Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08160
- Subject:
- NM_001135727.2
- Aligned Length:
- 1995
- Identities:
- 1813
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGATTACCAGGCCCAGCATGATGATGAGCTGACAATCAGCGTGGGTGAGGT 74
Query 75 CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG 148
Query 149 ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG 222
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||.|.||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct 149 ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGATATGAAGAAAGATCTTCTCTCTAACAAAGCTCCAGAGAAACCCATG 222
Query 223 CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG 296
|||||.||..|||||||||||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct 223 CACGATGTATCCAGTGGAAACGCTCTGCTTTCTTCTGAAACCATTTTAAGAACCAATAAACGAGGAGAACGACG 296
Query 297 GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 297 GAGACGCCGATGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAGCTGGAGCTGAAAGTCGGGGACA 370
Query 371 TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT 444
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCATAGAGGTTGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTGCTCAATGGGAAGACTGGAATGTTTCCT 444
Query 445 TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATCTCCCAGGATGAGCAGCTTTCCAAGTC 518
Query 519 AAGTTTAAGGGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAACG 592
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 AAGCTTAAGAGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGAGGCGACTCCAGCAGTACCAAGTCCGAAGGTGCCAACG 592
Query 593 GGACAGTGGCAACTGCAGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAG 666
||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGACCATGGCAACTGCAGCCATCCAGCCCAAGAAAGTTAAAGGAGTGGGGTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAG 666
Query 667 CCAATCAAACTAAGACCAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGAA 740
|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CCAATTAAACTAAGACCAAGGTCGATTGAAGTGGAAAATGACTTCCTGCCCGTCGAAAAGACAATTGGGAAGAA 740
Query 741 GTTACCTGCAACTACAGCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTACT 814
|||||||.||.|||||.|||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 741 GTTACCTCCAGCTACATCAACTCCAGACCCATCGAAGACGGAGATGGACAGCAGGACAAAGACCAAGGATTACT 814
Query 815 GCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 GCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAGGAAGGAGATATAGTGACTCTC 888
Query 889 ATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATAA 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 ATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAACTCAATGGCAGACGAGGCGTGTTTCCTGACAA 962
Query 963 CTTCGTGAAGTTACTTCCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCTC 1036
|||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 963 CTTCGTGAAGTTACTTCCATCGGACTTTGACAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAACCGCCACCTCCATCAGCTC 1036
Query 1037 CTGTCATCAAACAAGGGGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGAA 1110
|||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGTCGTCAAACAAGGGGCAGGTACCACAGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAAATACCTCCTGAAAGACCAGAA 1110
Query 1111 ATGCTTCCAAACAGAACAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCGT 1184
|..||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111 ACCCTTCCAAACAGAACAGAAGAGAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCTTCAGT 1184
Query 1185 TCCTGCCATACCGCCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCGA 1258
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct 1185 TCCTGCCATCCCACCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTGAACAGACCTGGTGCATTGCCCCCAA 1258
Query 1259 GAAGGCCGGAGAGACCGGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAGT 1332
||||.||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259 GAAGACCTGAGCGACCAGTGGGCCCACTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCAGGCAGC 1332
Query 1333 TCGCTATCTGGCATCCTGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCGT 1406
.|.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1333 GCACTCTCTGGCATCCTGGATAAGGACCTCTCAGACCGCAGCAATGATATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCTGT 1406
Query 1407 GGTATCATCTACTGAGAAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCCC 1480
|.||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1407 GATATCATCTACTGAGAAACTCAGCCACCCAACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGAAGACGGCCTCCATCCC 1480
Query 1481 AGTCCCTCACATCTTCATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGAA 1554
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1481 AGTCACTCACATCTTCTTCCCTTTCAAGCCCCGATATCTTTGACTCCCCAAGTCCCGAAGAAGATAAAGAGGAA 1554
Query 1555 CACATTTCACTTGCGCACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTC 1628
||||||||.|||||||||||||||.|.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CACATTTCGCTTGCGCACAGAGGAATAGACGTGTCAAAGAAGACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTC 1628
Query 1629 TGACAACAAAGCATCCCTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCCT 1702
|||.|||||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|...||.||||||||||..||||.||.|
Sbjct 1629 TGATAACAAGACATCCCTGCCACCCAAGCCAGGGACCATGGCAGCTGCCAGCAGTGGGCCAGCTTCTCTCTCTT 1702
Query 1703 CAGCGGTGCCCTCCCCCCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGGC 1776
|||.||...||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||||||||.||
Sbjct 1703 CAGTGGCATCCTCACCCATGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACAGAGAGCCAGTTCTCCATCTCTGTTCAGC 1776
Query 1777 ACGGAAGGAAAACCAAAGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCCG 1850
||.||||||||.||||||||||||||.||.|..|||||||||||.||..|.||||||||.|.||..||.|||||
Sbjct 1777 ACAGAAGGAAAGCCAAAGATGGAGCCAGCAGTGAGCAGCCAGGCTGCTATCGAGGAGCTTAAGATGCAAGTCCG 1850
Query 1851 CGAGCTGAGGAGCATCATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTGG 1924
.||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||||
Sbjct 1851 TGAGCTGAGGACCATCATTGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGTGAGATTAAGCAGTTACTGTCAGAATTGG 1924
Query 1925 ATGAAGAGAAGAAAATCCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA 1995
||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925 ATGAAGAGAAAAAGATCCGGCTCCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTTCAATCAAAG 1995