Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08019
• Subject: XM_006722278.4
• Aligned Length: 1506
• Identities: 1232
• Gaps: 273

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74

Query   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT  148

Query  149  TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG  222

Query  223  GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  296

Query  297  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  370

Query  371  TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA  444
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  371  TCCTCAAAAGTCT-------------------------------------------------------------  383

Query  445  AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC  518
                                                                                      
Sbjct  384  --------------------------------------------------------------------------  383

Query  519  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  457

Query  593  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  531

Query  667  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  605

Query  741  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCACACCTGTGATCACAGCTACTC  814
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  606  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATC-----------------------------------------------  632

Query  815  GGGAGGCTGCGGCAAGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGCGAGACAAGATTGCACCACTGGAC  888
                                                                                      
Sbjct  633  --------------------------------------------------------------------------  632

Query  889  TCCAGCCTGGGCGGCGGAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGT  962
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  -----------------AGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGT  689

Query  963  CGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  690  CGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGG  763

Query 1037  CACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  764  CACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGA  837

Query 1111  AACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838  AACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTT  911

Query 1185  TCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  TCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCT  985

Query 1259  GTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  GTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGG  1059

Query 1333  CAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  CAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCA  1133

Query 1407  GGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCAAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134  GGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTG  1207

Query 1481  GCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1506
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208  GCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1233