Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08210
• Subject: NM_001371918.1
• Aligned Length: 891
• Identities: 603
• Gaps: 288

Alignment

Query   1  ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGGACCGCATCTGAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAAGTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATG  148
                                                                                  |||
Sbjct   1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query 149  CAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGCTGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   4  CAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGCTGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATT  77

Query 223  TTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  78  TTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACC  151

Query 297  TCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152  TCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTC  225

Query 371  TGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 226  TGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAA--------  291

Query 445  GATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGGTTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTT  518
                                                                                     
Sbjct 292  --------------------------------------------------------------------------  291

Query 519  CAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAATCTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCC  592
                                                                        |||||||||||||
Sbjct 292  -------------------------------------------------------------GGTCAAAGGTTCC  304

Query 593  GTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305  GTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGT  378

Query 667  ATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379  ATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACA  452

Query 741  TCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453  TCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGA  526

Query 815  ATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527  ATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTC  600

Query 889  CAC  891
           |||
Sbjct 601  CAC  603