Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08157
- Subject:
- NR_077061.1
- Aligned Length:
- 1709
- Identities:
- 1364
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTTTCTGGTAGATATTTTTAAGTAACTTGATATAATAGATTAAAATGTATATATTTCAAAAGAGAAAAGGAA 74
Query 1 -------------------------------------ATGGCGGCAGGAGGCAGTGGCGTTGGTGGGAAGCGCA 37
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Sbjct 75 GCAGTAAGAAATAAGATAGAGGAGGGCCTTTGACAAGATGGCGGCAGGAGGCAGTGGCGTTGGTGGGAAGCACA 148
Query 38 GCTCGAAAAGCGATGCCGATTCTGGTTTCCTGGGGCTGCGGCCCACTTCGGTGGACCCAGCGCTGA---GGCGG 108
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Sbjct 149 GCTCGAAAAGCGATAACGATTCTGGTTTCCTGGGGCTGCGGCCCATTTCGGCGGACCCAGCGCTGAGGCGGCGG 222
Query 109 CGGCGGCGAGGCCCAAGAAATAAGAAGCGGGGCTGGCGGCGGCTTGCTCAGGAGCCGCTGGGGCTGGAGGTTGA 182
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Sbjct 223 CGGCGGCGAGGCCCAAGAAATAAGAAGTGGGACTGGCGGAGGCTTGCGCAGGAGCCGCTGGGGCTGGAGGTTGA 296
Query 183 CCAGTTCCTGGAAGACGTGCGGCTACAGGAGCGCACGAGCGGTGGCTTGTTGTCAGAGGCCCCAAATGAAAAAC 256
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Sbjct 297 CCAGTTCCTGGAAGACGTGCGGCTACAGGGGCGCATGAGCGGTGGCTTGTTGAGAGAGGCCCCAAATGAAAAAC 370
Query 257 TCTTCTTCGTGGACACTGGCTCCAAGGAAAAAGGGCTGACAAAGAAGAGAACCAAAGTCCAGAAGAAGTCACTG 330
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Sbjct 371 TCTTCTTCGTGGACACCGGCTCCAAGGAAAAAGGGCT----AAGAAGAGAACCAAAGTCCAGAAGAAGTCACTG 440
Query 331 CTTCTCAAGAAACCCCTTCGGGTTGACCTCATCCTCGAGAACACATCCAAAGTCCCTGCCCCCAAAGACGTCCT 404
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Sbjct 441 CTTCTCAAGAAACCCCTTCGGGTTGACCTCATCCTCGAG-ACACATCCAAAGTCCCTGCCCCCAAAGACGTCCT 513
Query 405 CGCCCACCAGGTCCCCAACGCCAAGAAGCTCAGGCGGAAGGAGCAGCTATGGGAGAAGCTGGCCAAGCAGGGCG 478
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Sbjct 514 CGCCCACCAGGTCCCGAACGCCAAGAAGCTCAGGCGGAAGGAGCAGCTATGGGAGAATCTGGCCAAGCAGGGCG 587
Query 479 AGCTGCCCCGGGAGGTGCGCAGGGCCCAGGCCCGGCTCCTCAACCCTTCTGCAACAAGGGCCAAGCCCGGGCCC 552
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Sbjct 588 AGCTGCCCCGGGAGGTGCGCAGGGCCCAGGCCCGGCTCCTCAACCCTCCCACAGCCGGGGCCAAGCCCGGGCCC 661
Query 553 CAGGACACCGTAGAGCGGCCCTTCTACGACCTCTGGGCCTCAGACAACCCCCTGGACAGGCCGTTGGTTGGCCA 626
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Sbjct 662 CAGGACACCGTGGAGCGGCCCTTCTACGAACTCTGGGCATCAGACAACCCCCTGGACTGGCCATTGTTTGGCCA 735
Query 627 GGATGAGTTTTTCCTGGAGCAGACCAAGAAGAAAGGAGTGAAGCGGCCAGCACGCCTGCACACCAAGCCGTCCC 700
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Sbjct 736 GGATGAGTTTTTCCTGGAGCAGACCAAGAAGAAAGGAGTGAAGCGGCCACCACGCCTGCACACCAAGCCGTCCC 809
Query 701 AGGCGCCCGCCGTGGAGGTGGCGCCTGCCGGAGCTTCCTACAATCCATCCTTTGAAGACCACCAGACCCTGCTC 774
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Sbjct 810 AGGCACCCGCCGTGGAGGTGGCGCCTGCCGGAGCTTCCTACAACCCGTACTTTGAAGACCACCAGACCCTGCTC 883
Query 775 TCAGCGGCCCACGAGGTGGAGTTGCAGCGGCAGAAGGAGGCGGAGAAGCTGGAGCGGCAGCTGGCCCTGCCCGC 848
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Sbjct 884 TCAGCGGCCCACGAGGTGGAGTTGCAGCGGCAGAAGGAGGCGGAGAAGCTGGAGCGGCAGCTGGCCCTGCCCGC 957
Query 849 CACGGAGCAGGCCGCCACCCAGGAGTCCACATTCCAGG-AGCTGTGCGAGGGGCTGCTGGAGGAGTCGGATGGT 921
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Sbjct 958 CACAGAGCAGGCCGCCACCCAGGAGTCCACGTTCCAGGTAGCCGTGCGAGGGGCTGCTGGAGGAGTCAGAGGGT 1031
Query 922 GAGGGGGAGCCAGGCCAGGGCGAGGGGCCGGAGGCTGGGGATGCCGAGGTCTGTCCCACGCCCGCCCGCCTGGC 995
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Sbjct 1032 CCGGGGGAGCCAGGCCAGGGCGAGGGGCCGGAGGCTGGGGATGCCGAGGTCTGTCCCACGCCCACCCGCCTGGC 1105
Query 996 CACCACAGAGAAGAAGACGGAGCAGCAGCGGCGGCGGGAGAAGGCTGTGCACAGGCTGCGGGTACAGCAGGCCG 1069
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Sbjct 1106 CGCCACAGAGAAGGAGACGGAGCAGCAGCGGCGGCGGGAGAAGGCTGCGCGCAGGCTGCGGGTACAGCAGGCCG 1179
Query 1070 CGTTGCGGGCCGC------CCGGCTCCGGCACCAGGAGCTGTTCCGGCTGCGCGGGATCAAGGCCCAGGTGGCC 1137
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Sbjct 1180 CGTTGCGGACTGCCAGGCTCCGGCCCCGGCACCGGGAGGTGTTCCTGCTGCGCGGGATCAAGGCCCAGGTGGCC 1253
Query 1138 CTGAGGCTGGCGGAGCTGGCGCGGCGGCGGAGGCGGCGGCAGGCGCGGCGGGAGGCTGAGGCTGACAAGCCCCG 1211
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Sbjct 1254 CTGAGGCTGGCGGAGCTGGCGCGGCGGCGGAGGCAGCGGCAGGCACGGCGGAAGGCCGAGGCTGACAAGCCCCG 1327
Query 1212 AAGGCTGGGACGGCTCAAGTACCAGGCACCTGACATCGACGTGCAGCTGAGCTCGGAGCTGACAGACTCGCTCA 1285
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Sbjct 1328 AAGGCTGGGGCGGCTCAAGTACCAGGCACCTGACATCGACGTGCAGCTGAGCTCGGAGCTGGCAGACTCGCTCA 1401
Query 1286 GGACCCTGAAGCCCGAGGGCAACATCCTTCGAGACCGGTTCAAGAGCTTCCAGAGGAGGAATATGATCGAGCCT 1359
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Sbjct 1402 GGACCCTGAAGCCCGAGGGCGACATCCTTCGAGGCCGGTTCAAGAGCTTCCAGAGGAGGAATATGATCCAGCCT 1475
Query 1360 CGAGAGAGAGCCAAGTTCAAACGCAAGTACAAGGTGAAGCTGGTGGAGAAGCGGGCGTTCCGTGAGATCCAGTT 1433
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Sbjct 1476 CGACAGAGAGCCAAGTTCAAACCCAGGTACAAGGTGAAGCTGGGGGAGAAGCGGGCGTTCCGCGAGATCCAGTT 1549
Query 1434 G------------------------------------------------------------------------- 1434
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Sbjct 1550 GTAGCTCCCATCAGAGGCCGGAGCCTCGCCTTTCAATAAAAAGTCCCTTCTAGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1623
Query 1435 -------------------------------------------------------------------------- 1434
Sbjct 1624 AAGAGGAGGAAGAATTGCAAATAAAATGGCAGGCATAGTTCTAAGTGCTTTACATATGTATTCACAGTAAACCT 1697
Query 1435 ------- 1434
Sbjct 1698 TCGAAAA 1704
