Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08160
• Subject: XM_006528926.3
• Aligned Length: 2052
• Identities: 1813
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGATTACCAGGCCCAGCATGATGATGAGCTGACAATCAGCGTGGGTGAGGT  74

Query   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148

Query  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||.|.||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGATATGAAGAAAGATCTTCTCTCTAACAAAGCTCCAGAGAAACCCATG  222

Query  223  CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG  296
            |||||.||..|||||||||||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct  223  CACGATGTATCCAGTGGAAACGCTCTGCTTTCTTCTGAAACCATTTTAAGAACCAATAAACGAGGAGAACGACG  296

Query  297  GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  297  GAGACGCCGATGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAGCTGGAGCTGAAAGTCGGGGACA  370

Query  371  TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAGAGGTTGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTGCTCAATGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444

Query  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATCTCCCAGGATGAGCAGCTTTCCAAGTC  518

Query  519  AA---------------------------------------------------------GTTTAAGGGAAACCA  535
            ||                                                         |.|||||.|||||||
Sbjct  519  AAGGCCTGAAGGTTTCCTTCCAGCTTCTCTGCTGCCCTTTCCAGCTCATGGAGCAAAAGGCTTAAGAGAAACCA  592

Query  536  CAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAACGGGACAGTGGCAACTGCA  609
            |||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  593  CAGGCTCCGAGAGTGATGGAGGCGACTCCAGCAGTACCAAGTCCGAAGGTGCCAACGGGACCATGGCAACTGCA  666

Query  610  GCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAGCCAATCAAACTAAGACC  683
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GCCATCCAGCCCAAGAAAGTTAAAGGAGTGGGGTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAGCCAATTAAACTAAGACC  740

Query  684  AAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGAAGTTACCTGCAACTACAG  757
            ||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  741  AAGGTCGATTGAAGTGGAAAATGACTTCCTGCCCGTCGAAAAGACAATTGGGAAGAAGTTACCTCCAGCTACAT  814

Query  758  CAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTACTGCAAAGTAATATTTCCA  831
            |||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAACTCCAGACCCATCGAAGACGGAGATGGACAGCAGGACAAAGACCAAGGATTACTGCAAAGTAATATTTCCA  888

Query  832  TATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCTCATCAATAAGGACTGCAT  905
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAGGAAGGAGATATAGTGACTCTCATCAATAAGGACTGCAT  962

Query  906  CGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATAACTTCGTGAAGTTACTTC  979
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAACTCAATGGCAGACGAGGCGTGTTTCCTGACAACTTCGTGAAGTTACTTC  1036

Query  980  CACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCTCCTGTCATCAAACAAGGG  1053
            ||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1037  CATCGGACTTTGACAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAACCGCCACCTCCATCAGCTCCTGTCGTCAAACAAGGG  1110

Query 1054  GCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGAAATGCTTCCAAACAGAAC  1127
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGGTACCACAGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAAATACCTCCTGAAAGACCAGAAACCCTTCCAAACAGAAC  1184

Query 1128  AGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCGTTCCTGCCATACCGCCAA  1201
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  AGAAGAGAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCTTCAGTTCCTGCCATCCCACCAA  1258

Query 1202  AAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCGAGAAGGCCGGAGAGACCG  1275
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|||.||||.
Sbjct 1259  AAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTGAACAGACCTGGTGCATTGCCCCCAAGAAGACCTGAGCGACCA  1332

Query 1276  GTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAGTTCGCTATCTGGCATCCT  1349
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||||||||
Sbjct 1333  GTGGGCCCACTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCAGGCAGCGCACTCTCTGGCATCCT  1406

Query 1350  GGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCGTGGTATCATCTACTGAGA  1423
            |||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1407  GGATAAGGACCTCTCAGACCGCAGCAATGATATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCTGTGATATCATCTACTGAGA  1480

Query 1424  AACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCCCAGTCCCTCACATCTTCA  1497
            |||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1481  AACTCAGCCACCCAACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGAAGACGGCCTCCATCCCAGTCACTCACATCTTCT  1554

Query 1498  TCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGAACACATTTCACTTGCGCA  1571
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  TCCCTTTCAAGCCCCGATATCTTTGACTCCCCAAGTCCCGAAGAAGATAAAGAGGAACACATTTCGCTTGCGCA  1628

Query 1572  CAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTCTGACAACAAAGCATCCC  1645
            |||||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||
Sbjct 1629  CAGAGGAATAGACGTGTCAAAGAAGACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTCTGATAACAAGACATCCC  1702

Query 1646  TGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCCTCAGCGGTGCCCTCCCCC  1719
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|...||.||||||||||..||||.||.||||.||...||||.|||
Sbjct 1703  TGCCACCCAAGCCAGGGACCATGGCAGCTGCCAGCAGTGGGCCAGCTTCTCTCTCTTCAGTGGCATCCTCACCC  1776

Query 1720  CTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGGCACGGAAGGAAAACCAAA  1793
            .||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||||||||.||||.||||||||.|||||
Sbjct 1777  ATGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACAGAGAGCCAGTTCTCCATCTCTGTTCAGCACAGAAGGAAAGCCAAA  1850

Query 1794  GATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCCGCGAGCTGAGGAGCATCA  1867
            |||||||||.||.|..|||||||||||.||..|.||||||||.|.||..||.|||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1851  GATGGAGCCAGCAGTGAGCAGCCAGGCTGCTATCGAGGAGCTTAAGATGCAAGTCCGTGAGCTGAGGACCATCA  1924

Query 1868  TCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTGGATGAAGAGAAGAAAATC  1941
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1925  TTGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGTGAGATTAAGCAGTTACTGTCAGAATTGGATGAAGAGAAAAAGATC  1998

Query 1942  CGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA  1995
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1999  CGGCTCCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTTCAATCAAAG  2052