Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08160
Subject:
NM_001184960.2
Aligned Length:
665
Identities:
423
Gaps:
238

Alignment

Query   1  MVEAIVEFDYQAQHDDELTISVGEIITNIRKEDGGWWEGQINGRRGLFPDNFVREIKKEMKKDPLTNKAPEKPL  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  HEVPSGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFP  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  SNFIKELSGESDELGISQDEQLSKSSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGANGTVATAAIQPKKVKGVGFGDIFKDK  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  PIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPATTATPDSSKTEMDSRTKSKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTL  296
                           ..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------MGEETIGKKLPATTATPDSSKTEMDSRTKSKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTL  58

Query 297  INKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPE  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  59  INKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSAPVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPE  132

Query 371  MLPNRTEEKERPEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSLSRPGALPPRRPERPVGPLTHTRGDSPKIDLAGS  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133  MLPNRTEEKERPEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSLSRPGALPPRRPERPVGPLTHTRGDSPKIDLAGS  206

Query 445  SLSGILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEEDKEE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207  SLSGILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPSQSLTSSSLSSPDIFDSPSPEEDKEE  280

Query 519  HISLAHRGVDASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGTMAAGGGGPAPLSSAVPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFG  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 281  HISLAHRGVDASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGTMAAGGGGPAPLSSAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFG  354

Query 593  TEGKPKMEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK  665
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355  TEGKPKMEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSELDEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK  427