Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08215
• Subject: NM_015978.3
• Aligned Length: 950
• Identities: 702
• Gaps: 222

Alignment

Query   1  MAAARDPPEVSLREATQRKLRRFSELRGKLVARGEFWDIVAITAADEKQELAYNQQLSEKLKRKELPLGVQYHV  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  FVDPAGAKIGNGGS---TLCALQCLEKLYGDKWNSFTILLIHSDEWKKKVSESYVITIERLEDDLQIKEKELTE  145
                   .||..|   ..|                      .|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --------MGNYKSRPTQTC----------------------TDEWKKKVSESYVITIERLEDDLQIKEKELTE  44

Query 146  LRNIFGSDEAFSKVNLNYRTENGLSLLHLCCICGGKKSHIRTLMLKGLRPSRLTRNGFTALHLAVYKDNAELIT  219
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  45  LRNIFGSDEAFSKVNLNYRTENGLSLLHLCCICGGKKSHIRTLMLKGLRPSRLTRNGFTALHLAVYKDNAELIT  118

Query 220  SLLHSGADVQQVGYGGLTALHIATIAGHLEAADVLLQHGANVNIQDAVFFTPLHIAAYYGHEQVTRLLLKFGAD  293
           ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119  SLLHSGADIQQVGYGGLTALHIATIAGHLEAADVLLQHGANVNIQDAVFFTPLHIAAYYGHEQVTRLLLKFGAD  192

Query 294  VNVSGEVGDRPLHLASAKGFLNIAKLLMEEGSKADVNAQDNEDHVPLHFCSRFGHHDIVKYLLQSDLEVQPHVV  367
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193  VNVSGEVGDRPLHLASAKGFLNIAKLLMEEGSKADVNAQDNEDHVPLHFCSRFGHHDIVKYLLQSDLEVQPHVV  266

Query 368  NIYGDTPLHLACYNGKFEVAKEIIQISGTESLTKENIFSETAFHSACTYGKSIDLVKFLLDQNVININHQGRDG  441
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267  NIYGDTPLHLACYNGKFEVAKEIIQISGTESLTKENIFSETAFHSACTYGKSIDLVKFLLDQNVININHQGRDG  340

Query 442  HTGLHSACYHGHIRLVQFLLDNGADMNLVACDPSRSSGEKDEQTCLMWAYEKGHDAIVTLLKHYKRPQGELPCN  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 341  HTGLHSACYHGHIRLVQFLLDNGADMNLVACDPSRSSGEKDEQTCLMWAYEKGHDAIVTLLKHYKRPQDELPCN  414

Query 516  EYSQPGGDGSYVSVPSPLGKIKSMTKEKADILLLRAGLPSHFHLQLSEIEFHEIIGSGSFGKVYKGRCRNKIVA  589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415  EYSQPGGDGSYVSVPSPLGKIKSMTKEKADILLLRAGLPSHFHLQLSEIEFHEIIGSGSFGKVYKGRCRNKIVA  488

Query 590  IKRYRANTYCSKSDVDMFCREVSILCQLNHPCVIQFVGACLNDPSQFAIVTQYISGGSLFSLLHEQKRILDLQS  663
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489  IKRYRANTYCSKSDVDMFCREVSILCQLNHPCVIQFVGACLNDPSQFAIVTQYISGGSLFSLLHEQKRILDLQS  562

Query 664  KLIIAVDVAKGMEYLHNLTQPIIHRDLNSHNILLYEDGHAVVADFGESRFLQSLDEDNMTKQPGNLLWMAPEVF  737
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 563  KLIIAVDVAKGMEYLHNLTQPIIHRDLNSHNILLYEDGHAVVADFGESRFLQSLDEDNMTKQPGNLRWMAPEVF  636

Query 738  TQCTRYTIKADVFSYALCLWEILTGEIPFAHLKPAAAAADMAYHHIRPPIGYSIPKPISSLLIRGWNACPEAKS  811
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .
Sbjct 637  TQCTRYTIKADVFSYALCLWEILTGEIPFAHLKPAAAAADMAYHHIRPPIGYSIPKPISSLLIRGWNACPE--G  708

Query 812  RPSHYPVSSVYTETLKKKNEDRFGMWIEYLRR------------------------------------------  843
           ||.       ..|...|..|....  ||....                                          
Sbjct 709  RPE-------FSEVVMKLEECLCN--IELMSPASSNSSGSLSPSSSSDCLVNRGGPGRSHVAALRSRFELEYAL  773

Query 844  --------------------------------------------------------------  843
                                                                         
Sbjct 774  NARSYAALSQSAGQYSSQGLSLEEMKRSLQYTPIDKYGYVSDPMSSMHFHSCRNSSSFEDSS  835