Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08191
- Subject:
- NM_001352005.2
- Aligned Length:
- 1086
- Identities:
- 907
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGC----------CTCGTGGTCGTGTCTCTCA------ 58
.||...||| .|||.||| ..||.||| |||.|||.| ..||| |||
Sbjct 1 ----------ATGAAAACC--ATCCAGCC--AAAAATGCACAATTCTATCTCTTGGGC-AATCT-TCACGGGGC 58
Query 59 -GGCTGC----TGTTCCTTGTACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGG 127
|||||| |||..||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 TGGCTGCTCTGTGTCTCTT----CCA-AGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGG 127
Query 128 ACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCC 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 ACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCC 201
Query 202 TGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAG 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 TGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAG 275
Query 276 CAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGG 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 CAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGG 349
Query 350 TGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATT 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 TGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATT 423
Query 424 TCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTAC 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 TCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTAC 497
Query 498 GGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 GGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCA 571
Query 572 TCACCCGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTA 645
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 TCACCAGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTA 645
Query 646 AAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGAC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 AAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGAC 719
Query 720 ACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAG 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 ACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAG 793
Query 794 GAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGAC 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 GAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGAC 867
Query 868 TATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG--GTGAG 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.
Sbjct 868 TATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGAAGTGAA 941
Query 940 A---------CTGTGCTC-------------------------------------------------------- 948
| |||..|.|
Sbjct 942 AACTACAGCCCTGACCCCTTGGAAAGGTCCAGGCGCCGTCAGCGAGGTGAGCAACGGCACGTCGAGGAGGGCAG 1015
Query 949 -------------------------------------------------- 948
Sbjct 1016 GCTGCGTCTGGCTGCTGCCTCTTCTGGTCTTGCACCTGCTTCTCAAATTT 1065