Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08159
- Subject:
- NM_015774.3
- Aligned Length:
- 1405
- Identities:
- 1217
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGGGCCGCGGCTGGGGATT-CTTGTTTGGCCTCCTGGGCGCCGTGTGGCTGCTCAGCTCGGGCCACGGAGAGG 73
||||||||||.||||||.|| ||.| ||||.||||||||||.||||||||||||..|||.|||||||||.||||
Sbjct 1 ATGGGCCGCGCCTGGGGCTTGCTCG-TTGGACTCCTGGGCGTCGTGTGGCTGCTGCGCTTGGGCCACGGCGAGG 73
Query 74 AGCAGCCCCCGGAGACAGCGGCACAGAGGTGCTTCTGCCAGGTTAGTGGTTACTTGGATGATTGTACCTGTGAT 147
|||.||..||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||
Sbjct 74 AGCGGCGGCCGGAGACAGCGGCACAGCGCTGCTTCTGCCAGGTTAGTGGTTACCTGGACGACTGTACCTGTGAT 147
Query 148 GTTGAAACCATTGATAGATTTAATAACTACAGGCTTTTCCCAAGACTACAAAAACTTCTTGAAAGTGACTACTT 221
||.||.|||||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GTCGAGACCATCGATAAGTTTAATAACTACAGACTTTTCCCAAGACTACAAAAGCTTCTTGAAAGTGACTACTT 221
Query 222 TAGGTATTACAAGGTAAACCTGAAGAGGCCGTGTCCTTTCTGGAATGACATCAGCCAGTGTGGAAGAAGGGACT 295
|||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct 222 TAGATATTACAAGGTGAACTTGAAGAAGCCTTGTCCTTTCTGGAATGACATCAACCAGTGTGGAAGAAGAGACT 295
Query 296 GTGCTGTCAAACCATGTCAATCTGATGAAGTTCCTGATGGAATTAAATCTGCGAGCTACAAGTATTCTGAAGAA 369
||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 296 GTGCCGTCAAACCCTGCCATTCTGATGAAGTTCCTGATGGAATTAAGTCTGCGAGCTACAAGTATTCTGAGGAA 369
Query 370 GCCAATAATCTCATTGAAGAATGTGAACAAGCTGAACGACTTGGAGCAGTGGATGAATCTCTGAGTGAGGAAAC 443
||| ||.|.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 370 GCC---AACCGCATTGAAGAATGTGAGCAAGCTGAGCGACTTGGAGCCGTGGATGAGTCTCTGAGTGAGGAGAC 440
Query 444 ACAGAAGGCTGTTCTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCTTCAGATAACTTCTGTGAAGCTGATGACATTCAGT 517
.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||..|||.||.||.||||
Sbjct 441 CCAGAAAGCTGTACTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCGTCAGACAGCTTCTGCGAAATTGACGATATACAGT 514
Query 518 CCCCTGAAGCTGAATATGTAGATTTGCTTCTTAATCCTGAGCGCTACACTGGTTACAAGGGACCAGATGCTTGG 591
||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 515 CCCCCGATGCTGAGTATGTGGACTTACTCCTTAACCCTGAGCGCTACACAGGCTACAAGGGGCCAGACGCTTGG 588
Query 592 AAAATATGGAATGTCATCTACGAAGAAAACTGTTTTAAGCCACAGACAATTAAAAGACCTTTAAATCCTTTGGC 665
|..|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||| .||||||||
Sbjct 589 AGGATATGGAGTGTCATCTATGAAGAAAACTGTTTTAAGCCACAGACAATTCAAAG---------GCCTTTGGC 653
Query 666 TTCTGGTCAAGGGACAAGTGAAGAGAACACTTTTTACAGTTGGCTAGAAGGTCTCTGTGTAGAAAAAAGAGCAT 739
||||||.|.|||.|.||||.||||||||||.|||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 654 TTCTGGGCGAGGAAAAAGTAAAGAGAACACATTTTACAACTGGCTAGAAGGCCTCTGTGTAGAAAAGAGAGCAT 727
Query 740 TCTACAGACTTATATCTGGCCTACATGCAAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGATATCTTTTACAAGAGACC 813
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 728 TCTACAGACTTATATCTGGCCTGCACGCAAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGGTATCTTTTACAAGATACT 801
Query 814 TGGTTAGAAAAGAAATGGGGACACAACATTACAGAATTTCAACAGCGATTTGATGGAATTTTGACTGAAGGAGA 887
|||.|.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 802 TGGCTGGAAAAGAAATGGGGTCACAATGTCACAGAGTTCCAGCAGCGCTTTGATGGGATTCTGACTGAAGGAGA 875
Query 888 AGGTCCAAGAAGGCTTAAGAACTTGTATTTTCTCTACTTAATAGAACTAAGGGCTTTATCCAAAGTGTTACCAT 961
|||.|||.|||||||.|.|||||||||.||.||.|||.|.|||||..||||||||.|.|||||||||.|.||||
Sbjct 876 AGGCCCACGAAGGCTGAGGAACTTGTACTTCCTGTACCTGATAGAGTTAAGGGCTCTCTCCAAAGTGCTTCCAT 949
Query 962 TCTTCGAGCGCCCAGATTTTCAACTCTTTACTGGAAATAAAATTCAGGATGAGGAAAACAAAATGTTACTTCTG 1035
|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||||||..|||||||||..||||||||||
Sbjct 950 TTTTTGAGCGTCCAGATTTTCAGCTCTTCACTGGGAATAAAGTTCAGGATGCAGAAAACAAAGCGTTACTTCTG 1023
Query 1036 GAAATACTTCATGAAATCAAGTCATTTCCTTTGCATTTTGATGAGAATTCATTTTTTGCTGGGGATAAAAAAGA 1109
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1024 GAGATACTTCATGAAATCAAGTCATTTCCTTTGCACTTCGATGAGAATTCTTTTTTTGCTGGGGATAAAAACGA 1097
Query 1110 AGCACACAAACTAAAGGAGGACTTTCGACTGCATTTTAGAAATATTTCAAGAATTATGGATTGTGTTGGTTGTT 1183
||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1098 AGCACATAAACTAAAGGAGGACTTCCGGCTACACTTTAGGAACATTTCAAGAATCATGGACTGTGTTGGCTGCT 1171
Query 1184 TTAAATGTCGTCTGTGGGGAAAGCTTCAGACTCAGGGTTTGGGCACTGCTCTGAAGATCTTATTTTCTGAGAAA 1257
|.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1172 TCAAGTGCCGCCTGTGGGGCAAGCTTCAGACGCAGGGGCTGGGCACTGCTCTGAAGATCTTGTTTTCCGAAAAA 1245
Query 1258 TTGATAGCAAATATGCCAGAAAGTGGACCTAGTTATGAATTCCATCTAACCAGACAAGAAATAGTATCATTATT 1331
.||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1246 CTGATCGCAAATATGCCGGAAAGCGGACCAAGTTATGAGTTCCAGCTAACCAGACAAGAAATAGTATCACTGTT 1319
Query 1332 CAACGCATTTGGAAGAATTTCTACAAGTGTGAAAAAATTAGAAAACTTCAGGAACTTGTTACAGAATATTCAT 1404
.||.|||||||||||.|||||.||||||||||.|.||.||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.
Sbjct 1320 TAATGCATTTGGAAGGATTTCCACAAGTGTGAGAGAACTAGAGAACTTCAGGCACTTGTTACAGAATGTTCAC 1392