGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCACAGACAGAGGACGGCCACA 1192
Query 1313 CGGATAAGGCCCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCA 1386
|.|||...||.|||||||.|||.||||||||.||.|||.|.|.||||||||||||||..||.|||..||||.||
Sbjct 1193 CAGATCGTGCACTGCTGCAGCAAATGGAAGGGATCTACTCCGGCATCCCTGTGCGGCCCCCAGAGAGCAGTACA 1266
Query 1387 CACGTGCAGGAGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGA-TCAACTCCCCCAAGGCCCAAGAGGTGCTGCATACCA 1459
||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.| |.|| ||.|||||.|.|||.|||||||||||.||||
Sbjct 1267 CATGTGCAGGAGTTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGTACTGAA-TCTCCCAAAGTCCAGGAGGTGCTGCACACCA 1339
Query 1460 CGTACCAGAGCCAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG 1506
..|||||||||..|||||...|||||.||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1340 GCTACCAGAGCTTGGAGCCCTGCACAGACGGCCTGGATATCAAGTGG 1386