Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08070
Subject:
NM_001164544.1
Aligned Length:
832
Identities:
659
Gaps:
170

Alignment

Query   1  MPGGGPQGAPAAAGGGGVSHRAGSRDCLPPAACFRRRRLARRPGYMRSSTGPGIGFLSPAVGTLFRFPGGVSGE  74
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Sbjct   1  MPGGGPQGAPAAAGGGGVSHRAGSRDCLPPAACFRRRRLARRPGYMRSSTGPGIGFLSPAVGTLFRFPGGVSGE  74

Query  75  ESHHSESRARQCGLDSRGLLVRSPVSKSAAAPTVTSVRGTSAHFGIQLRGGTRLPDRLSWPCGPGSAGWQQEFA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ESHHSESRARQCGLDSRGLLVRSPVSKSAAAPTVTSVRGTSAHFGIQLRGGTRLPDRLSWPCGPGSAGWQQEFA  148

Query 149  AMDSSETLDASWEAACSDGARRVRAAGSLPSAELSSNSCSPGCGPEVPPTPPGSHSAFTSSFSFIRLSLGSAGE  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AMDSSETLDASWEAACSDGARRVRAAGSLPSAELSSNSCSPGCGPEVPPTPPGSHSAFTSSFSFIRLSLGSAGE  222

Query 223  RGEAEGCPPSREAESHCQSPQEMGAKAASLDGPHEDPRCLSQPFSLLATRVSADLAQAARNSSRPERDMHSLPD  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  RGEAEGCPPSREAESHCQSPQEMGAKAASLDGPHEDPRCLSRPFSLLATRVSADLAQAARNSSRPERDMHSLPD  296

Query 297  MDPGSSSSLDPSLAGCGGDGSSGSGDAHSWDTLLRKWEPVLRDCLLRNRRQMEVISLRLKLQKLQEDAVENDDY  370
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Sbjct 297  MDPGSSSSLDPSLAGCGGDGSSGSGDAHSWDTLLRKWEPVLRDCLLRNRRQMEVISLRLKLQKLQEDAVENDDY  370

Query 371  DKAETLQQRLEDLEQEKISLHFQLPSRQPALSSFLGHLAAQVQAALRRGATQQASGDDTHTPLRMEPRLLEPTA  444
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Sbjct 371  DKAETLQQRLEDLEQEKISLHFQLPSRQPALSSFLGHLAAQVQAALRRGATQQASGDDTHTPLRMEPRLLEPTA  444

Query 445  QDSLHVSITRRDWLLQEKQQLQKEIEALQARMFVLEAKDQQLRREIEEQEQQLQWQGCDLTPLVGQLSLGQLQE  518
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Sbjct 445  QDSLHVSITRRDWLLQEKQQLQKEIEALQARMFVLEAKDQQLRREIEEQEQQLQWQGCDLTPLVGQLSLGQLQE  518

Query 519  VSKALQDTLASAGQIPFHAEPPETIRSLQERIKSLNLSLKEITTKVCMSEKFCSTLRKKVNDIETQLPALLEAK  592
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Sbjct 519  VSKALQDTLASAGQIPFHAEPPETIRSLQERIKSLNLSLKEITTKVCMSEKFCSTLRKKVNDIETQLPALLEAK  592

Query 593  MHAISGNHFWTAKDLTEEIRSLTSEREGLEGLLSKLLVLSSRNVKKLGSVKEDYNRLRREVEHQETAYETSVKE  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..    
Sbjct 593  MHAISGNHFWTAKDLTEEIRSLTSEREGLEGLLSKLLVLSSRNVKKLGSVKEDYNRLRREVEHQETAYGR----  662

Query 667  NTMKYMETLKNKLCSCKCPLLGKVWEADLEACRLLIQSLQLQEARGSLSVEDERQMDDLEGAAPPIPPRLHSED  740
                                                                                     
Sbjct 663  --------------------------------------------------------------------------  662

Query 741  KRKTPLKESYILSAELGEKCEDIGKKLLYLEDQLHTAIHSHDEDLIQSLRRELQMVKETLQAMILQLQPAKEAG  814
                                                                                     
Sbjct 663  --------------------------------------------------------------------------  662

Query 815  EREAAASCMTAGVHEAQA  832
                             
Sbjct 663  ------------------  662