Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08191
- Subject:
- XM_006510209.3
- Aligned Length:
- 1107
- Identities:
- 788
- Gaps:
- 237
Alignment
Query 1 ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTGTTCCTTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCCA------CAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCC 142
| ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ----ATGAAATCAGGAGTGCCGGTGCGTAGCGGAGATGCCACCTTTCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCA 70
Query 143 GGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGC 216
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 71 GGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACAATTGACAACCGAGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGT 144
Query 217 ACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCCAAACGCA 290
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 145 ACCATCCTCTATGCTGGAAATGACAAGTGGTGCCTAGATCCTCGTGTGGTCCTCCTGAGTAACACCCAGACCCA 218
Query 291 GTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACAGACAACC 364
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 219 GTACAGCATTGAGATCCAGAATGTGGATGTGTACGATGAGGGCCCTTATACCTGCTCGGTACAGACAGACAACC 292
Query 365 ACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCC 438
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 ACCCTAAGACCTCCAGGGTCCACCTCATTGTACAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCC 366
Query 439 ATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTTGGAGACA 512
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 367 ATTAATGAAGGGAACAACATCAGCCTCACTTGCATAGCCACAGGTAGACCGGAGCCTACAGTAACCTGGAGACA 440
Query 513 CATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCCGGGAGCAGT 586
.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 441 TATTTCTCCCAAGGCCGTTGGCTTTGTGAGTGAGGATGAGTACCTGGAGATCCAGGGCATCACTCGGGAACAGT 514
Query 587 CAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCACCGTGAAC 660
||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 515 CAGGCGAGTACGAGTGCAGCGCCTCCAACGACGTGGCGGCACCAGTGGTACGAAGAGTGAAGGTCACCGTGAAC 588
Query 661 TATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGTGTGAAGC 734
||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 589 TATCCACCATACATCTCAGAAGCTAAGGGCACAGGTGTCCCCGTGGGGCAGAAGGGGACTCTGCAGTGTGAAGC 662
Query 735 CTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAAGGGGTGA 808
.||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 663 TTCCGCAGTCCCTTCAGCAGAATTTCAATGGTTCAAGGATGACAAAAGACTGGTCGAAGGAAAGAAGGGAGTCA 736
Query 809 AAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACT 882
||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 737 AAGTGGAAAACAGACCTTTCCTTTCAAAACTCACCTTTTTCAACGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACA 810
Query 883 TGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG------GTGAGACT--GTGCTC 948
||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||| .||||.|| ..||||
Sbjct 811 TGTGTGGCCTCCAACAAGCTGGGTCACACCAACGCCAGCATCATGCTATTTGAACTAAATGAGCCTACAAGCTC 884
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 885 AACTTTGTTGCAAGAAGTGAAAACTACAGCCCTGACCCCTTGGAAAGGTCCCGGTGCTGTCAGTGAGGTCAACA 958
Query 949 ----------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 959 ATGGGACATCAAGGAGGGCAGGCTGCATTTGGCTCCTCCCTCTTCTGGTCTTACACCTGCTCCTCAAATTT 1029