Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08229
• Subject: XM_005273158.2
• Aligned Length: 2445
• Identities: 2138
• Gaps: 306

Alignment

Query    1  ATGGCGGGAGGGCACTGCGGCAGCTTCCCCGCGGCGGCGGCCGGCAGCGGCGAGATCGTCCAACTGAACGTAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGGACCAGATTTAGTACCTCAAGACAAACTCTTATGTGGATTCCAGATTCTTTTTTTTCCAGTTTGCTGAGTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGAGAATTTCAACACTTCGAGATGAAACTGGTGCTATATTTATTGATAGAGATCCAGCAGCATTTGCACCCATT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTAAATTTTCTTCGGACAAAAGAACTAGACTTAAGGGGAGTGAGTATTAATGTTCTCAGGCATGAAGCAGAATT  296
                                                                         |||        ||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------ATG--------TT  5

Query  297  TTACGGGATCACTCCATTAGTAAGAAGGCTTCTCTTATGTGAAGAATTGGAGCGTTCCTCTTGTGGCAGTGTCC  370
            |               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    6  T---------------TTAGTAAGAAGGCTTCTCTTATGTGAAGAATTGGAGCGTTCCTCTTGTGGCAGTGTCC  64

Query  371  TTTTTCATGGTTACTTGCCCCCACCAGGTATTCCTAGTCGTAAAATAAACAACACAGTCAGATCTGCTGATTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  TTTTTCATGGTTACTTGCCCCCACCAGGTATTCCTAGTCGTAAAATAAACAACACAGTCAGATCTGCTGATTCT  138

Query  445  AGGAATGGTCTAAATTCTACAGAAGGTGAAGCCCGGGGAAATGGTACACAGCCTGTTCTCTCTGGAACGGGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  AGGAATGGTCTAAATTCTACAGAAGGTGAAGCCCGGGGAAATGGTACACAGCCTGTTCTCTCTGGAACGGGAGA  212

Query  519  AGAAACTGTTAGGCTAGGATTTCCTGTGGATCCACGAAAGGTGCTAATAGTAGCTGGCCATCACAACTGGATTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGAAACTGTTAGGCTAGGATTTCCTGTGGATCCACGAAAGGTGCTAATAGTAGCTGGCCATCACAACTGGATTG  286

Query  593  TAGCTGCATATGCCCATTTTGCTGTGTGTTACAGAATCAAAGAATCTTCAGGATGGCAGCAAGTGTTTACGAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  TAGCTGCATATGCCCATTTTGCTGTGTGTTACAGAATCAAAGAATCTTCAGGATGGCAGCAAGTGTTTACGAGC  360

Query  667  CCATATTTGGATTGGACTATCGAACGAGTAGCTTTAAATGCAAAGGTGGTTGGAGGGCCACATGGAGACAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCATATTTGGATTGGACTATCGAACGAGTAGCTTTAAATGCAAAGGTGGTTGGAGGGCCACATGGAGACAAAGA  434

Query  741  CAAAATGGTTGCTGTTGCCTCAGAGAGTAGCATCATCTTGTGGAGTGTTCAGGATGGGGGAAGTGGAAGTGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  CAAAATGGTTGCTGTTGCCTCAGAGAGTAGCATCATCTTGTGGAGTGTTCAGGATGGGGGAAGTGGAAGTGAAA  508

Query  815  TTGGAGTGTTCAGCCTGGGTGTTCCTGTAGATGCTCTCTTCTTTATTGGTAACCAGTTGGTGGCCACGAGTCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  TTGGAGTGTTCAGCCTGGGTGTTCCTGTAGATGCTCTCTTCTTTATTGGTAACCAGTTGGTGGCCACGAGTCAT  582

Query  889  ACAGGGAAAGTGGGAGTGTGGAATGCTGTCACTCAGCACTGGCAGGTTCAAGATGTTGTTCCTATAACTAGTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  ACAGGGAAAGTGGGAGTGTGGAATGCTGTCACTCAGCACTGGCAGGTTCAAGATGTTGTTCCTATAACTAGTTA  656

Query  963  TGACACTGCTGGATCATTCCTTCTGCTTGGATGTAACAATGGATCAATATATTACATAGATATGCAGAAGTTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  TGACACTGCTGGATCATTCCTTCTGCTTGGATGTAACAATGGATCAATATATTACATAGATATGCAGAAGTTCC  730

Query 1037  CCTTGCGAATGAAAGATAATGATCTTCTTGTAACTGAACTGTATCATGATCCTTCAAATGATGCTATTACTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  CCTTGCGAATGAAAGATAATGATCTTCTTGTAACTGAACTGTATCATGATCCTTCAAATGATGCTATTACTGCT  804

Query 1111  CTGAGTGTTTACCTCACACCCAAAACAAGTGTCAGTGGTAACTGGATCGAGATCGCCTATGGTACGAGCTCTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  CTGAGTGTTTACCTCACACCCAAAACAAGTGTCAGTGGTAACTGGATCGAGATCGCCTATGGTACGAGCTCTGG  878

Query 1185  AGCAGTACGAGTGATTGTACAACACCCAGAGACAGTTGGGTCAGGTCCTCAGCTTTTTCAGACTTTCACAGTTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  AGCAGTACGAGTGATTGTACAACACCCAGAGACAGTTGGGTCAGGTCCTCAGCTTTTTCAGACTTTCACAGTTC  952

Query 1259  ACCGAAGTCCCGTAACAAAAATCATGCTATCAGAGAAGCATCTTGTATCAGTCTGTGCAGATAATAATCATGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  ACCGAAGTCCCGTAACAAAAATCATGCTATCAGAGAAGCATCTTGTATCAGTCTGTGCAGATAATAATCATGTC  1026

Query 1333  CGGACGTGGACAGTAACACGATTCAGAGGAATGATCTCTACTCAGCCAGGTTCTACTCCTTTAGCGTCATTCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  CGGACGTGGACAGTAACACGATTCAGAGGAATGATCTCTACTCAGCCAGGTTCTACTCCTTTAGCGTCATTCAA  1100

Query 1407  GATACTATCCCTGGAGGAGACAGAAAGTCATGGTAGCTATTCCTCTGGAAATGACATAGGACCTTTTGGAGAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  GATACTATCCCTGGAGGAGACAGAAAGTCATGGTAGCTATTCCTCTGGAAATGACATAGGACCTTTTGGAGAGC  1174

Query 1481  GAGACGATCAACAGGTGTTTATCCAGAAAGTTGTTCCCATCACCAACAAACTATTTGTAAGACTCTCATCGACT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  GAGACGATCAACAGGTGTTTATCCAGAAAGTTGTTCCCATCACCAACAAACTATTTGTAAGACTCTCATCGACT  1248

Query 1555  GGAAAAAGAATATGTGAGATCCAGGCTGTTGACTGTACTACAATATCCTCATTTACAGTGAGGGAATGTGAGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  GGAAAAAGAATATGTGAGATCCAGGCTGTTGACTGTACTACAATATCCTCATTTACAGTGAGGGAATGTGAGGG  1322

Query 1629  ATCCAGTAGGATGGGCTCAAGACCAAGGCGCTACTTGTTCACAGGCCATACAAATGGCAGTATTCAAATGTGGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  ATCCAGTAGGATGGGCTCAAGACCAAGGCGCTACTTGTTCACAGGCCATACAAATGGCAGTATTCAAATGTGGG  1396

Query 1703  ATCTGACCACTGCTATGGATATGGTTAACAAAAGTGAAGATAAGGATGTAGGTGGTCCAACCGAAGAAGAGCTA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  ATCTGACCACTGCTATGGATATGGTTAACAAAAGTGAAGATAAGGATGTAGGTGGTCCAACCGAAGAAGAGCTA  1470

Query 1777  CTCAAATTACTCGATCAATGTGATTTGAGCACATCTCGCTGTGCTACTCCTAACATCAGTCCAGCAACTTCCGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  CTCAAATTACTCGATCAATGTGATTTGAGCACATCTCGCTGTGCTACTCCTAACATCAGTCCAGCAACTTCCGT  1544

Query 1851  AGTTCAGCATAGCCACTTACGAGAATCAAATTCTAGCCTTCAGCTTCAGCACCATGATACCACCCATGAAGCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  AGTTCAGCATAGCCACTTACGAGAATCAAATTCTAGCCTTCAGCTTCAGCACCATGATACCACCCATGAAGCAG  1618

Query 1925  CTACTTACGGTTCCATGAGGCCTTACAGAGAAAGTCCTTTATTAGCAAGGGCAAGAAGGACTGAGAGCTTTCAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  CTACTTACGGTTCCATGAGGCCTTACAGAGAAAGTCCTTTATTAGCAAGGGCAAGAAGGACTGAGAGCTTTCAC  1692

Query 1999  AGTTATAGGGACTTCCAGACTATTAATTTGAACAGAAATGTAGAAAGAGCTGTCCCTGAAAATGGTAACTTGGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  AGTTATAGGGACTTCCAGACTATTAATTTGAACAGAAATGTAGAAAGAGCTGTCCCTGAAAATGGTAACTTGGG  1766

Query 2073  TCCAATACAAGCTGAAGTGAAAGGGGCAACAGGGGAATGTAATATATCTGAGAGAAAGTCTCCTGGAGTAGAAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767  TCCAATACAAGCTGAAGTGAAAGGGGCAACAGGGGAATGTAATATATCTGAGAGAAAGTCTCCTGGAGTAGAAA  1840

Query 2147  TAAAAAGTTTGAGAGAATTGGATAGTGGATTGGAAGTGCATAAAATAGCTGAAGGTTTTTCAGAATCCAAGAAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  TAAAAAGTTTGAGAGAATTGGATAGTGGATTGGAAGTGCATAAAATAGCTGAAGGTTTTTCAGAATCCAAGAAA  1914

Query 2221  AGGTCATCAGAAGATGAAAATGAAAATAAAATAGAGTTTAGGAAGAAAGGAGGATTTGAAGGGGGAGGATTCCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  AGGTCATCAGAAGATGAAAATGAAAATAAAATAGAGTTTAGGAAGAAAGGAGGATTTGAAGGGGGAGGATTCCT  1988

Query 2295  TGGAAGAAAGAAAGTTCCCTATCTGGCATCATCACCAAGTACTTCCGATGGAGGAACTGACTCACCTGGTACTG  2368
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  TGGAAGAAAGAAAGTTCCCTATCTGGCGTCATCACCAAGTACTTCCGATGGAGGAACTGACTCACCTGGTACTG  2062

Query 2369  CGTCCCCATCTCCTACAAAGACTACTCCATCTCCTCGGCATAAAAAAAGTGATTCTTCAGGTCAGGAGTACAGC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  CGTCCCCATCTCCTACAAAGACTACTCCATCTCCTCGGCATAAAAAAAGTGATTCTTCAGGTCAGGAGTACAGC  2136

Query 2443  TTG  2445
            |||
Sbjct 2137  TTG  2139