Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08137
• Subject: XM_017026721.1
• Aligned Length: 2151
• Identities: 1931
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGAGCGTGGACAAAGCTGAGCTATGCGGGTCTCTGCTCACCTGGTTACAGACGTTCCACGTTCCGTCTCCCTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCCAGCCCTCAGGACCTGAGCAGCGGCCTTGCCGTAGCCTATGTGCTGAACCAGATAGACCCCTCCTGGTTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGAGGCATGGCTCCAGGGCATCTCGGAAGATCCAGGTCCCAACTGGAAGCTGAAGGTCAGCAATCTGAAGATG  222
                                                                                   |||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query  223  GTCTTACGGAGCCTAGTAGAGTACTCCCAGGATGTCCTGGCGCATCCTGTGTCAGAAGAGCATCTCCCAGATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    4  GTCTTACGGAGCCTAGTAGAGTACTCCCAGGATGTCCTGGCGCATCCTGTGTCAGAAGAGCATCTCCCAGATGT  77

Query  297  GAGCCTCATTGGAGAGTTCTCAGACCCGGCAGAGCTCGGCAAGCTGCTTCAGCTGGTGCTGGGCTGTGCCATCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   78  GAGCCTCATTGGAGAGTTCTCAGACCCGGCAGAGCTCGGCAAGCTGCTTCAGCTGGTGCTGGGCTGTGCCATCA  151

Query  371  GTTGCGAGAAAAAGCAGGACCACATCCAGAGAATCATGACGCTGGAAGAATCGGTTCAGCATGTGGTGATGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  152  GTTGCGAGAAAAAGCAGGACCACATCCAGAGAATCATGACGCTGGAAGAATCGGTTCAGCATGTGGTGATGGAA  225

Query  445  GCCATCCAAGAGCTCATGACCAAAGACACTCCTGACTCCCTGTCACCAGAGACGTATGGCAACTTTGACAGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226  GCCATCCAAGAGCTCATGACCAAAGACACTCCTGACTCCCTGTCACCAGAGACGTATGGCAACTTTGACAGCCA  299

Query  519  GTCCCGCAGGTACTATTTCCTAAGTGAGGAGGCTGAGGAGGGGGACGAATTACAGCAGCGCTGTCTGGATCTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  GTCCCGCAGGTACTATTTCCTAAGTGAGGAGGCTGAGGAGGGGGACGAATTACAGCAGCGCTGTCTGGATCTGG  373

Query  593  AGCGGCAGCTGATGCTCCTGTCAGAGGAGAAGCAGAGCCTGGCGCAAGAGAATGCAGGGCTGCGGGAGCGGATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  374  AGCGGCAGCTGATGCTCCTGTCAGAGGAGAAGCAGAGCCTGGCGCAAGAGAATGCAGGGCTGCGGGAGCGGATG  447

Query  667  GGCCGGCCTGAAGGCGAGGGTACCCCAGGTCTCACTGCCAAGAAGCTGCTGCTGCTGCAATCCCAGCTGGAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  GGCCGGCCTGAAGGCGAGGGTACCCCAGGTCTCACTGCCAAGAAGCTGCTGCTGCTGCAATCCCAGCTGGAGCA  521

Query  741  GTTGCAGGAGGAGAACTTCAGGCTGGAGAGTGGCAGGGAGGATGAGCGCCTGCGCTGTGCCGAGCTGGAGAGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  522  GTTGCAGGAGGAGAACTTCAGGCTGGAGAGTGGCAGGGAGGATGAGCGCCTGCGCTGTGCCGAGCTGGAGAGGG  595

Query  815  AGGTTGCGGAGCTGCAGCACCGGAACCAGGCGCTGACTAGCCTGGCCCAGGAGGCACAGGCCCTGAAGGATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  596  AGGTTGCGGAGCTGCAGCACCGGAACCAGGCGCTGACTAGCCTGGCCCAGGAGGCACAGGCCCTGAAGGATGAG  669

Query  889  ATGGATGAACTACGGCAGTCTTCGGAGCGTGCTGGGCAGCTGGAGGCCACGCTGACCAGTTGCCGGCGCCGCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  670  ATGGATGAACTACGGCAGTCTTCGGAGCGTGCTGGGCAGCTGGAGGCCACGCTGACCAGTTGCCGGCGCCGCTT  743

Query  963  GGGCGAGCTGAGGGAGCTGCGGCGGCAGGTGCGGCAGCTGGAGGAACGCAACGCCGGCCACGCCGAGCGCACGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  GGGCGAGCTGAGGGAGCTGCGGCGGCAGGTGCGGCAGCTGGAGGAACGCAACGCCGGCCACGCCGAGCGCACGC  817

Query 1037  GACAACTGGAGGATGAGCTACGCCGAGCGGGCTCCCTGCGCGCCCAGCTGGAGGCGCAGCGGCGGCAGGTGCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  818  GACAACTGGAGGATGAGCTACGCCGAGCGGGCTCCCTGCGCGCCCAGCTGGAGGCGCAGCGGCGGCAGGTGCAG  891

Query 1111  GAACTGCAGGGCCAGCGGCAGGAGGAGGCCATGAAGGCCGAGAAATGGCTATTTGAATGCCGCAACCTGGAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  GAACTGCAGGGCCAGCGGCAGGAGGAGGCCATGAAGGCCGAGAAATGGCTATTTGAATGCCGCAACCTGGAGGA  965

Query 1185  AAAGTATGAGTCGGTGACAAAGGAGAAGGAGCGGCTGTTGGCGGAGCGGGACTCCTTGCGGGAGGCCAATGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  966  AAAGTATGAGTCGGTGACAAAGGAGAAGGAGCGGCTGTTGGCGGAGCGGGACTCCTTGCGGGAGGCCAATGAGG  1039

Query 1259  AGCTGCGCTGCGCCCAGCTGCAGCCGCGGGGGTTGACCCAGGCCGATCCCTCACTGGATCCCACCTCCACACCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040  AGCTGCGCTGCGCCCAGCTGCAGCCGCGGGGGTTGACCCAGGCCGATCCCTCACTGGATCCCACCTCCACACCC  1113

Query 1333  GTGGATAACTTAGCCGCAGAGATCCTGCCTGCGGAGCTCAGGGAGACGCTCCTGCGGCTTCAGCTGGAGAACAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114  GTGGATAACTTAGCCGCAGAGATCCTGCCTGCGGAGCTCAGGGAGACGCTCCTGCGGCTTCAGCTGGAGAACAA  1187

Query 1407  GCGGCTGTGCAGGCAGGAGGCGGCCGACCGGGAGCGGCAGGAGGAGCTGCAGCGCCAGCTGGAGGATGCCAACC  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1188  GCGGCTGTGCAGGCAGGAGGCGGCCGACCGGGAGCGGCAGGAGGAGCTGCAGCGCCACCTGGAGGATGCCAACC  1261

Query 1481  GCGCGCGCCACGGGTTGGAGACGCAGCACCGGCTGAACCAGCAGCAGCTATCCGAGCTGCGGGCCCAGGTGGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262  GCGCGCGCCACGGGTTGGAGACGCAGCACCGGCTGAACCAGCAGCAGCTATCCGAGCTGCGGGCCCAGGTGGAG  1335

Query 1555  GACCTGCAGAAAGCCCTGCAGGAGCAGGGGGGCAAGACTGAAGATTCCATTTTGCTGAAAAGGAAGCTGGAGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336  GACCTGCAGAAAGCCCTGCAGGAGCAGGGGGGCAAGACTGAAGATTCCATTTTGCTGAAAAGGAAGCTGGAGGA  1409

Query 1629  ACATTTGCAGAAGCTTCATGAGGCAGATCTGGAGTTGCAGAGGAAGCGGGAGTACATTGAGGAGCTGGAGCCAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410  ACATTTGCAGAAGCTTCATGAGGCAGATCTGGAGTTGCAGAGGAAGCGGGAGTACATTGAGGAGCTGGAGCCAC  1483

Query 1703  CCACTGACAGCAGCACAGCCCGGCGGATCGAGGAGCTGCAGCATAACTTGCAGAAGAAGGACGCGGACTTGCGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484  CCACTGACAGCAGCACAGCCCGGCGGATCGAGGAGCTGCAGCATAACTTGCAGAAGAAGGACGCGGACTTGCGG  1557

Query 1777  GCCATGGAGGAGCGATACCGCCGCTACGTGGACAAGGCCCGCATGGTCATGCAGACCATGGAACCCAAGCAGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558  GCCATGGAGGAGCGATACCGCCGCTACGTGGACAAGGCCCGCATGGTCATGCAGACCATGGAACCCAAGCAGCG  1631

Query 1851  GCCAGCTGCGGGGGCACCTCCAGAACTCCATTCCCTGAGGACACAGCTCCGAGAACGGGATGTCCGCATCCGAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632  GCCAGCTGCGGGGGCACCTCCAGAACTCCATTCCCTGAGGACACAGCTCCGAGAACGGGATGTCCGCATCCGAC  1705

Query 1925  ACCTGGAGATGGACTTTGAGAAAAGCCGAAGTCAGCGGGAGCAGGAAGAAAAGCTGCTCATCAGTGCCTGGTAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706  ACCTGGAGATGGACTTTGAGAAAAGCCGAAGTCAGCGGGAGCAGGAAGAAAAGCTGCTCATCAGTGCCTGGTAT  1779

Query 1999  AATATGGGCATGGCCTTGCAGCAGCGAGCTGGGGAGGAGCGGGCGCCTGCCCATGCCCAGTCATTCCTGGCACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780  AATATGGGCATGGCCTTGCAGCAGCGAGCTGGGGAGGAGCGGGCGCCTGCCCATGCCCAGTCATTCCTGGCACA  1853

Query 2073  GCAGCGGCTGGCAACCAATTCTCGCCGTGGACCCTTGGGACGCCTGGCATCTCTGAACCTTCGCCCCACTGACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854  GCAGCGGCTGGCAACCAATTCTCGCCGTGGACCCTTGGGACGCCTGGCATCTCTGAACCTTCGCCCCACTGACA  1927

Query 2147  AGCAC  2151
            |||||
Sbjct 1928  AGCAC  1932