Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08191
• Subject: NM_001352008.1
• Aligned Length: 1048
• Identities: 869
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTGTTCCTTGT  74
                                                                                  .||.
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------ATGA  4

Query   75  A-CCCA------------CAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTG  135
            | ||||            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    5  AGCCCACCCCGTCCCCTTCTGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTG  78

Query  136  ACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAA  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  ACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAA  152

Query  210  CCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCC  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  CCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCC  226

Query  284  AAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACA  357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  AAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACA  300

Query  358  GACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGA  431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGA  374

Query  432  TATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTT  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTT  448

Query  506  GGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCCGG  579
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  449  GGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCAGG  522

Query  580  GAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCAC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCAC  596

Query  654  CGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGT  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGT  670

Query  728  GTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAA  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAA  744

Query  802  GGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAA  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  GGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAA  818

Query  876  CTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGGT-------------  936
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  819  CTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGGTCCAGGCGCCGTCA  892

Query  937  --GAGACTGTGCTC------------------------------------------------------------  948
              |||   |||..|                                                            
Sbjct  893  GCGAG---GTGAGCAACGGCACGTCGAGGAGGGCAGGCTGCGTCTGGCTGCTGCCTCTTCTGGTCTTGCACCTG  963

Query  949  ------------  948
                        
Sbjct  964  CTTCTCAAATTT  975