Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08160
Subject:
NM_001353894.1
Aligned Length:
690
Identities:
562
Gaps:
127

Alignment

Query   1  MVEAIVEFDYQAQHDDELTISVGEIITNIRKEDGGWWEGQINGRRGLFPDNFVREIKKEMKKDPLTNKAPEKPL  74
                                                                      |||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------------------------------------MKKDPLTNKAPEKPL  15

Query  75  HEVPSGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFP  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  16  HEVPSGNSLLSSETILRTNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFP  89

Query 149  SNFIKELSGESDELGISQDEQLSKS-------------------------SLRETTGSESDGGDSSSTKSEGAN  197
           |||||||||||||||||||||||||                         ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  90  SNFIKELSGESDELGISQDEQLSKSRKTTFEGTILYRAAPGKTEGHRRYYSLRETTGSESDGGDSSSTKSEGAN  163

Query 198  GTVATAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPATTATPDSSKTEMDSRTKSKDY  271
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164  GTVATAAIQPKKVKGVGFGDIFKDKPIKLRPRSIEVENDFLPVEKTIGKKLPATTATPDSSKTEMDSRTKSKDY  237

Query 272  CKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSA  345
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238  CKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKEGNRPKKPPPPSA  311

Query 346  PVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPEMLPNRTEEKERPEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSLSRPGALPP  419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312  PVIKQGAGTTERKHEIKKIPPERPEMLPNRTEEKERPEREPKLDLQKPSVPAIPPKKPRPPKTNSLSRPGALPP  385

Query 420  RRPERPVGPLTHTRGDSPKIDLAGSSLSGILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPS  493
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386  RRPERPVGPLTHTRGDSPKIDLAGSSLSGILDKDLSDRSNDIDLEGFDSVVSSTEKLSHPTTSRPKATGRRPPS  459

Query 494  QSLTSSSLSSPDIFDSPSPEEDKEEHISLAHRGVDASKKTSKTVTISQVSDNKASLPPKPGTMAAGGGGPAPLS  567
           |||||                                           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460  QSLTS-------------------------------------------VSDNKASLPPKPGTMAAGGGGPAPLS  490

Query 568  SAVPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKMEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSEL  641
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491  SAAPSPLSSSLGTAGHRANSPSLFGTEGKPKMEPAASSQAAVEELRTQVRELRSIIETMKDQQKREIKQLLSEL  564

Query 642  DEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK  665
           ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565  DEEKKIRLRLQMEVNDIKKALQSK  588