Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08160
• Subject: XM_011247849.2
• Aligned Length: 2127
• Identities: 1813
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGATTACCAGGCCCAGCATGATGATGAGCTGACAATCAGCGTGGGTGAGGT  74

Query   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148

Query  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||.|.||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGATATGAAGAAAGATCTTCTCTCTAACAAAGCTCCAGAGAAACCCATG  222

Query  223  CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG  296
            |||||.||..|||||||||||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct  223  CACGATGTATCCAGTGGAAACGCTCTGCTTTCTTCTGAAACCATTTTAAGAACCAATAAACGAGGAGAACGACG  296

Query  297  GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  297  GAGACGCCGATGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAGCTGGAGCTGAAAGTCGGGGACA  370

Query  371  TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAGAGGTTGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTGCTCAATGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444

Query  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATCTCCCAGGATGAGCAGCTTTCCAAGTC  518

Query  519  A-------------------------------------------------------------------------  519
            |                                                                         
Sbjct  519  AAGGCCTGAAGGTTTCCTTCCAGCTTCTCTGCTGCCCTTTCCAGCTCATGGAGCAAAAGGAAAGACTACCTTTG  592

Query  520  -----------------------------------------------------------AGTTTAAGGGAAACC  534
                                                                       ||.|||||.||||||
Sbjct  593  AAGGGACAATTCTGTACCGAGCCGCACCGGGAAAGACGGAGGGCCACAGACGCTATTACAGCTTAAGAGAAACC  666

Query  535  ACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAACGGGACAGTGGCAACTGC  608
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct  667  ACAGGCTCCGAGAGTGATGGAGGCGACTCCAGCAGTACCAAGTCCGAAGGTGCCAACGGGACCATGGCAACTGC  740

Query  609  AGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAGCCAATCAAACTAAGAC  682
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  AGCCATCCAGCCCAAGAAAGTTAAAGGAGTGGGGTTTGGAGACATTTTCAAAGACAAGCCAATTAAACTAAGAC  814

Query  683  CAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGAAGTTACCTGCAACTACA  756
            |||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  815  CAAGGTCGATTGAAGTGGAAAATGACTTCCTGCCCGTCGAAAAGACAATTGGGAAGAAGTTACCTCCAGCTACA  888

Query  757  GCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTACTGCAAAGTAATATTTCC  830
            .|||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAACTCCAGACCCATCGAAGACGGAGATGGACAGCAGGACAAAGACCAAGGATTACTGCAAAGTAATATTTCC  962

Query  831  ATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCTCATCAATAAGGACTGCA  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAGGAAGGAGATATAGTGACTCTCATCAATAAGGACTGCA  1036

Query  905  TCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATAACTTCGTGAAGTTACTT  978
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAACTCAATGGCAGACGAGGCGTGTTTCCTGACAACTTCGTGAAGTTACTT  1110

Query  979  CCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCTCCTGTCATCAAACAAGG  1052
            |||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1111  CCATCGGACTTTGACAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAACCGCCACCTCCATCAGCTCCTGTCGTCAAACAAGG  1184

Query 1053  GGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGAAATGCTTCCAAACAGAA  1126
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1185  GGCAGGTACCACAGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAAATACCTCCTGAAAGACCAGAAACCCTTCCAAACAGAA  1258

Query 1127  CAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCGTTCCTGCCATACCGCCA  1200
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1259  CAGAAGAGAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCTTCAGTTCCTGCCATCCCACCA  1332

Query 1201  AAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCGAGAAGGCCGGAGAGACC  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||.|||||.||.|||.||||
Sbjct 1333  AAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTGAACAGACCTGGTGCATTGCCCCCAAGAAGACCTGAGCGACC  1406

Query 1275  GGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAGTTCGCTATCTGGCATCC  1348
            .|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.||||||||||
Sbjct 1407  AGTGGGCCCACTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCAGGCAGCGCACTCTCTGGCATCC  1480

Query 1349  TGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCGTGGTATCATCTACTGAG  1422
            ||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGATAAGGACCTCTCAGACCGCAGCAATGATATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCTGTGATATCATCTACTGAG  1554

Query 1423  AAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCCCAGTCCCTCACATCTTC  1496
            ||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  AAACTCAGCCACCCAACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGAAGACGGCCTCCATCCCAGTCACTCACATCTTC  1628

Query 1497  ATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGAACACATTTCACTTGCGC  1570
            .||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  TTCCCTTTCAAGCCCCGATATCTTTGACTCCCCAAGTCCCGAAGAAGATAAAGAGGAACACATTTCGCTTGCGC  1702

Query 1571  ACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTCTGACAACAAAGCATCC  1644
            ||||||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1703  ACAGAGGAATAGACGTGTCAAAGAAGACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGTCTGATAACAAGACATCC  1776

Query 1645  CTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCCTCAGCGGTGCCCTCCCC  1718
            |||||.||||||||.||||||||||||||.|...||.||||||||||..||||.||.||||.||...||||.||
Sbjct 1777  CTGCCACCCAAGCCAGGGACCATGGCAGCTGCCAGCAGTGGGCCAGCTTCTCTCTCTTCAGTGGCATCCTCACC  1850

Query 1719  CCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGGCACGGAAGGAAAACCAA  1792
            |.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||||||||.||||.||||||||.||||
Sbjct 1851  CATGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACAGAGAGCCAGTTCTCCATCTCTGTTCAGCACAGAAGGAAAGCCAA  1924

Query 1793  AGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCCGCGAGCTGAGGAGCATC  1866
            ||||||||||.||.|..|||||||||||.||..|.||||||||.|.||..||.|||||.||||||||||.||||
Sbjct 1925  AGATGGAGCCAGCAGTGAGCAGCCAGGCTGCTATCGAGGAGCTTAAGATGCAAGTCCGTGAGCTGAGGACCATC  1998

Query 1867  ATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTGGATGAAGAGAAGAAAAT  1940
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1999  ATTGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGTGAGATTAAGCAGTTACTGTCAGAATTGGATGAAGAGAAAAAGAT  2072

Query 1941  CCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA  1995
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2073  CCGGCTCCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTTCAATCAAAG  2127