Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08160
- Subject:
- XM_006528924.3
- Aligned Length:
- 2127
- Identities:
- 1813
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct 1 ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGATTACCAGGCCCAGCATGATGATGAGCTGACAATCAGCGTGGGTGAGGT 74
Query 75 CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG 148
Query 149 ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG 222
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||.|.||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct 149 ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGATATGAAGAAAGATCTTCTCTCTAACAAAGCTCCAGAGAAACCCATG 222
Query 223 CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG 296
|||||.||..|||||||||||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct 223 CACGATGTATCCAGTGGAAACGCTCTGCTTTCTTCTGAAACCATTTTAAGAACCAATAAACGAGGAGAACGACG 296
Query 297 GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 297 GAGACGCCGATGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAGCTGGAGCTGAAAGTCGGGGACA 370
Query 371 TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT 444
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCATAGAGGTTGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTGCTCAATGGGAAGACTGGAATGTTTCCT 444
Query 445 TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATCTCCCAGGATGAGCAGCTTTCCAAGTC 518
Query 519 A------------------------------------------------------------------------- 519
|
Sbjct 519 AAGGCCTGAAGGTTTCCTTCCAGCTTCTCTGCTGCCCTTTCCAGCTCATGGAGCAAAAGGAAAGACTACCTTTG 592
Query 520 -----------------------------------------------------------AGTTTAAGGGAAACC 534
||.|||||.||||||
Sbjct 593 AAGGGACAATTCTGTACCGAGCCGCACCGGGAAAGACGGAGGGCCACAGACGCTATTACAGCTTAAGAGAAACC 666
Query 535 ACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAACGGGACAGTGGCAACTGC 608
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 667 ACAGGCTCCGAGAGTGATGGAGGCGACTCCAGCAGTACCAAGTCCGAAGGTGCCAACGGGACCATGGCAACTGC 740
Query 609 AGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAGCCAATCAAACTAAGAC 682
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 AGCCATCCAGCCCAAGAAAGTTAAAGGAGTGGGGTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAGCCAATTAAACTAAGAC 814
Query 683 CAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGAAGTTACCTGCAACTACA 756
|||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 815 CAAGGTCGATTGAAGTGGAAAATGACTTCCTGCCCGTCGAAAAGACAATTGGGAAGAAGTTACCTCCAGCTACA 888
Query 757 GCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTACTGCAAAGTAATATTTCC 830
.|||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAACTCCAGACCCATCGAAGACGGAGATGGACAGCAGGACAAAGACCAAGGATTACTGCAAAGTAATATTTCC 962
Query 831 ATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCTCATCAATAAGGACTGCA 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAGGAAGGAGATATAGTGACTCTCATCAATAAGGACTGCA 1036
Query 905 TCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATAACTTCGTGAAGTTACTT 978
|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAACTCAATGGCAGACGAGGCGTGTTTCCTGACAACTTCGTGAAGTTACTT 1110
Query 979 CCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCTCCTGTCATCAAACAAGG 1052
|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1111 CCATCGGACTTTGACAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAACCGCCACCTCCATCAGCTCCTGTCGTCAAACAAGG 1184
Query 1053 GGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGAAATGCTTCCAAACAGAA 1126
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1185 GGCAGGTACCACAGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAAATACCTCCTGAAAGACCAGAAACCCTTCCAAACAGAA 1258
Query 1127 CAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCGTTCCTGCCATACCGCCA 1200
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1259 CAGAAGAGAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCTTCAGTTCCTGCCATCCCACCA 1332
Query 1201 AAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCGAGAAGGCCGGAGAGACC 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|||.||||
Sbjct 1333 AAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTGAACAGACCTGGTGCATTGCCCCCAAGAAGACCTGAGCGACC 1406
Query 1275 GGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAGTTCGCTATCTGGCATCC 1348
.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.||||||||||
Sbjct 1407 AGTGGGCCCACTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCAGGCAGCGCACTCTCTGGCATCC 1480
Query 1349 TGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCGTGGTATCATCTACTGAG 1422
||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGATAAGGACCTCTCAGACCGCAGCAATGATATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCTGTGATATCATCTACTGAG 1554
Query 1423 AAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCCCAGTCCCTCACATCTTC 1496
||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 AAACTCAGCCACCCAACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGAAGACGGCCTCCATCCCAGTCACTCACATCTTC 1628
Query 1497 ATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGAACACATTTCACTTGCGC 1570
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629 TTCCCTTTCAAGCCCCGATATCTTTGACTCCCCAAGTCCCGAAGAAGATAAAGAGGAACACATTTCGCTTGCGC 1702
Query 1571 ACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTCTGACAACAAAGCATCC 1644
||||||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1703 ACAGAGGAATAGACGTGTCAAAGAAGACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTCTGATAACAAGACATCC 1776
Query 1645 CTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCCTCAGCGGTGCCCTCCCC 1718
|||||.||||||||.||||||||||||||.|...||.||||||||||..||||.||.||||.||...||||.||
Sbjct 1777 CTGCCACCCAAGCCAGGGACCATGGCAGCTGCCAGCAGTGGGCCAGCTTCTCTCTCTTCAGTGGCATCCTCACC 1850
Query 1719 CCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGGCACGGAAGGAAAACCAA 1792
|.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||||||||.||||.||||||||.||||
Sbjct 1851 CATGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACAGAGAGCCAGTTCTCCATCTCTGTTCAGCACAGAAGGAAAGCCAA 1924
Query 1793 AGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCCGCGAGCTGAGGAGCATC 1866
||||||||||.||.|..|||||||||||.||..|.||||||||.|.||..||.|||||.||||||||||.||||
Sbjct 1925 AGATGGAGCCAGCAGTGAGCAGCCAGGCTGCTATCGAGGAGCTTAAGATGCAAGTCCGTGAGCTGAGGACCATC 1998
Query 1867 ATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTGGATGAAGAGAAGAAAAT 1940
||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1999 ATTGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGTGAGATTAAGCAGTTACTGTCAGAATTGGATGAAGAGAAAAAGAT 2072
Query 1941 CCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA 1995
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2073 CCGGCTCCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTTCAATCAAAG 2127