Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08160
• Subject: XM_006528929.3
• Aligned Length: 1995
• Identities: 1642
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG  222
                                         |||||||||||.|.||||.|.||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct    1  -----------------------------ATGAAGAAAGATCTTCTCTCTAACAAAGCTCCAGAGAAACCCATG  45

Query  223  CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG  296
            |||||.||..|||||||||||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct   46  CACGATGTATCCAGTGGAAACGCTCTGCTTTCTTCTGAAACCATTTTAAGAACCAATAAACGAGGAGAACGACG  119

Query  297  GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  120  GAGACGCCGATGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAGCTGGAGCTGAAAGTCGGGGACA  193

Query  371  TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  194  TCATAGAGGTTGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTGCTCAATGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  267

Query  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  268  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATCTCCCAGGATGAGCAGCTTTCCAAGTC  341

Query  519  AAGTTTAAGGGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAACG  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  342  AAGCTTAAGAGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGAGGCGACTCCAGCAGTACCAAGTCCGAAGGTGCCAACG  415

Query  593  GGACAGTGGCAACTGCAGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAG  666
            ||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  GGACCATGGCAACTGCAGCCATCCAGCCCAAGAAAGTTAAAGGAGTGGGGTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAG  489

Query  667  CCAATCAAACTAAGACCAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGAA  740
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  490  CCAATTAAACTAAGACCAAGGTCGATTGAAGTGGAAAATGACTTCCTGCCCGTCGAAAAGACAATTGGGAAGAA  563

Query  741  GTTACCTGCAACTACAGCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTACT  814
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  564  GTTACCTCCAGCTACATCAACTCCAGACCCATCGAAGACGGAGATGGACAGCAGGACAAAGACCAAGGATTACT  637

Query  815  GCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  638  GCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAGGAAGGAGATATAGTGACTCTC  711

Query  889  ATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATAA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  712  ATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAACTCAATGGCAGACGAGGCGTGTTTCCTGACAA  785

Query  963  CTTCGTGAAGTTACTTCCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCTC  1036
            |||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  786  CTTCGTGAAGTTACTTCCATCGGACTTTGACAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAACCGCCACCTCCATCAGCTC  859

Query 1037  CTGTCATCAAACAAGGGGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGAA  1110
            |||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  860  CTGTCGTCAAACAAGGGGCAGGTACCACAGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAAATACCTCCTGAAAGACCAGAA  933

Query 1111  ATGCTTCCAAACAGAACAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCGT  1184
            |..||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  934  ACCCTTCCAAACAGAACAGAAGAGAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCTTCAGT  1007

Query 1185  TCCTGCCATACCGCCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCGA  1258
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct 1008  TCCTGCCATCCCACCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTGAACAGACCTGGTGCATTGCCCCCAA  1081

Query 1259  GAAGGCCGGAGAGACCGGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAGT  1332
            ||||.||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1082  GAAGACCTGAGCGACCAGTGGGCCCACTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCAGGCAGC  1155

Query 1333  TCGCTATCTGGCATCCTGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCGT  1406
            .|.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1156  GCACTCTCTGGCATCCTGGATAAGGACCTCTCAGACCGCAGCAATGATATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCTGT  1229

Query 1407  GGTATCATCTACTGAGAAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCCC  1480
            |.||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1230  GATATCATCTACTGAGAAACTCAGCCACCCAACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGAAGACGGCCTCCATCCC  1303

Query 1481  AGTCCCTCACATCTTCATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGAA  1554
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1304  AGTCACTCACATCTTCTTCCCTTTCAAGCCCCGATATCTTTGACTCCCCAAGTCCCGAAGAAGATAAAGAGGAA  1377

Query 1555  CACATTTCACTTGCGCACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTC  1628
            ||||||||.|||||||||||||||.|.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378  CACATTTCGCTTGCGCACAGAGGAATAGACGTGTCAAAGAAGACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTC  1451

Query 1629  TGACAACAAAGCATCCCTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCCT  1702
            |||.|||||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|...||.||||||||||..||||.||.|
Sbjct 1452  TGATAACAAGACATCCCTGCCACCCAAGCCAGGGACCATGGCAGCTGCCAGCAGTGGGCCAGCTTCTCTCTCTT  1525

Query 1703  CAGCGGTGCCCTCCCCCCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGGC  1776
            |||.||...||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||||||||.||
Sbjct 1526  CAGTGGCATCCTCACCCATGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACAGAGAGCCAGTTCTCCATCTCTGTTCAGC  1599

Query 1777  ACGGAAGGAAAACCAAAGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCCG  1850
            ||.||||||||.||||||||||||||.||.|..|||||||||||.||..|.||||||||.|.||..||.|||||
Sbjct 1600  ACAGAAGGAAAGCCAAAGATGGAGCCAGCAGTGAGCAGCCAGGCTGCTATCGAGGAGCTTAAGATGCAAGTCCG  1673

Query 1851  CGAGCTGAGGAGCATCATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTGG  1924
            .||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||||
Sbjct 1674  TGAGCTGAGGACCATCATTGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGTGAGATTAAGCAGTTACTGTCAGAATTGG  1747

Query 1925  ATGAAGAGAAGAAAATCCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA  1995
            ||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1748  ATGAAGAGAAAAAGATCCGGCTCCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTTCAATCAAAG  1818