Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08191
• Subject: NM_001352001.2
• Aligned Length: 1122
• Identities: 908
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGC----------CTCGTGGTCGTGTCTCTCA------  58
                      .||...|||  .|||.|||  ..||.|||          |||.|||.| ..||| |||      
Sbjct    1  ----------ATGAAAACC--ATCCAGCC--AAAAATGCACAATTCTATCTCTTGGGC-AATCT-TCACGGGGC  58

Query   59  -GGCTGC----TGTTCCTTGTACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGG  127
             ||||||    |||..|||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  TGGCTGCTCTGTGTCTCTT----CCA-AGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGG  127

Query  128  ACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  ACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCC  201

Query  202  TGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAG  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  TGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAG  275

Query  276  CAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGG  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  CAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGG  349

Query  350  TGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATT  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  TGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATT  423

Query  424  TCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTAC  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  TCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTAC  497

Query  498  GGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  GGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCA  571

Query  572  TCACCCGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTA  645
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  TCACCAGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTA  645

Query  646  AAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGAC  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  AAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGAC  719

Query  720  ACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  ACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAG  793

Query  794  GAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGAC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  GAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGAC  867

Query  868  TATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG------G  935
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      .
Sbjct  868  TATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGAACTAAA  941

Query  936  TGAGACT--GTGCTC-----------------------------------------------------------  948
            ||||.||  |.||||                                                           
Sbjct  942  TGAGCCTACGAGCTCAACTTTGTTGCAAGAAGTGAAAACTACAGCCCTGACCCCTTGGAAAGGTCCAGGCGCCG  1015

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct 1016  TCAGCGAGGTGAGCAACGGCACGTCGAGGAGGGCAGGCTGCGTCTGGCTGCTGCCTCTTCTGGTCTTGCACCTG  1089

Query  949  ------------  948
                        
Sbjct 1090  CTTCTCAAATTT  1101