Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08182
Subject:
XM_006506157.1
Aligned Length:
891
Identities:
736
Gaps:
78

Alignment

Query   1  ------------------------------------------------ATGAGTGCGGACGTGAAGGTGACAGG  26
                                                           |||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGCTCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACCTCGGCGCAGCCATGAGTGCGGAGGTGAAGGTGACAGG  74

Query  27  GCAGAACCAGGAGCAATTTCTGCTCCTAGCCAAGTCGGCCAAGGGGGCAGCGCTGGCCACACTCATCCATCAGG  100
           |||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  75  GCAGAACCAAGAGCAGTTTCTGCTCCTTGCCAAGTCGGCTAAGGGGGCGGCACTGGCCACACTCATCCACCAGG  148

Query 101  TGCTGGAGGCCCCTGGTGTCTACGTGTTTGGAGAACTGCTGGACATGCCCAATGTTAGAGAGCTGGCTGAGAGT  174
           |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 149  TGCTGGAGGCCCCTGGTGTCTACGTGTTTGGGGAACTGCTGGATATGCCTAATGTTAGAGAGCTGGCAGAAAGC  222

Query 175  GACTTTGCCTCTACCTTCCGGCTGCTCACAGTGTTTGCTTATGGGACATACGCTGACTACTTAGCTGAAGCCCG  248
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||.|
Sbjct 223  GACTTTGCCTCCACCTTCCGGCTGCTCACAGTGTTTGCCTATGGGACCTATGCGGACTACTTAGCTGAAGCCAG  296

Query 249  GAATCTTCCTCCACTAACAGAGGCTCAGAAGAATAAGCTTCGACACCTCTCAGTTGTCACCCTGGCTGCTAAAG  322
           ||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297  GAATCTCCCCCCACTGACTGACGCACAGAAGAATAAGCTTCGACATCTGTCAGTTGTCACTCTGGCTGCCAAAG  370

Query 323  TAAAGTGTATCCCATATGCAGTGTTGCTGGAGGCTCTTGCCCTGCGTAATGTGCGGCAGCTGGAAGACCTTGTG  396
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 371  TCAAGTGTATCCCATATGCAGTGTTGCTGGAGGCCCTTGCCCTTCGAAACGTGCGCCAGCTGGAAGACCTTGTG  444

Query 397  ATTGAGGCTGTGTATGCTGACGTGCTTCGTGGCTCCCTGGACCAGCGCAACCAGCGGCTCGAGGTTGACTACAG  470
           ||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 445  ATCGAGGCTGTGTATGCTGATGTCCTTCGTGGCTCTCTGGACCAGCGCAATCAGCGGCTAGAGGTTGATTACAG  518

Query 471  CATCGGGCGGGACATCCAGCGCCAGGACCTCAGTGCCATTGCCCGAACCCTGCAGGAATGGTGTGTGGGCTGTG  544
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 519  CATCGGGCGGGACATCCAGCGCCAGGACCTCAGTGCCATCGCCCAGACCCTGCAAGAGTGGTGCGTGGGCTGTG  592

Query 545  AGGTCGTGCTGTCAGGCATTGAGGAGCAGGTGAGCCGTGCCAACCAACACAAGGAGCAGCAGCTGGGCCTGAAG  618
           ||||.|||.||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGGTTGTGTTGTCGGGCATCGAAGAGCAGGTCAGCCGTGCCAACCAGCACAAGGAGCAGCAGCTGGGCCTGAAG  666

Query 619  CAGCAGATTGAGAGTGAGGTTGCCAACCTTAAAAAAACCATTAAAGTTACGACGGCAGCAGCAGCCGCAGCCAC  692
           ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 667  CAGCAGATCGAAAGTGAGGTTGCCAACCTTAAGAAAACCATTAAAGTTACGACAGCAGCTGCTGCTGCAGCCAC  740

Query 693  ATCTCAGGACCCTGAGCAACACCTGACTGAGCTGAGGGAACCAGCTCCTGGCACCAACCAGCGCCAGCCCAGCA  766
           .||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  CTCCCAGGATCCTGAGCAACACCTGACAGAGCTGAGAGAACCAGCTTCTGGCACCAACCAGCGCCAGCCCAGCA  814

Query 767  AGAAAGCCTCAAAGGGCAAGGGGCTCCGAGGGAGCGCCAAGATTTGGTCCAAGTCGAAT---------------  825
           ||||||||||.||||||||||||    |||        ||||||....||.||||.|.|               
Sbjct 815  AGAAAGCCTCCAAGGGCAAGGGG----GAG--------AAGATTAATCCCCAGTCCACTGTAAAGCCAAGTGCC  876

Query 826  ---  825
              
Sbjct 877  AAG  879