Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08160
• Subject: XM_017318584.1
• Aligned Length: 2070
• Identities: 1694
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGATTACCAGGCCCAGCATGATGATGAGCTGACAATCAGCGTGGGTGAGGT  74

Query   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG  148

Query  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||.|.||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct  149  ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGATATGAAGAAAGATCTTCTCTCTAACAAAGCTCCAGAGAAACCCATG  222

Query  223  CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG  296
            |||||.||..|||||||||||.||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct  223  CACGATGTATCCAGTGGAAACGCTCTGCTTTCTTCTGAAACCATTTTAAGAACCAATAAACGAGGAGAACGACG  296

Query  297  GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  297  GAGACGCCGATGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAGCTGGAGCTGAAAGTCGGGGACA  370

Query  371  TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAGAGGTTGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTGCTCAATGGGAAGACTGGAATGTTTCCT  444

Query  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATCTCCCAGGATGAGCAGCTTTCCAAGTC  518

Query  519  A-------------------------------------------------------------------------  519
            |                                                                         
Sbjct  519  AAGAAAGACTACCTTTGAAGGGACAATTCTGTACCGAGCCGCACCGGGAAAGACGGAGGGCCACAGACGCTATT  592

Query  520  --AGTTTAAGGGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAAC  591
              ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCTTAAGAGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGAGGCGACTCCAGCAGTACCAAGTCCGAAGGTGCCAAC  666

Query  592  GGGACAGTGGCAACTGCAGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAA  665
            |||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGACCATGGCAACTGCAGCCATCCAGCCCAAGAAAGTTAAAGGAGTGGGGTTTGGAGACATTTTCAAAGACAA  740

Query  666  GCCAATCAAACTAAGACCAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGA  739
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GCCAATTAAACTAAGACCAAGGTCGATTGAAGTGGAAAATGACTTCCTGCCCGTCGAAAAGACAATTGGGAAGA  814

Query  740  AGTTACCTGCAACTACAGCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTAC  813
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  815  AGTTACCTCCAGCTACATCAACTCCAGACCCATCGAAGACGGAGATGGACAGCAGGACAAAGACCAAGGATTAC  888

Query  814  TGCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCT  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  TGCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAGGAAGGAGATATAGTGACTCT  962

Query  888  CATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAACTCAATGGCAGACGAGGCGTGTTTCCTGACA  1036

Query  962  ACTTCGTGAAGTTACTTCCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCT  1035
            ||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1037  ACTTCGTGAAGTTACTTCCATCGGACTTTGACAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAACCGCCACCTCCATCAGCT  1110

Query 1036  CCTGTCATCAAACAAGGGGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGA  1109
            ||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGTCGTCAAACAAGGGGCAGGTACCACAGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAAATACCTCCTGAAAGACCAGA  1184

Query 1110  AATGCTTCCAAACAGAACAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCG  1183
            ||..||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185  AACCCTTCCAAACAGAACAGAAGAGAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCTTCAG  1258

Query 1184  TTCCTGCCATACCGCCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCG  1257
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||.
Sbjct 1259  TTCCTGCCATCCCACCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTGAACAGACCTGGTGCATTGCCCCCA  1332

Query 1258  AGAAGGCCGGAGAGACCGGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAG  1331
            |||||.||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1333  AGAAGACCTGAGCGACCAGTGGGCCCACTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCAGGCAG  1406

Query 1332  TTCGCTATCTGGCATCCTGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCG  1405
            ..|.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CGCACTCTCTGGCATCCTGGATAAGGACCTCTCAGACCGCAGCAATGATATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCTG  1480

Query 1406  TGGTATCATCTACTGAGAAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCC  1479
            ||.||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1481  TGATATCATCTACTGAGAAACTCAGCCACCCAACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGAAGACGGCCTCCATCC  1554

Query 1480  CAGTCCCTCACATCTTCATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGA  1553
            |||||.|||||||||                                                           
Sbjct 1555  CAGTCACTCACATCT-----------------------------------------------------------  1569

Query 1554  ACACATTTCACTTGCGCACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGT  1627
                                                                                  ||||
Sbjct 1570  ----------------------------------------------------------------------GTGT  1573

Query 1628  CTGACAACAAAGCATCCCTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCC  1701
            ||||.|||||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|...||.||||||||||..||||.||.
Sbjct 1574  CTGATAACAAGACATCCCTGCCACCCAAGCCAGGGACCATGGCAGCTGCCAGCAGTGGGCCAGCTTCTCTCTCT  1647

Query 1702  TCAGCGGTGCCCTCCCCCCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGG  1775
            ||||.||...||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.||.|||||||||.|
Sbjct 1648  TCAGTGGCATCCTCACCCATGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACAGAGAGCCAGTTCTCCATCTCTGTTCAG  1721

Query 1776  CACGGAAGGAAAACCAAAGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCC  1849
            |||.||||||||.||||||||||||||.||.|..|||||||||||.||..|.||||||||.|.||..||.||||
Sbjct 1722  CACAGAAGGAAAGCCAAAGATGGAGCCAGCAGTGAGCAGCCAGGCTGCTATCGAGGAGCTTAAGATGCAAGTCC  1795

Query 1850  GCGAGCTGAGGAGCATCATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTG  1923
            |.||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||.|||
Sbjct 1796  GTGAGCTGAGGACCATCATTGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGTGAGATTAAGCAGTTACTGTCAGAATTG  1869

Query 1924  GATGAAGAGAAGAAAATCCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA  1995
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1870  GATGAAGAGAAAAAGATCCGGCTCCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTTCAATCAAAG  1941